MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_008258	AATGT	2	10	1042382	1042391	40 %	40 %	20 %	0 %	110804997
17503	NC_008258	CCA	2	6	1042478	1042483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804998
17504	NC_008258	ACC	2	6	1042508	1042513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804998
17505	NC_008258	GCGGTT	2	12	1042516	1042527	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110804998
17506	NC_008258	TCA	2	6	1042539	1042544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804998
17507	NC_008258	GCC	2	6	1042582	1042587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804998
17508	NC_008258	GCC	2	6	1042622	1042627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804998
17509	NC_008258	CGC	2	6	1042644	1042649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804998
17510	NC_008258	TCA	2	6	1042719	1042724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804998
17511	NC_008258	CGG	2	6	1042741	1042746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804998
17512	NC_008258	AAT	2	6	1042782	1042787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804998
17513	NC_008258	CAT	2	6	1042798	1042803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804998
17514	NC_008258	GCT	2	6	1042818	1042823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804998
17515	NC_008258	AAG	2	6	1042876	1042881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804998
17516	NC_008258	GTT	2	6	1042978	1042983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804998
17517	NC_008258	TGCG	2	8	1043018	1043025	0 %	25 %	50 %	25 %	110804998
17518	NC_008258	GTT	2	6	1043080	1043085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804998
17519	NC_008258	TCA	2	6	1043108	1043113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804998
17520	NC_008258	AGC	2	6	1043114	1043119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804998
17521	NC_008258	GGT	2	6	1043121	1043126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804998
17522	NC_008258	GCC	2	6	1043188	1043193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804998
17523	NC_008258	TCT	2	6	1043276	1043281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804998
17524	NC_008258	GTT	3	9	1043292	1043300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804998
17525	NC_008258	GGCT	2	8	1043349	1043356	0 %	25 %	50 %	25 %	110804998
17526	NC_008258	TCT	2	6	1043412	1043417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804998
17527	NC_008258	GTG	2	6	1043591	1043596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804998
17528	NC_008258	AGGGC	2	10	1043654	1043663	20 %	0 %	60 %	20 %	110804998
17529	NC_008258	TGAGGT	2	12	1043727	1043738	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	110804998
17530	NC_008258	TTG	2	6	1043822	1043827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804998
17531	NC_008258	CGT	2	6	1043829	1043834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804998
17532	NC_008258	GCC	2	6	1043881	1043886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804998
17533	NC_008258	GCTT	2	8	1044056	1044063	0 %	50 %	25 %	25 %	110804998
17534	NC_008258	CCA	2	6	1044069	1044074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804998
17535	NC_008258	CAAA	2	8	1044087	1044094	75 %	0 %	0 %	25 %	110804998
17536	NC_008258	CTT	2	6	1044147	1044152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804998
17537	NC_008258	CGC	2	6	1044201	1044206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804998
17538	NC_008258	GC	3	6	1044358	1044363	0 %	0 %	50 %	50 %	110804998
17539	NC_008258	CAA	2	6	1044376	1044381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804998
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17541	NC_008258	CGA	2	6	1044406	1044411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804998
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17543	NC_008258	TCAG	2	8	1044504	1044511	25 %	25 %	25 %	25 %	110804998
17544	NC_008258	GCTG	2	8	1044599	1044606	0 %	25 %	50 %	25 %	110804999
17545	NC_008258	GGT	2	6	1044613	1044618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804999
17546	NC_008258	CGA	2	6	1044653	1044658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804999
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17549	NC_008258	ATTGAG	2	12	1044918	1044929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804999
17550	NC_008258	CTG	2	6	1044933	1044938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804999
17551	NC_008258	GCC	2	6	1044958	1044963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804999
17552	NC_008258	TCG	2	6	1044967	1044972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804999
17553	NC_008258	AAGC	2	8	1044992	1044999	50 %	0 %	25 %	25 %	110804999
17554	NC_008258	CGC	2	6	1045041	1045046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804999
17555	NC_008258	CCA	2	6	1045071	1045076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804999
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17558	NC_008258	CG	3	6	1045513	1045518	0 %	0 %	50 %	50 %	110805000
17559	NC_008258	GCCC	2	8	1045563	1045570	0 %	0 %	25 %	75 %	110805000
17560	NC_008258	CAG	2	6	1045586	1045591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805000
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17598	NC_008258	A	6	6	1048683	1048688	100 %	0 %	0 %	0 %	110805006
17599	NC_008258	AAG	2	6	1048716	1048721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805006
17600	NC_008258	A	6	6	1048749	1048754	100 %	0 %	0 %	0 %	110805006
17601	NC_008258	ATG	2	6	1048773	1048778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805006
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17603	NC_008258	CCAG	2	8	1048982	1048989	25 %	0 %	25 %	50 %	110805007
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17605	NC_008258	TGC	2	6	1049012	1049017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805007
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17607	NC_008258	T	6	6	1049142	1049147	0 %	100 %	0 %	0 %	110805007
17608	NC_008258	CGA	2	6	1049184	1049189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805007
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17614	NC_008258	CCAG	2	8	1049470	1049477	25 %	0 %	25 %	50 %	110805007
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