MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_008258	GGC	2	6	686853	686858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804682
11503	NC_008258	GGA	2	6	686863	686868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804682
11504	NC_008258	CTG	2	6	686905	686910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804682
11505	NC_008258	GCC	2	6	686960	686965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804682
11506	NC_008258	TGG	2	6	687066	687071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804682
11507	NC_008258	TGG	2	6	687219	687224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804682
11508	NC_008258	GCG	2	6	687381	687386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804682
11509	NC_008258	TTA	2	6	687515	687520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804682
11510	NC_008258	TTCG	2	8	687538	687545	0 %	50 %	25 %	25 %	110804682
11511	NC_008258	GCA	2	6	687590	687595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804682
11512	NC_008258	CAG	2	6	687615	687620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804682
11513	NC_008258	GGTT	2	8	687669	687676	0 %	50 %	50 %	0 %	110804682
11514	NC_008258	CCG	2	6	687737	687742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804682
11515	NC_008258	TCG	2	6	687755	687760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804682
11516	NC_008258	GCCAGC	2	12	687827	687838	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110804682
11517	NC_008258	TAC	2	6	687840	687845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804682
11518	NC_008258	GGC	2	6	688520	688525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804683
11519	NC_008258	ATC	2	6	688650	688655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804683
11520	NC_008258	GCA	2	6	688657	688662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804683
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11522	NC_008258	TGG	2	6	688811	688816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804683
11523	NC_008258	CTT	2	6	688883	688888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804683
11524	NC_008258	CTT	2	6	688922	688927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804683
11525	NC_008258	CGAT	2	8	688942	688949	25 %	25 %	25 %	25 %	110804683
11526	NC_008258	TTCGCC	2	12	689025	689036	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	110804683
11527	NC_008258	GC	3	6	689083	689088	0 %	0 %	50 %	50 %	110804683
11528	NC_008258	ACG	3	9	689211	689219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804683
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11532	NC_008258	CAC	2	6	689491	689496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804683
11533	NC_008258	TTG	2	6	689497	689502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804683
11534	NC_008258	TGG	2	6	689509	689514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804683
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11536	NC_008258	CTT	2	6	689606	689611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804683
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11542	NC_008258	CGT	2	6	689855	689860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804683
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11544	NC_008258	TCT	2	6	689887	689892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804683
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11551	NC_008258	CTCA	2	8	690102	690109	25 %	25 %	0 %	50 %	110804683
11552	NC_008258	TCG	2	6	690389	690394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804684
11553	NC_008258	TGC	2	6	690399	690404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804684
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11555	NC_008258	ATC	2	6	690419	690424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804684
11556	NC_008258	CCA	2	6	690501	690506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804684
11557	NC_008258	GAC	2	6	690556	690561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804684
11558	NC_008258	TGGT	2	8	690599	690606	0 %	50 %	50 %	0 %	110804684
11559	NC_008258	ACG	2	6	690644	690649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804684
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11561	NC_008258	GATA	2	8	690766	690773	50 %	25 %	25 %	0 %	110804684
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11565	NC_008258	ATCGT	2	10	690971	690980	20 %	40 %	20 %	20 %	110804684
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11574	NC_008258	CGGC	2	8	691263	691270	0 %	0 %	50 %	50 %	110804684
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11978	NC_008258	TAC	2	6	713622	713627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804702
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