MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008258	TG	3	6	1109906	1109911	0 %	50 %	50 %	0 %	110805058
18502	NC_008258	ACC	2	6	1110001	1110006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805058
18503	NC_008258	TGC	2	6	1110057	1110062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805058
18504	NC_008258	CAG	2	6	1110086	1110091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805058
18505	NC_008258	T	6	6	1110165	1110170	0 %	100 %	0 %	0 %	110805058
18506	NC_008258	TGA	2	6	1110188	1110193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805058
18507	NC_008258	ACA	2	6	1110194	1110199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805058
18508	NC_008258	GGGCG	2	10	1110358	1110367	0 %	0 %	80 %	20 %	110805059
18509	NC_008258	TCCG	2	8	1110370	1110377	0 %	25 %	25 %	50 %	110805059
18510	NC_008258	CCG	2	6	1110413	1110418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805059
18511	NC_008258	TCA	2	6	1110488	1110493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805059
18512	NC_008258	AGA	2	6	1110507	1110512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805059
18513	NC_008258	AAG	2	6	1110539	1110544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805059
18514	NC_008258	GCA	2	6	1110562	1110567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805059
18515	NC_008258	TCT	2	6	1110611	1110616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805059
18516	NC_008258	A	7	7	1110622	1110628	100 %	0 %	0 %	0 %	110805059
18517	NC_008258	CTT	2	6	1110668	1110673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805059
18518	NC_008258	GTTTAC	2	12	1110684	1110695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	110805059
18519	NC_008258	CAG	3	9	1110818	1110826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805060
18520	NC_008258	CAG	2	6	1110833	1110838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805060
18521	NC_008258	AAC	2	6	1110987	1110992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805060
18522	NC_008258	AG	3	6	1111048	1111053	50 %	0 %	50 %	0 %	110805060
18523	NC_008258	GAA	2	6	1111075	1111080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805060
18524	NC_008258	GAA	2	6	1111126	1111131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805060
18525	NC_008258	ATT	2	6	1111275	1111280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805060
18526	NC_008258	GAA	2	6	1111290	1111295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805060
18527	NC_008258	AAG	2	6	1111485	1111490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805060
18528	NC_008258	TGG	2	6	1111515	1111520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805060
18529	NC_008258	TGA	2	6	1111623	1111628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805060
18530	NC_008258	TTG	2	6	1111673	1111678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805060
18531	NC_008258	TGCT	2	8	1111715	1111722	0 %	50 %	25 %	25 %	110805060
18532	NC_008258	AGG	2	6	1111758	1111763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110805060
18533	NC_008258	TAA	2	6	1111809	1111814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805060
18534	NC_008258	TTC	2	6	1111836	1111841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805060
18535	NC_008258	GGT	2	6	1111843	1111848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805060
18536	NC_008258	TAAA	2	8	1111853	1111860	75 %	25 %	0 %	0 %	110805060
18537	NC_008258	AGC	2	6	1111923	1111928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805060
18538	NC_008258	ATCA	2	8	1111946	1111953	50 %	25 %	0 %	25 %	110805060
18539	NC_008258	AAAC	2	8	1111967	1111974	75 %	0 %	0 %	25 %	110805060
18540	NC_008258	CAAAT	2	10	1112009	1112018	60 %	20 %	0 %	20 %	110805060
18541	NC_008258	TAA	2	6	1112076	1112081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805060
18542	NC_008258	AC	3	6	1112123	1112128	50 %	0 %	0 %	50 %	110805060
18543	NC_008258	GAA	2	6	1112204	1112209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805060
18544	NC_008258	CAG	2	6	1112225	1112230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805060
18545	NC_008258	AAG	2	6	1112236	1112241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805060
18546	NC_008258	TCTT	2	8	1112293	1112300	0 %	75 %	0 %	25 %	110805060
18547	NC_008258	TCAA	2	8	1112306	1112313	50 %	25 %	0 %	25 %	110805060
