MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_008258	GCA	2	6	4538863	4538868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808158
75002	NC_008258	GCG	2	6	4538872	4538877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808158
75003	NC_008258	CAG	2	6	4538881	4538886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808158
75004	NC_008258	A	6	6	4538950	4538955	100 %	0 %	0 %	0 %	110808158
75005	NC_008258	TC	3	6	4539066	4539071	0 %	50 %	0 %	50 %	110808158
75006	NC_008258	GCT	2	6	4539132	4539137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808158
75007	NC_008258	GCG	2	6	4539138	4539143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808158
75008	NC_008258	CA	4	8	4539168	4539175	50 %	0 %	0 %	50 %	110808158
75009	NC_008258	TGG	2	6	4539280	4539285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808158
75010	NC_008258	ATC	2	6	4539344	4539349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808158
75011	NC_008258	GTTG	3	12	4539350	4539361	0 %	50 %	50 %	0 %	110808158
75012	NC_008258	GATA	2	8	4539363	4539370	50 %	25 %	25 %	0 %	110808158
75013	NC_008258	TGA	2	6	4539412	4539417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808158
75014	NC_008258	ATC	2	6	4539500	4539505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808158
75015	NC_008258	AATGAT	2	12	4539616	4539627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	110808159
75016	NC_008258	TGC	2	6	4539775	4539780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808159
75017	NC_008258	CAT	2	6	4539938	4539943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808159
75018	NC_008258	TGA	2	6	4539946	4539951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808159
75019	NC_008258	TTC	2	6	4540619	4540624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808160
75020	NC_008258	CGC	3	9	4540752	4540760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808160
75021	NC_008258	CGG	2	6	4540834	4540839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808160
75022	NC_008258	GAT	2	6	4540846	4540851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808160
75023	NC_008258	AAC	2	6	4540860	4540865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808160
75024	NC_008258	GGCT	2	8	4540935	4540942	0 %	25 %	50 %	25 %	110808160
75025	NC_008258	CCG	2	6	4540947	4540952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808160
75026	NC_008258	GC	3	6	4540996	4541001	0 %	0 %	50 %	50 %	110808160
75027	NC_008258	AGC	2	6	4541078	4541083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808160
75028	NC_008258	GAC	2	6	4541205	4541210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808160
75029	NC_008258	CGA	2	6	4541228	4541233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808160
75030	NC_008258	CGC	2	6	4541292	4541297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808160
75031	NC_008258	GCA	2	6	4541337	4541342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808160
75032	NC_008258	TCA	2	6	4541355	4541360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808160
75033	NC_008258	TTC	2	6	4541384	4541389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808160
75034	NC_008258	AGT	2	6	4541394	4541399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808160
75035	NC_008258	CAT	2	6	4541424	4541429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808160
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75037	NC_008258	CG	3	6	4541537	4541542	0 %	0 %	50 %	50 %	110808160
75038	NC_008258	ATC	2	6	4541593	4541598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808160
75039	NC_008258	GCA	2	6	4541607	4541612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808160
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75041	NC_008258	CGTC	2	8	4541853	4541860	0 %	25 %	25 %	50 %	110808161
75042	NC_008258	TGG	2	6	4541867	4541872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808161
75043	NC_008258	CTGA	2	8	4541890	4541897	25 %	25 %	25 %	25 %	110808161
75044	NC_008258	GC	3	6	4541919	4541924	0 %	0 %	50 %	50 %	110808161
75045	NC_008258	TGC	2	6	4541948	4541953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808161
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75047	NC_008258	TGC	2	6	4541978	4541983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808161
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75052	NC_008258	A	6	6	4542213	4542218	100 %	0 %	0 %	0 %	110808162
75053	NC_008258	GGC	2	6	4542280	4542285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808162
75054	NC_008258	GTG	2	6	4542302	4542307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808162
75055	NC_008258	GCT	2	6	4542376	4542381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808162
75056	NC_008258	CGA	2	6	4542394	4542399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808162
75057	NC_008258	TGC	2	6	4542451	4542456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808162
75058	NC_008258	CGA	2	6	4542495	4542500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808162
75059	NC_008258	CGC	2	6	4542503	4542508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808162
75060	NC_008258	TAC	2	6	4542512	4542517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808162
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75062	NC_008258	CAT	3	9	4542544	4542552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808162
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75065	NC_008258	TTA	2	6	4542845	4542850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110808163
75066	NC_008258	CAT	2	6	4542930	4542935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808163
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75069	NC_008258	GAA	2	6	4543018	4543023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808163
75070	NC_008258	CTG	2	6	4543164	4543169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808163
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75081	NC_008258	CGC	2	6	4543698	4543703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808164
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75084	NC_008258	CAG	2	6	4544029	4544034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808164
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75086	NC_008258	TTC	2	6	4544119	4544124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808164
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75088	NC_008258	AGCG	2	8	4544226	4544233	25 %	0 %	50 %	25 %	110808164
75089	NC_008258	ACCGCG	2	12	4544288	4544299	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110808164
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75098	NC_008258	GC	3	6	4544707	4544712	0 %	0 %	50 %	50 %	110808164
75099	NC_008258	AGTC	2	8	4544747	4544754	25 %	25 %	25 %	25 %	110808164
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75114	NC_008258	GC	4	8	4546494	4546501	0 %	0 %	50 %	50 %	110808166
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