MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008258	GTG	2	6	407051	407056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804446
7002	NC_008258	CTTT	2	8	407123	407130	0 %	75 %	0 %	25 %	110804447
7003	NC_008258	GC	3	6	407176	407181	0 %	0 %	50 %	50 %	110804447
7004	NC_008258	GCG	2	6	407186	407191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804447
7005	NC_008258	GC	3	6	407233	407238	0 %	0 %	50 %	50 %	110804447
7006	NC_008258	CGA	2	6	407255	407260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804447
7007	NC_008258	CTG	2	6	407269	407274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804447
7008	NC_008258	ATCA	2	8	407279	407286	50 %	25 %	0 %	25 %	110804447
7009	NC_008258	ATG	2	6	407324	407329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804447
7010	NC_008258	CTT	2	6	407356	407361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804447
7011	NC_008258	GAT	2	6	407386	407391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804447
7012	NC_008258	CAGT	2	8	407425	407432	25 %	25 %	25 %	25 %	110804447
7013	NC_008258	TGCCG	2	10	407556	407565	0 %	20 %	40 %	40 %	110804447
7014	NC_008258	AAT	2	6	407597	407602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804447
7015	NC_008258	CGG	2	6	407616	407621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804447
7016	NC_008258	GTG	3	9	407631	407639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804447
7017	NC_008258	GCT	2	6	407653	407658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804447
7018	NC_008258	TTC	2	6	407672	407677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804447
7019	NC_008258	TGG	2	6	407797	407802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804447
7020	NC_008258	CAGC	2	8	407897	407904	25 %	0 %	25 %	50 %	110804447
7021	NC_008258	ACG	2	6	408278	408283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804448
7022	NC_008258	GCT	2	6	408357	408362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804448
7023	NC_008258	A	7	7	408475	408481	100 %	0 %	0 %	0 %	110804448
7024	NC_008258	GAT	2	6	408489	408494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804448
7025	NC_008258	TGA	2	6	408564	408569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804448
7026	NC_008258	CTAT	2	8	408838	408845	25 %	50 %	0 %	25 %	110804449
7027	NC_008258	GTTGT	2	10	408860	408869	0 %	60 %	40 %	0 %	110804449
7028	NC_008258	TTA	2	6	408874	408879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804449
7029	NC_008258	TG	3	6	408893	408898	0 %	50 %	50 %	0 %	110804449
7030	NC_008258	T	7	7	408913	408919	0 %	100 %	0 %	0 %	110804449
7031	NC_008258	CAA	2	6	408936	408941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804449
7032	NC_008258	AAT	2	6	408979	408984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804449
7033	NC_008258	TA	3	6	409103	409108	50 %	50 %	0 %	0 %	110804449
7034	NC_008258	TGA	2	6	409119	409124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804449
7035	NC_008258	TA	3	6	409170	409175	50 %	50 %	0 %	0 %	110804449
7036	NC_008258	TTC	2	6	409179	409184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804449
7037	NC_008258	TTA	3	9	409253	409261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804449
7038	NC_008258	TCT	2	6	409270	409275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804449
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7042	NC_008258	TCA	2	6	409445	409450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804449
7043	NC_008258	TAA	2	6	409473	409478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804449
7044	NC_008258	CTT	2	6	409498	409503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804449
7045	NC_008258	TGC	2	6	409573	409578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804449
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7053	NC_008258	T	6	6	409819	409824	0 %	100 %	0 %	0 %	110804449
7054	NC_008258	TTTG	2	8	409834	409841	0 %	75 %	25 %	0 %	110804449
7055	NC_008258	AAC	2	6	409890	409895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804449
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7057	NC_008258	GTT	2	6	410027	410032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804449
7058	NC_008258	TTTA	2	8	410085	410092	25 %	75 %	0 %	0 %	110804449
7059	NC_008258	A	6	6	410107	410112	100 %	0 %	0 %	0 %	110804449
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7072	NC_008258	TAGA	2	8	410556	410563	50 %	25 %	25 %	0 %	110804450
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7104	NC_008258	TGAT	2	8	412322	412329	25 %	50 %	25 %	0 %	110804450
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7107	NC_008258	TTTA	2	8	412516	412523	25 %	75 %	0 %	0 %	110804450
7108	NC_008258	ATA	2	6	412616	412621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804450
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7110	NC_008258	ATG	2	6	412640	412645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804450
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7118	NC_008258	CTGG	2	8	413153	413160	0 %	25 %	50 %	25 %	110804451
7119	NC_008258	CTG	2	6	413194	413199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804451
7120	NC_008258	GCA	2	6	413224	413229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804451
7121	NC_008258	ACC	2	6	413274	413279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804451
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