MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_008258	GTC	2	6	960296	960301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804924
16003	NC_008258	A	6	6	960434	960439	100 %	0 %	0 %	0 %	110804924
16004	NC_008258	TGG	2	6	960571	960576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804924
16005	NC_008258	TTTA	2	8	960609	960616	25 %	75 %	0 %	0 %	110804924
16006	NC_008258	GGTGAT	2	12	960627	960638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	110804924
16007	NC_008258	GAT	2	6	960697	960702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804924
16008	NC_008258	ATC	2	6	960736	960741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804924
16009	NC_008258	TGGC	2	8	960787	960794	0 %	25 %	50 %	25 %	110804924
16010	NC_008258	GGC	2	6	960825	960830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804924
16011	NC_008258	CAG	2	6	960853	960858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804924
16012	NC_008258	TGC	2	6	960914	960919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804924
16013	NC_008258	TGT	2	6	960990	960995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804924
16014	NC_008258	AGC	2	6	961016	961021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804924
16015	NC_008258	ATT	2	6	961095	961100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804924
16016	NC_008258	TC	3	6	961169	961174	0 %	50 %	0 %	50 %	110804924
16017	NC_008258	TGC	2	6	961208	961213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804924
16018	NC_008258	GCA	2	6	961254	961259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804924
16019	NC_008258	CTGG	2	8	961316	961323	0 %	25 %	50 %	25 %	110804924
16020	NC_008258	ATC	2	6	961400	961405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804925
16021	NC_008258	TGCC	2	8	961422	961429	0 %	25 %	25 %	50 %	110804925
16022	NC_008258	CTG	2	6	961556	961561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804925
16023	NC_008258	ATT	2	6	961590	961595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804926
16024	NC_008258	CG	3	6	961598	961603	0 %	0 %	50 %	50 %	110804926
16025	NC_008258	CG	4	8	961680	961687	0 %	0 %	50 %	50 %	110804926
16026	NC_008258	CAT	2	6	961706	961711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804926
16027	NC_008258	ATG	3	9	961726	961734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804926
16028	NC_008258	GTAT	2	8	961767	961774	25 %	50 %	25 %	0 %	110804926
16029	NC_008258	CG	3	6	961777	961782	0 %	0 %	50 %	50 %	110804926
16030	NC_008258	ATC	2	6	961786	961791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804926
16031	NC_008258	CGA	2	6	961841	961846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804926
16032	NC_008258	TGA	2	6	961871	961876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804926
16033	NC_008258	GAT	2	6	961880	961885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804926
16034	NC_008258	GAA	2	6	961974	961979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804926
16035	NC_008258	CCA	2	6	962047	962052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804926
16036	NC_008258	GATCGT	2	12	962061	962072	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110804926
16037	NC_008258	CGT	2	6	962151	962156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804926
16038	NC_008258	GGCA	2	8	962167	962174	25 %	0 %	50 %	25 %	110804926
16039	NC_008258	AGC	2	6	962203	962208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804926
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16041	NC_008258	TGTTGC	2	12	962240	962251	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	110804926
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16044	NC_008258	AAG	2	6	962669	962674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804927
16045	NC_008258	TGA	2	6	962707	962712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804927
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16048	NC_008258	CTGGC	2	10	962838	962847	0 %	20 %	40 %	40 %	110804927
16049	NC_008258	CGT	2	6	962870	962875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804927
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16052	NC_008258	GCA	2	6	963082	963087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804927
16053	NC_008258	CG	3	6	963225	963230	0 %	0 %	50 %	50 %	110804927
16054	NC_008258	GGC	2	6	963253	963258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804927
16055	NC_008258	GTTG	2	8	963259	963266	0 %	50 %	50 %	0 %	110804927
16056	NC_008258	GCG	2	6	963473	963478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804928
16057	NC_008258	CTG	2	6	963528	963533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804928
16058	NC_008258	A	6	6	963534	963539	100 %	0 %	0 %	0 %	110804928
16059	NC_008258	ATC	2	6	963541	963546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804928
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16062	NC_008258	CG	3	6	963665	963670	0 %	0 %	50 %	50 %	110804928
16063	NC_008258	ACC	2	6	963861	963866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804928
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16477	NC_008258	ACC	3	9	986226	986234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804942
16478	NC_008258	CAC	2	6	986244	986249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804942
16479	NC_008258	CAA	2	6	986334	986339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804942
16480	NC_008258	CCT	2	6	986380	986385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804943
16481	NC_008258	GC	3	6	986434	986439	0 %	0 %	50 %	50 %	110804943
16482	NC_008258	AAT	2	6	986474	986479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804943
16483	NC_008258	ACC	2	6	986487	986492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804943
16484	NC_008258	CAA	2	6	986566	986571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804943
16485	NC_008258	ACGC	2	8	986603	986610	25 %	0 %	25 %	50 %	110804943
16486	NC_008258	AGGGC	2	10	986623	986632	20 %	0 %	60 %	20 %	110804943
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16489	NC_008258	ATGCC	2	10	986721	986730	20 %	20 %	20 %	40 %	110804943
16490	NC_008258	CCA	2	6	986767	986772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804943
16491	NC_008258	TCA	2	6	986790	986795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804943
16492	NC_008258	CAG	2	6	986870	986875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804943
16493	NC_008258	TGC	2	6	986979	986984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804943
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16495	NC_008258	TGC	2	6	987132	987137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804944
16496	NC_008258	CT	3	6	987199	987204	0 %	50 %	0 %	50 %	110804944
16497	NC_008258	CCG	2	6	987233	987238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804944
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16499	NC_008258	CCACT	2	10	987318	987327	20 %	20 %	0 %	60 %	110804944
16500	NC_008258	GAC	2	6	987331	987336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804944

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