MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_008258	GGC	2	6	808411	808416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804795
13503	NC_008258	GCG	2	6	808436	808441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804795
13504	NC_008258	TTC	2	6	808453	808458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804795
13505	NC_008258	C	6	6	808621	808626	0 %	0 %	0 %	100 %	110804795
13506	NC_008258	GGC	2	6	808692	808697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804795
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13509	NC_008258	T	6	6	808768	808773	0 %	100 %	0 %	0 %	110804795
13510	NC_008258	TTC	2	6	808857	808862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804796
13511	NC_008258	GGC	2	6	808989	808994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804796
13512	NC_008258	GGT	2	6	809048	809053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804796
13513	NC_008258	GA	3	6	809066	809071	50 %	0 %	50 %	0 %	110804796
13514	NC_008258	GCT	2	6	809072	809077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804796
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13517	NC_008258	TCT	2	6	809281	809286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804796
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13519	NC_008258	GGC	2	6	809334	809339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804796
13520	NC_008258	GTG	2	6	809350	809355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804796
13521	NC_008258	GCA	2	6	809392	809397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804796
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13544	NC_008258	CGT	2	6	810626	810631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804797
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13568	NC_008258	TGG	2	6	811910	811915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804798
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13599	NC_008258	ACT	2	6	813720	813725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804798
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13601	NC_008258	A	6	6	813791	813796	100 %	0 %	0 %	0 %	110804798
13602	NC_008258	CGG	2	6	813814	813819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804798
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13604	NC_008258	CG	4	8	813900	813907	0 %	0 %	50 %	50 %	110804800
13605	NC_008258	GC	3	6	813925	813930	0 %	0 %	50 %	50 %	110804800
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13979	NC_008258	TGCGAC	2	12	838665	838676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110804820
13980	NC_008258	GAA	2	6	838721	838726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804820
13981	NC_008258	GCGGTT	2	12	838760	838771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110804820
13982	NC_008258	GCT	2	6	838867	838872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804820
13983	NC_008258	CTG	2	6	839000	839005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804820
13984	NC_008258	GCT	2	6	839052	839057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804820
13985	NC_008258	GGCA	2	8	839066	839073	25 %	0 %	50 %	25 %	110804820
13986	NC_008258	GC	3	6	839303	839308	0 %	0 %	50 %	50 %	110804821
13987	NC_008258	ATT	2	6	839316	839321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804821
13988	NC_008258	ATC	2	6	839322	839327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804821
13989	NC_008258	GCA	2	6	839362	839367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804821
13990	NC_008258	AAT	2	6	839508	839513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804821
13991	NC_008258	CGT	2	6	839636	839641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804821
13992	NC_008258	TTGC	2	8	839835	839842	0 %	50 %	25 %	25 %	110804821
13993	NC_008258	TGGT	2	8	839997	840004	0 %	50 %	50 %	0 %	110804821
13994	NC_008258	CGT	2	6	840017	840022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804821
13995	NC_008258	GAT	2	6	840238	840243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804822
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13997	NC_008258	GAA	2	6	840274	840279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804822
13998	NC_008258	T	6	6	840331	840336	0 %	100 %	0 %	0 %	110804822
13999	NC_008258	CAG	2	6	840343	840348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804822
14000	NC_008258	TGT	2	6	840366	840371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804822

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