MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75502	NC_008258	GCA	2	6	4568708	4568713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808186
75503	NC_008258	CAG	2	6	4568772	4568777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808186
75504	NC_008258	GCC	2	6	4568836	4568841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808186
75505	NC_008258	GAC	2	6	4568934	4568939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808186
75506	NC_008258	GAA	2	6	4569005	4569010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808186
75507	NC_008258	TGAAT	2	10	4569050	4569059	40 %	40 %	20 %	0 %	110808186
75508	NC_008258	GC	3	6	4569257	4569262	0 %	0 %	50 %	50 %	110808186
75509	NC_008258	TGC	2	6	4569348	4569353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808187
75510	NC_008258	T	6	6	4569361	4569366	0 %	100 %	0 %	0 %	110808187
75511	NC_008258	TGG	2	6	4569369	4569374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808187
75512	NC_008258	GGC	2	6	4569379	4569384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
75513	NC_008258	AAG	2	6	4569411	4569416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808187
75514	NC_008258	CT	3	6	4569500	4569505	0 %	50 %	0 %	50 %	110808187
75515	NC_008258	ACA	2	6	4569550	4569555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808187
75516	NC_008258	TGG	2	6	4569577	4569582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808187
75517	NC_008258	ATT	2	6	4569675	4569680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110808187
75518	NC_008258	GC	3	6	4569725	4569730	0 %	0 %	50 %	50 %	110808187
75519	NC_008258	ATGT	2	8	4569770	4569777	25 %	50 %	25 %	0 %	110808187
75520	NC_008258	GGC	2	6	4569794	4569799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
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75523	NC_008258	TGG	2	6	4569938	4569943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808187
75524	NC_008258	GTA	2	6	4570023	4570028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808187
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75533	NC_008258	GGC	2	6	4570318	4570323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
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75537	NC_008258	A	7	7	4570368	4570374	100 %	0 %	0 %	0 %	110808187
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75539	NC_008258	A	6	6	4570623	4570628	100 %	0 %	0 %	0 %	110808187
75540	NC_008258	GTTT	2	8	4570668	4570675	0 %	75 %	25 %	0 %	110808187
75541	NC_008258	C	6	6	4570821	4570826	0 %	0 %	0 %	100 %	110808188
75542	NC_008258	ACC	2	6	4570841	4570846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808188
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75544	NC_008258	GAA	2	6	4571111	4571116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808188
75545	NC_008258	ATC	2	6	4571216	4571221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808188
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75548	NC_008258	TGCC	2	8	4571445	4571452	0 %	25 %	25 %	50 %	110808188
75549	NC_008258	T	6	6	4571500	4571505	0 %	100 %	0 %	0 %	110808188
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75554	NC_008258	TGG	2	6	4571793	4571798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808188
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.