MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008258	GGT	2	6	650040	650045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804654
11002	NC_008258	ATGA	2	8	650089	650096	50 %	25 %	25 %	0 %	110804654
11003	NC_008258	TCA	2	6	650204	650209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804654
11004	NC_008258	TCC	2	6	650232	650237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804654
11005	NC_008258	AGGA	2	8	650294	650301	50 %	0 %	50 %	0 %	110804654
11006	NC_008258	GCTC	2	8	650369	650376	0 %	25 %	25 %	50 %	110804654
11007	NC_008258	ATTA	2	8	650429	650436	50 %	50 %	0 %	0 %	110804654
11008	NC_008258	AAATGA	2	12	650440	650451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	110804655
11009	NC_008258	TGT	2	6	650476	650481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804655
11010	NC_008258	GAT	2	6	650643	650648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804655
11011	NC_008258	GCC	2	6	650663	650668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804655
11012	NC_008258	CAA	2	6	650692	650697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804655
11013	NC_008258	AAGC	2	8	650715	650722	50 %	0 %	25 %	25 %	110804655
11014	NC_008258	TCC	2	6	650783	650788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804655
11015	NC_008258	A	7	7	650797	650803	100 %	0 %	0 %	0 %	110804655
11016	NC_008258	CAGC	2	8	650915	650922	25 %	0 %	25 %	50 %	110804655
11017	NC_008258	CAAC	2	8	650927	650934	50 %	0 %	0 %	50 %	110804655
11018	NC_008258	TAT	2	6	650958	650963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804655
11019	NC_008258	GAT	2	6	651099	651104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804655
11020	NC_008258	GAC	2	6	651122	651127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804655
11021	NC_008258	GAA	2	6	651170	651175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804655
11022	NC_008258	GATGG	2	10	651601	651610	20 %	20 %	60 %	0 %	110804656
11023	NC_008258	TCGC	2	8	651666	651673	0 %	25 %	25 %	50 %	110804656
11024	NC_008258	GCC	2	6	651703	651708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804656
11025	NC_008258	TCG	2	6	651741	651746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804656
11026	NC_008258	TGAT	2	8	651879	651886	25 %	50 %	25 %	0 %	110804656
11027	NC_008258	AATTT	2	10	651894	651903	40 %	60 %	0 %	0 %	110804656
11028	NC_008258	TCG	2	6	651913	651918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804656
11029	NC_008258	CA	3	6	651920	651925	50 %	0 %	0 %	50 %	110804656
11030	NC_008258	GAC	2	6	651949	651954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804656
11031	NC_008258	TCC	2	6	651998	652003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804656
11032	NC_008258	GAA	2	6	652013	652018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804656
11033	NC_008258	GTTG	2	8	652021	652028	0 %	50 %	50 %	0 %	110804656
11034	NC_008258	AAG	2	6	652029	652034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804656
11035	NC_008258	TTG	2	6	652043	652048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804656
11036	NC_008258	CGCCT	2	10	652087	652096	0 %	20 %	20 %	60 %	110804656
11037	NC_008258	AATA	2	8	652106	652113	75 %	25 %	0 %	0 %	110804656
11038	NC_008258	A	6	6	652155	652160	100 %	0 %	0 %	0 %	110804656
11039	NC_008258	GTG	2	6	652223	652228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804656
11040	NC_008258	ATG	2	6	653505	653510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804657
11041	NC_008258	ATG	2	6	653573	653578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804657
11042	NC_008258	CAACC	2	10	653696	653705	40 %	0 %	0 %	60 %	110804657
11043	NC_008258	AAT	2	6	653728	653733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804657
11044	NC_008258	CCAG	2	8	653742	653749	25 %	0 %	25 %	50 %	110804657
11045	NC_008258	GCG	2	6	653797	653802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804657
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11053	NC_008258	ACA	2	6	654284	654289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804658
11054	NC_008258	CGG	2	6	654320	654325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804658
11055	NC_008258	GCAG	2	8	654357	654364	25 %	0 %	50 %	25 %	110804658
11056	NC_008258	TTC	2	6	654454	654459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804658
11057	NC_008258	TCAA	2	8	654464	654471	50 %	25 %	0 %	25 %	110804658
11058	NC_008258	CG	3	6	654540	654545	0 %	0 %	50 %	50 %	110804658
11059	NC_008258	TTGC	2	8	654559	654566	0 %	50 %	25 %	25 %	110804658
11060	NC_008258	CTT	2	6	654660	654665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804658
11061	NC_008258	CGC	2	6	654667	654672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804658
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11065	NC_008258	CGG	2	6	654784	654789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804658
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11089	NC_008258	AAC	2	6	656562	656567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804659
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11100	NC_008258	GCCA	2	8	657058	657065	25 %	0 %	25 %	50 %	110804660
11101	NC_008258	ATG	2	6	657155	657160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804660
11102	NC_008258	CTGG	2	8	657209	657216	0 %	25 %	50 %	25 %	110804660
11103	NC_008258	T	6	6	657235	657240	0 %	100 %	0 %	0 %	110804660
11104	NC_008258	CGC	2	6	657293	657298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804660
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11481	NC_008258	TTC	2	6	685641	685646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804680
11482	NC_008258	GAA	2	6	685709	685714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804680
11483	NC_008258	GAC	2	6	685754	685759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804680
11484	NC_008258	CAC	2	6	685826	685831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804680
11485	NC_008258	TGA	2	6	685876	685881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804680
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