MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74501	NC_008258	TTC	2	6	4509035	4509040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808129
74502	NC_008258	CTGAA	2	10	4509055	4509064	40 %	20 %	20 %	20 %	110808129
74503	NC_008258	A	6	6	4509076	4509081	100 %	0 %	0 %	0 %	110808129
74504	NC_008258	GAA	2	6	4509095	4509100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808129
74505	NC_008258	TGGT	2	8	4509105	4509112	0 %	50 %	50 %	0 %	110808129
74506	NC_008258	ACTT	2	8	4509183	4509190	25 %	50 %	0 %	25 %	110808130
74507	NC_008258	CGC	2	6	4509206	4509211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808130
74508	NC_008258	TCC	2	6	4509222	4509227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110808130
74509	NC_008258	CAG	2	6	4509326	4509331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74510	NC_008258	GCA	2	6	4509373	4509378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74511	NC_008258	CCG	2	6	4509385	4509390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808130
74512	NC_008258	CAG	3	9	4509395	4509403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74513	NC_008258	CCA	2	6	4509454	4509459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808130
74514	NC_008258	GAC	2	6	4509518	4509523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74515	NC_008258	CAG	2	6	4509557	4509562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74516	NC_008258	GC	3	6	4509617	4509622	0 %	0 %	50 %	50 %	110808130
74517	NC_008258	CAG	2	6	4509671	4509676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74518	NC_008258	CCA	2	6	4509751	4509756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808130
74519	NC_008258	CAG	2	6	4509773	4509778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74520	NC_008258	AAT	2	6	4509818	4509823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110808130
74521	NC_008258	CAG	2	6	4509899	4509904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74522	NC_008258	AGT	2	6	4509909	4509914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808130
74523	NC_008258	TCC	2	6	4509918	4509923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110808130
74524	NC_008258	CAG	2	6	4509942	4509947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74525	NC_008258	ATC	2	6	4510001	4510006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808130
74526	NC_008258	GTT	2	6	4510057	4510062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110808130
74527	NC_008258	GCA	2	6	4510078	4510083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808130
74528	NC_008258	A	6	6	4510104	4510109	100 %	0 %	0 %	0 %	110808130
74529	NC_008258	AAC	2	6	4510154	4510159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808131
74530	NC_008258	CGC	2	6	4510181	4510186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808131
74531	NC_008258	GC	3	6	4510191	4510196	0 %	0 %	50 %	50 %	110808131
74532	NC_008258	GAA	2	6	4510212	4510217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808131
74533	NC_008258	TTC	2	6	4510218	4510223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808131
74534	NC_008258	TGGT	2	8	4510249	4510256	0 %	50 %	50 %	0 %	110808131
74535	NC_008258	CGC	2	6	4510308	4510313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808131
74536	NC_008258	T	7	7	4510326	4510332	0 %	100 %	0 %	0 %	110808131
74537	NC_008258	GTG	2	6	4510408	4510413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808132
74538	NC_008258	CGC	2	6	4510428	4510433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808132
74539	NC_008258	AGA	2	6	4510515	4510520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808132
74540	NC_008258	GTT	2	6	4510573	4510578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110808132
74541	NC_008258	CTG	2	6	4510606	4510611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74542	NC_008258	GTCAG	2	10	4510616	4510625	20 %	20 %	40 %	20 %	110808132
74543	NC_008258	TCT	2	6	4510638	4510643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808132
74544	NC_008258	AGA	2	6	4510665	4510670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808132
74545	NC_008258	GGT	2	6	4510720	4510725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808132
74546	NC_008258	AGC	2	6	4510733	4510738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74547	NC_008258	AAC	2	6	4510750	4510755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808132
74548	NC_008258	CGC	2	6	4510872	4510877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808132
74549	NC_008258	CAG	2	6	4510903	4510908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74550	NC_008258	CA	3	6	4510924	4510929	50 %	0 %	0 %	50 %	110808132
74551	NC_008258	GAT	2	6	4510942	4510947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808132
74552	NC_008258	AG	3	6	4510958	4510963	50 %	0 %	50 %	0 %	110808132
74553	NC_008258	T	7	7	4510968	4510974	0 %	100 %	0 %	0 %	110808132
74554	NC_008258	CAG	2	6	4510996	4511001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74555	NC_008258	GCA	2	6	4511007	4511012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74556	NC_008258	GCA	2	6	4511112	4511117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74557	NC_008258	TACC	2	8	4511139	4511146	25 %	25 %	0 %	50 %	110808132
74558	NC_008258	CAC	2	6	4511160	4511165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808132
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74560	NC_008258	CAG	2	6	4511355	4511360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74561	NC_008258	GAT	2	6	4511395	4511400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808132
74562	NC_008258	CG	3	6	4511468	4511473	0 %	0 %	50 %	50 %	110808132
74563	NC_008258	CAG	2	6	4511488	4511493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74564	NC_008258	CGT	2	6	4511500	4511505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808132
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74567	NC_008258	CAC	2	6	4511650	4511655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808132
74568	NC_008258	CGA	2	6	4511673	4511678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
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74570	NC_008258	GCA	2	6	4511739	4511744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
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74574	NC_008258	CAG	2	6	4511863	4511868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808132
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74576	NC_008258	GAT	3	9	4512028	4512036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808132
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74582	NC_008258	CAGG	2	8	4512204	4512211	25 %	0 %	50 %	25 %	110808132
74583	NC_008258	GCG	2	6	4512224	4512229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808132
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74585	NC_008258	GCG	2	6	4512266	4512271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808132
74586	NC_008258	GTG	2	6	4512274	4512279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808132
74587	NC_008258	ACA	2	6	4512285	4512290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808132
74588	NC_008258	CGT	2	6	4512321	4512326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808132
74589	NC_008258	TAA	2	6	4512330	4512335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110808132
74590	NC_008258	CG	4	8	4512346	4512353	0 %	0 %	50 %	50 %	110808132
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74600	NC_008258	TC	3	6	4513091	4513096	0 %	50 %	0 %	50 %	110808133
74601	NC_008258	GC	3	6	4513209	4513214	0 %	0 %	50 %	50 %	110808133
74602	NC_008258	GGT	2	6	4513318	4513323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808133
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74604	NC_008258	ATA	2	6	4513390	4513395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110808133
74605	NC_008258	GTT	2	6	4513442	4513447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110808133
74606	NC_008258	ACG	2	6	4515306	4515311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808134
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74608	NC_008258	T	6	6	4515394	4515399	0 %	100 %	0 %	0 %	110808134
74609	NC_008258	TG	3	6	4515617	4515622	0 %	50 %	50 %	0 %	110808134
74610	NC_008258	GTCACG	2	12	4515683	4515694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110808134
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74614	NC_008258	ATT	2	6	4515973	4515978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110808134
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74964	NC_008258	CAC	2	6	4535984	4535989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808153
74965	NC_008258	TCA	2	6	4536135	4536140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808153
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74968	NC_008258	ATG	2	6	4536828	4536833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808154
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74990	NC_008258	AG	3	6	4538304	4538309	50 %	0 %	50 %	0 %	110808157
74991	NC_008258	CTGA	2	8	4538322	4538329	25 %	25 %	25 %	25 %	110808157
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