MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15503	NC_008258	TGG	2	6	929966	929971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804896
15504	NC_008258	CGT	2	6	929988	929993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804896
15505	NC_008258	GAT	2	6	930003	930008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804896
15506	NC_008258	GT	3	6	930014	930019	0 %	50 %	50 %	0 %	110804896
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15508	NC_008258	CTG	2	6	930085	930090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804896
15509	NC_008258	TGG	2	6	930113	930118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804896
15510	NC_008258	GCA	2	6	930177	930182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804896
15511	NC_008258	CAC	2	6	930266	930271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804896
15512	NC_008258	CTA	2	6	930301	930306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804896
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15514	NC_008258	TCA	2	6	930470	930475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804897
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15516	NC_008258	TCA	2	6	930575	930580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804897
15517	NC_008258	CTT	2	6	930677	930682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804897
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15520	NC_008258	TGG	2	6	930890	930895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804897
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15528	NC_008258	TGGCG	2	10	931671	931680	0 %	20 %	60 %	20 %	110804898
15529	NC_008258	GTT	2	6	931718	931723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804898
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15531	NC_008258	TGCT	2	8	931770	931777	0 %	50 %	25 %	25 %	110804898
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15552	NC_008258	ACTG	2	8	933313	933320	25 %	25 %	25 %	25 %	110804899
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15565	NC_008258	GAAA	2	8	934304	934311	75 %	0 %	25 %	0 %	110804901
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15568	NC_008258	TTAC	2	8	935029	935036	25 %	50 %	0 %	25 %	110804903
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15572	NC_008258	GTGG	2	8	935396	935403	0 %	25 %	75 %	0 %	110804903
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15585	NC_008258	TTCCAT	2	12	936220	936231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	110804905
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15587	NC_008258	GTG	2	6	936263	936268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804905
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15611	NC_008258	AT	3	6	938400	938405	50 %	50 %	0 %	0 %	110804908
15612	NC_008258	A	7	7	938407	938413	100 %	0 %	0 %	0 %	110804908
15613	NC_008258	CGG	2	6	938635	938640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804909
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15617	NC_008258	CA	3	6	938856	938861	50 %	0 %	0 %	50 %	110804909
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15853	NC_008258	GTAA	2	8	951749	951756	50 %	25 %	25 %	0 %	110804917
15854	NC_008258	TTA	2	6	951948	951953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804918
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15977	NC_008258	CTGG	2	8	959286	959293	0 %	25 %	50 %	25 %	110804923
15978	NC_008258	TGG	2	6	959346	959351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804923
15979	NC_008258	ACC	2	6	959389	959394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804923
15980	NC_008258	TGA	2	6	959409	959414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804923
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15982	NC_008258	ATC	2	6	959515	959520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804923
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15985	NC_008258	CGG	2	6	959618	959623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804923
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15991	NC_008258	TG	3	6	959837	959842	0 %	50 %	50 %	0 %	110804923
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16000	NC_008258	TGC	2	6	960239	960244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804924

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