18548	NC_008258	GAA	2	6	1112368	1112373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805060
18549	NC_008258	ATC	2	6	1112492	1112497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805061
18550	NC_008258	ATA	2	6	1112513	1112518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805061
18551	NC_008258	TTCTGC	2	12	1112525	1112536	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	110805061
18552	NC_008258	TCG	2	6	1112567	1112572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805061
18553	NC_008258	CCAC	2	8	1112587	1112594	25 %	0 %	0 %	75 %	110805061
18554	NC_008258	TG	3	6	1112751	1112756	0 %	50 %	50 %	0 %	110805061
18555	NC_008258	ATAC	2	8	1112767	1112774	50 %	25 %	0 %	25 %	110805061
18556	NC_008258	ATG	2	6	1112913	1112918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805061
18557	NC_008258	GTAA	2	8	1112954	1112961	50 %	25 %	25 %	0 %	110805061
18558	NC_008258	CCAC	2	8	1112968	1112975	25 %	0 %	0 %	75 %	110805061
18559	NC_008258	CAT	2	6	1113361	1113366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805062
18560	NC_008258	T	6	6	1113366	1113371	0 %	100 %	0 %	0 %	110805062
18561	NC_008258	GCG	2	6	1113435	1113440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805062
18562	NC_008258	GGT	2	6	1113489	1113494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805062
18563	NC_008258	A	7	7	1114124	1114130	100 %	0 %	0 %	0 %	110805063
18564	NC_008258	GCC	2	6	1114202	1114207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805063
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18566	NC_008258	TGA	2	6	1114261	1114266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805063
18567	NC_008258	A	6	6	1114372	1114377	100 %	0 %	0 %	0 %	110805063
18568	NC_008258	GTG	2	6	1114789	1114794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805064
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18570	NC_008258	TGGGC	2	10	1114875	1114884	0 %	20 %	60 %	20 %	110805064
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18573	NC_008258	GCAG	2	8	1115001	1115008	25 %	0 %	50 %	25 %	110805064
18574	NC_008258	CAGA	2	8	1115038	1115045	50 %	0 %	25 %	25 %	110805064
18575	NC_008258	CTG	2	6	1115065	1115070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805064
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18582	NC_008258	CAG	2	6	1115929	1115934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805065
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18584	NC_008258	AGGA	2	8	1116023	1116030	50 %	0 %	50 %	0 %	110805065
18585	NC_008258	CTG	2	6	1116038	1116043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805065
18586	NC_008258	GCC	2	6	1116046	1116051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805065
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18588	NC_008258	TGC	2	6	1116081	1116086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805065
18589	NC_008258	CTC	2	6	1116148	1116153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110805065
18590	NC_008258	AAG	2	6	1116155	1116160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805065
18591	NC_008258	A	6	6	1116180	1116185	100 %	0 %	0 %	0 %	110805065
18592	NC_008258	TGGA	2	8	1116297	1116304	25 %	25 %	50 %	0 %	162139350
18593	NC_008258	GCC	2	6	1116307	1116312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162139350
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18601	NC_008258	GA	4	8	1116607	1116614	50 %	0 %	50 %	0 %	162139350
18602	NC_008258	CTG	2	6	1116638	1116643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139350
18603	NC_008258	GCACT	2	10	1116654	1116663	20 %	20 %	20 %	40 %	162139350
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18607	NC_008258	AGTGG	2	10	1116761	1116770	20 %	20 %	60 %	0 %	162139350
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18611	NC_008258	GCA	2	6	1116951	1116956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139350
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18614	NC_008258	A	6	6	1117805	1117810	100 %	0 %	0 %	0 %	110805067
18615	NC_008258	TTAC	2	8	1118215	1118222	25 %	50 %	0 %	25 %	110805068
18616	NC_008258	TCA	2	6	1118256	1118261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805068
18617	NC_008258	GTAT	2	8	1118401	1118408	25 %	50 %	25 %	0 %	110805068
18618	NC_008258	AC	3	6	1118418	1118423	50 %	0 %	0 %	50 %	110805068
18619	NC_008258	GTGG	2	8	1118581	1118588	0 %	25 %	75 %	0 %	110805069
