MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008258	GAT	2	6	1069304	1069309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805027
18002	NC_008258	GCC	2	6	1069406	1069411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805027
18003	NC_008258	CCA	2	6	1069438	1069443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805027
18004	NC_008258	TGC	2	6	1069458	1069463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805027
18005	NC_008258	TCA	2	6	1069504	1069509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805027
18006	NC_008258	CCT	2	6	1069515	1069520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110805028
18007	NC_008258	AG	3	6	1069531	1069536	50 %	0 %	50 %	0 %	110805028
18008	NC_008258	ATC	2	6	1069600	1069605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805028
18009	NC_008258	GC	3	6	1069660	1069665	0 %	0 %	50 %	50 %	110805028
18010	NC_008258	CCG	2	6	1069710	1069715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805028
18011	NC_008258	TCG	2	6	1069850	1069855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805028
18012	NC_008258	ACA	2	6	1069878	1069883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805028
18013	NC_008258	TCAT	2	8	1070087	1070094	25 %	50 %	0 %	25 %	110805028
18014	NC_008258	A	6	6	1070099	1070104	100 %	0 %	0 %	0 %	110805028
18015	NC_008258	GCA	2	6	1070145	1070150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805028
18016	NC_008258	ACG	2	6	1070179	1070184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805028
18017	NC_008258	GCCAG	2	10	1070200	1070209	20 %	0 %	40 %	40 %	110805028
18018	NC_008258	GCCA	2	8	1070238	1070245	25 %	0 %	25 %	50 %	110805028
18019	NC_008258	CGCC	2	8	1070267	1070274	0 %	0 %	25 %	75 %	110805028
18020	NC_008258	CGA	2	6	1070307	1070312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805028
18021	NC_008258	GCA	2	6	1070336	1070341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805028
18022	NC_008258	GCC	2	6	1070431	1070436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805028
18023	NC_008258	ATC	2	6	1070453	1070458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805028
18024	NC_008258	CGAAAT	2	12	1070466	1070477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110805028
18025	NC_008258	GCG	2	6	1070535	1070540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805028
18026	NC_008258	AGCC	2	8	1070555	1070562	25 %	0 %	25 %	50 %	110805028
18027	NC_008258	GTT	2	6	1070563	1070568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805028
18028	NC_008258	TCA	3	9	1070595	1070603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805028
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18030	NC_008258	CG	3	6	1070923	1070928	0 %	0 %	50 %	50 %	110805029
18031	NC_008258	GAA	2	6	1070939	1070944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805029
18032	NC_008258	A	6	6	1070943	1070948	100 %	0 %	0 %	0 %	110805029
18033	NC_008258	GCA	2	6	1070961	1070966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805029
18034	NC_008258	CTG	2	6	1071048	1071053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805029
18035	NC_008258	TGC	2	6	1071091	1071096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805029
18036	NC_008258	CTGG	2	8	1071113	1071120	0 %	25 %	50 %	25 %	110805029
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18038	NC_008258	GC	3	6	1071250	1071255	0 %	0 %	50 %	50 %	110805029
18039	NC_008258	GTT	2	6	1071257	1071262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805029
18040	NC_008258	TGA	2	6	1071299	1071304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805029
18041	NC_008258	GCA	2	6	1071362	1071367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805029
18042	NC_008258	TCAA	2	8	1071466	1071473	50 %	25 %	0 %	25 %	110805029
18043	NC_008258	ATT	3	9	1071495	1071503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805029
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18045	NC_008258	GCAC	2	8	1071922	1071929	25 %	0 %	25 %	50 %	110805030
18046	NC_008258	ATG	2	6	1072011	1072016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805030
18047	NC_008258	CTT	2	6	1072024	1072029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805030
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18050	NC_008258	GTA	2	6	1072064	1072069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805030
18051	NC_008258	TCA	2	6	1072135	1072140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805030
18052	NC_008258	TTC	2	6	1072148	1072153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805030
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18054	NC_008258	GAC	2	6	1072216	1072221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805030
18055	NC_008258	CGG	2	6	1072317	1072322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805030
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18057	NC_008258	CTTC	2	8	1072362	1072369	0 %	50 %	0 %	50 %	110805030
18058	NC_008258	TGC	2	6	1072370	1072375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805030
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18062	NC_008258	TG	3	6	1072559	1072564	0 %	50 %	50 %	0 %	110805030
18063	NC_008258	ACC	2	6	1072654	1072659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805030
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18351	NC_008258	TAA	2	6	1098515	1098520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805050
18352	NC_008258	A	6	6	1098547	1098552	100 %	0 %	0 %	0 %	110805050
18353	NC_008258	TAA	2	6	1098817	1098822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805051
18354	NC_008258	CCG	2	6	1098958	1098963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805051
18355	NC_008258	GCTG	2	8	1098998	1099005	0 %	25 %	50 %	25 %	110805051
18356	NC_008258	AT	3	6	1099066	1099071	50 %	50 %	0 %	0 %	110805051
18357	NC_008258	A	7	7	1099073	1099079	100 %	0 %	0 %	0 %	110805051
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18468	NC_008258	TGT	2	6	1107935	1107940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805057
18469	NC_008258	CGG	2	6	1107996	1108001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805057
18470	NC_008258	TGC	2	6	1108025	1108030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805057
18471	NC_008258	TGC	2	6	1108049	1108054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805057
18472	NC_008258	GTG	2	6	1108117	1108122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805057
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18481	NC_008258	TTC	2	6	1108671	1108676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805057
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18492	NC_008258	TGT	2	6	1109518	1109523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805058
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18494	NC_008258	CGG	2	6	1109664	1109669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805058
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18496	NC_008258	CTTC	2	8	1109709	1109716	0 %	50 %	0 %	50 %	110805058
18497	NC_008258	TGC	2	6	1109717	1109722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805058
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