MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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66502	NC_008258	ATC	2	6	4028091	4028096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807720
66503	NC_008258	CGC	3	9	4028171	4028179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807720
66504	NC_008258	AGC	2	6	4028188	4028193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807720
66505	NC_008258	T	7	7	4028302	4028308	0 %	100 %	0 %	0 %	110807720
66506	NC_008258	ATCA	2	8	4028310	4028317	50 %	25 %	0 %	25 %	110807720
66507	NC_008258	ATC	2	6	4028379	4028384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807720
66508	NC_008258	GTG	2	6	4028409	4028414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807721
66509	NC_008258	CCA	2	6	4028422	4028427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807721
66510	NC_008258	CCA	2	6	4028485	4028490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807721
66511	NC_008258	CCG	2	6	4028497	4028502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807721
66512	NC_008258	GCGATA	2	12	4028508	4028519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	110807721
66513	NC_008258	ATC	2	6	4028532	4028537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807721
66514	NC_008258	GGT	2	6	4028555	4028560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807721
66515	NC_008258	GGC	2	6	4028564	4028569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807721
66516	NC_008258	TGT	2	6	4028598	4028603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807721
66517	NC_008258	GCG	2	6	4028622	4028627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807721
66518	NC_008258	CAGC	2	8	4028672	4028679	25 %	0 %	25 %	50 %	110807721
66519	NC_008258	GAA	2	6	4028693	4028698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110807721
66520	NC_008258	GCCAGT	3	18	4028721	4028738	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110807721
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66522	NC_008258	TGC	2	6	4028827	4028832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807721
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66525	NC_008258	TGG	2	6	4028972	4028977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807721
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66542	NC_008258	TTG	2	6	4030010	4030015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807721
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66962	NC_008258	CCA	2	6	4052546	4052551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807742
66963	NC_008258	ATC	2	6	4052933	4052938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807743
66964	NC_008258	TGC	2	6	4052987	4052992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807743
66965	NC_008258	ATG	2	6	4053012	4053017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807743
66966	NC_008258	TTCCAT	2	12	4053042	4053053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	110807743
66967	NC_008258	TCCT	2	8	4053060	4053067	0 %	50 %	0 %	50 %	110807743
66968	NC_008258	GTG	2	6	4053085	4053090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807743
66969	NC_008258	A	6	6	4053288	4053293	100 %	0 %	0 %	0 %	110807744
66970	NC_008258	GTGAT	2	10	4053334	4053343	20 %	40 %	40 %	0 %	110807744
66971	NC_008258	GCTG	2	8	4053400	4053407	0 %	25 %	50 %	25 %	110807744
66972	NC_008258	GGA	2	6	4053430	4053435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110807744
66973	NC_008258	TCT	2	6	4053485	4053490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807744
66974	NC_008258	CTG	2	6	4053495	4053500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807744
66975	NC_008258	AATCTG	2	12	4053615	4053626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110807744
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66977	NC_008258	TTAA	2	8	4054275	4054282	50 %	50 %	0 %	0 %	110807745
66978	NC_008258	TGGTGC	2	12	4054349	4054360	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110807745
66979	NC_008258	A	7	7	4054486	4054492	100 %	0 %	0 %	0 %	110807745
66980	NC_008258	CAC	2	6	4054614	4054619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807745
66981	NC_008258	CTGCGG	2	12	4054645	4054656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110807745
66982	NC_008258	TGGG	2	8	4054680	4054687	0 %	25 %	75 %	0 %	110807745
66983	NC_008258	TAT	2	6	4054755	4054760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807745
66984	NC_008258	AG	3	6	4054796	4054801	50 %	0 %	50 %	0 %	110807745
66985	NC_008258	CGT	2	6	4054809	4054814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807745
66986	NC_008258	CGT	2	6	4054895	4054900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807745
66987	NC_008258	GAT	2	6	4054955	4054960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807745
66988	NC_008258	TTCGCC	2	12	4055184	4055195	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	110807746
66989	NC_008258	TGGC	2	8	4055249	4055256	0 %	25 %	50 %	25 %	110807746
66990	NC_008258	GC	3	6	4055255	4055260	0 %	0 %	50 %	50 %	110807746
66991	NC_008258	TGC	2	6	4055281	4055286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807746
66992	NC_008258	CCT	2	6	4055546	4055551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110807746
66993	NC_008258	TG	3	6	4055629	4055634	0 %	50 %	50 %	0 %	110807746
66994	NC_008258	ACA	2	6	4055868	4055873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807746
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66997	NC_008258	GC	4	8	4056020	4056027	0 %	0 %	50 %	50 %	110807746
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