MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008258	AGC	2	6	381277	381282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804422
6502	NC_008258	TCG	2	6	381344	381349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804422
6503	NC_008258	CGG	2	6	381371	381376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804422
6504	NC_008258	GCT	2	6	381533	381538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804423
6505	NC_008258	TGC	2	6	381543	381548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804423
6506	NC_008258	T	6	6	381573	381578	0 %	100 %	0 %	0 %	110804423
6507	NC_008258	TGG	2	6	381657	381662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804423
6508	NC_008258	CTA	2	6	381717	381722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804423
6509	NC_008258	A	6	6	381753	381758	100 %	0 %	0 %	0 %	110804423
6510	NC_008258	CGC	2	6	381759	381764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804423
6511	NC_008258	GCG	2	6	381799	381804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804423
6512	NC_008258	GGT	2	6	381824	381829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804423
6513	NC_008258	CAA	2	6	381876	381881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804423
6514	NC_008258	GGC	2	6	382009	382014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804423
6515	NC_008258	TGG	2	6	382060	382065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804423
6516	NC_008258	GCG	2	6	382103	382108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804423
6517	NC_008258	T	6	6	382113	382118	0 %	100 %	0 %	0 %	110804423
6518	NC_008258	TACG	2	8	382138	382145	25 %	25 %	25 %	25 %	110804423
6519	NC_008258	GAT	2	6	382175	382180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804423
6520	NC_008258	AGC	2	6	382186	382191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804423
6521	NC_008258	GAT	2	6	382337	382342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804423
6522	NC_008258	GTT	2	6	382350	382355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804423
6523	NC_008258	A	6	6	382383	382388	100 %	0 %	0 %	0 %	110804423
6524	NC_008258	GATA	2	8	382406	382413	50 %	25 %	25 %	0 %	110804423
6525	NC_008258	CGG	2	6	382646	382651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804423
6526	NC_008258	ATC	2	6	382690	382695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804423
6527	NC_008258	CG	3	6	383216	383221	0 %	0 %	50 %	50 %	110804424
6528	NC_008258	ATC	2	6	383224	383229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804424
6529	NC_008258	GTT	2	6	383253	383258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804424
6530	NC_008258	ATT	2	6	383275	383280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804424
6531	NC_008258	CAGG	2	8	383302	383309	25 %	0 %	50 %	25 %	110804424
6532	NC_008258	GGT	2	6	383398	383403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804424
6533	NC_008258	CTG	2	6	383446	383451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804424
6534	NC_008258	CGC	2	6	383492	383497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804424
6535	NC_008258	GCT	2	6	383622	383627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804424
6536	NC_008258	CTGT	2	8	383680	383687	0 %	50 %	25 %	25 %	110804424
6537	NC_008258	CGG	2	6	383705	383710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804424
6538	NC_008258	CTG	2	6	383863	383868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804424
6539	NC_008258	TCTG	2	8	383936	383943	0 %	50 %	25 %	25 %	110804424
6540	NC_008258	GCT	2	6	383986	383991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804424
6541	NC_008258	GGC	3	9	384022	384030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804424
6542	NC_008258	CTG	2	6	384040	384045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804424
6543	NC_008258	GCG	2	6	384046	384051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804424
6544	NC_008258	CGG	2	6	384077	384082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804424
6545	NC_008258	GTAC	2	8	384120	384127	25 %	25 %	25 %	25 %	110804424
6546	NC_008258	CT	3	6	384130	384135	0 %	50 %	0 %	50 %	110804424
6547	NC_008258	CGG	2	6	384159	384164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804424
6548	NC_008258	TGG	2	6	384173	384178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804424
6549	NC_008258	CCG	2	6	384241	384246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804424
6550	NC_008258	TGG	2	6	384283	384288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804424
6551	NC_008258	CCG	2	6	384313	384318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804424
6552	NC_008258	GTG	2	6	384445	384450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804424
6553	NC_008258	TGG	2	6	384452	384457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804424
6554	NC_008258	CG	3	6	384478	384483	0 %	0 %	50 %	50 %	110804424
6555	NC_008258	GTC	2	6	384488	384493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804424
6556	NC_008258	GTT	2	6	384723	384728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804425
6557	NC_008258	TAT	2	6	384735	384740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804425
6558	NC_008258	GGT	2	6	384742	384747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804425
6559	NC_008258	TGCG	2	8	384767	384774	0 %	25 %	50 %	25 %	110804425
6560	NC_008258	GCC	2	6	384802	384807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804425
6561	NC_008258	GTG	2	6	384979	384984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804425
6562	NC_008258	TGA	2	6	385007	385012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804425
6563	NC_008258	CCA	2	6	385064	385069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804425
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6565	NC_008258	CAT	3	9	385098	385106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804425
6566	NC_008258	CGG	2	6	385122	385127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804425
6567	NC_008258	ACCG	2	8	385131	385138	25 %	0 %	25 %	50 %	110804425
6568	NC_008258	CGG	2	6	385161	385166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804425
6569	NC_008258	CTT	2	6	385167	385172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804425
6570	NC_008258	GGCT	2	8	385180	385187	0 %	25 %	50 %	25 %	110804425
6571	NC_008258	CCG	2	6	385253	385258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804425
6572	NC_008258	TCTA	2	8	385357	385364	25 %	50 %	0 %	25 %	110804425
6573	NC_008258	GCC	2	6	385435	385440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804425
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6575	NC_008258	CGTCG	2	10	385565	385574	0 %	20 %	40 %	40 %	110804425
6576	NC_008258	TGA	2	6	385601	385606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804425
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6578	NC_008258	CAT	2	6	385641	385646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804425
6579	NC_008258	TCGCT	2	10	385670	385679	0 %	40 %	20 %	40 %	110804425
6580	NC_008258	CTG	2	6	385717	385722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804425
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6587	NC_008258	GCTG	2	8	385947	385954	0 %	25 %	50 %	25 %	110804425
6588	NC_008258	AAT	2	6	385961	385966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804425
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6591	NC_008258	TGC	2	6	386230	386235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804426
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6606	NC_008258	G	6	6	386921	386926	0 %	0 %	100 %	0 %	110804426
6607	NC_008258	TGA	2	6	386975	386980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804426
6608	NC_008258	TGGCT	2	10	386997	387006	0 %	40 %	40 %	20 %	110804426
6609	NC_008258	TGAA	2	8	387049	387056	50 %	25 %	25 %	0 %	110804426
6610	NC_008258	GGC	2	6	387121	387126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804426
6611	NC_008258	GC	3	6	387162	387167	0 %	0 %	50 %	50 %	110804426
6612	NC_008258	AAT	2	6	387168	387173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804426
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6985	NC_008258	TGA	2	6	406398	406403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804445
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