18620	NC_008258	CGA	2	6	1118603	1118608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805069
18621	NC_008258	GCAGAA	2	12	1118639	1118650	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	110805069
18622	NC_008258	TTA	2	6	1118656	1118661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805069
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18727	NC_008258	GCA	2	6	1125508	1125513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805078
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18731	NC_008258	TACG	2	8	1125762	1125769	25 %	25 %	25 %	25 %	110805078
18732	NC_008258	T	6	6	1125829	1125834	0 %	100 %	0 %	0 %	110805078
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18734	NC_008258	CTTC	2	8	1125930	1125937	0 %	50 %	0 %	50 %	110805078
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18851	NC_008258	GGC	2	6	1133164	1133169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805086
18852	NC_008258	CT	3	6	1133175	1133180	0 %	50 %	0 %	50 %	110805086
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18965	NC_008258	CTG	2	6	1140369	1140374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805094
18966	NC_008258	CAA	2	6	1140592	1140597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805095
18967	NC_008258	GC	3	6	1140634	1140639	0 %	0 %	50 %	50 %	110805095
18968	NC_008258	ACC	2	6	1140701	1140706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805095
18969	NC_008258	AGGGC	2	10	1140817	1140826	20 %	0 %	60 %	20 %	110805095
18970	NC_008258	TCA	2	6	1140854	1140859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805095
18971	NC_008258	TGG	2	6	1140916	1140921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805095
18972	NC_008258	CAGC	2	8	1140932	1140939	25 %	0 %	25 %	50 %	110805095
18973	NC_008258	CAA	2	6	1141004	1141009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805095
18974	NC_008258	CAC	2	6	1141048	1141053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805095
18975	NC_008258	ATGA	2	8	1141058	1141065	50 %	25 %	25 %	0 %	110805095
18976	NC_008258	TCC	2	6	1141112	1141117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110805095
18977	NC_008258	CGAA	2	8	1141125	1141132	50 %	0 %	25 %	25 %	110805095
18978	NC_008258	CTG	2	6	1141160	1141165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805095
18979	NC_008258	GAA	2	6	1141205	1141210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805095
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18981	NC_008258	TGC	2	6	1141281	1141286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805095
18982	NC_008258	GAT	2	6	1141349	1141354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805096
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18984	NC_008258	TTG	2	6	1141398	1141403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805096
18985	NC_008258	CGC	2	6	1141441	1141446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805096
18986	NC_008258	TCG	2	6	1141562	1141567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805096
18987	NC_008258	CTC	2	6	1141631	1141636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110805096
18988	NC_008258	GGT	2	6	1141740	1141745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805096
18989	NC_008258	TGACGG	2	12	1141801	1141812	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110805096
18990	NC_008258	TGG	2	6	1141846	1141851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805096
18991	NC_008258	GCA	2	6	1141930	1141935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805096
18992	NC_008258	TACCG	2	10	1141937	1141946	20 %	20 %	20 %	40 %	110805096
18993	NC_008258	TTC	2	6	1142031	1142036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805096
18994	NC_008258	TC	3	6	1142080	1142085	0 %	50 %	0 %	50 %	110805097
18995	NC_008258	TTC	2	6	1142094	1142099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805097
18996	NC_008258	ACG	2	6	1142108	1142113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805097
18997	NC_008258	CA	3	6	1142242	1142247	50 %	0 %	0 %	50 %	110805097
18998	NC_008258	TAA	2	6	1142254	1142259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805097
18999	NC_008258	A	6	6	1142311	1142316	100 %	0 %	0 %	0 %	110805097
19000	NC_008258	TCC	2	6	1142347	1142352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110805097

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