MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_008258	GAT	2	6	3879756	3879761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807583
64002	NC_008258	CACGG	2	10	3879780	3879789	20 %	0 %	40 %	40 %	110807583
64003	NC_008258	CAT	2	6	3879821	3879826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807583
64004	NC_008258	CTGG	2	8	3879917	3879924	0 %	25 %	50 %	25 %	110807584
64005	NC_008258	TTA	2	6	3880034	3880039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807584
64006	NC_008258	CGA	2	6	3880130	3880135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807584
64007	NC_008258	CCGAA	2	10	3880138	3880147	40 %	0 %	20 %	40 %	110807584
64008	NC_008258	TGA	2	6	3880181	3880186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807584
64009	NC_008258	CGG	2	6	3880262	3880267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807584
64010	NC_008258	AGA	2	6	3880412	3880417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110807584
64011	NC_008258	CAT	2	6	3880449	3880454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807584
64012	NC_008258	GCCA	2	8	3880558	3880565	25 %	0 %	25 %	50 %	110807584
64013	NC_008258	TTC	2	6	3880659	3880664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807584
64014	NC_008258	AGA	2	6	3880706	3880711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110807584
64015	NC_008258	TTA	2	6	3880745	3880750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807584
64016	NC_008258	ACG	2	6	3880771	3880776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807584
64017	NC_008258	TAA	2	6	3880784	3880789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110807584
64018	NC_008258	TTAT	2	8	3880920	3880927	25 %	75 %	0 %	0 %	110807584
64019	NC_008258	TTTA	2	8	3881130	3881137	25 %	75 %	0 %	0 %	110807584
64020	NC_008258	TGA	2	6	3881147	3881152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807584
64021	NC_008258	GAAG	2	8	3881160	3881167	50 %	0 %	50 %	0 %	110807584
64022	NC_008258	A	7	7	3881237	3881243	100 %	0 %	0 %	0 %	110807584
64023	NC_008258	TTA	2	6	3881348	3881353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807585
64024	NC_008258	TTA	2	6	3881365	3881370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807585
64025	NC_008258	AAC	2	6	3881423	3881428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807585
64026	NC_008258	TTA	2	6	3881437	3881442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807585
64027	NC_008258	GAAGA	2	10	3881491	3881500	60 %	0 %	40 %	0 %	110807585
64028	NC_008258	A	6	6	3881500	3881505	100 %	0 %	0 %	0 %	110807585
64029	NC_008258	GCC	2	6	3881557	3881562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807585
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64031	NC_008258	TTC	2	6	3881652	3881657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807585
64032	NC_008258	AAC	2	6	3881831	3881836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807585
64033	NC_008258	TGA	2	6	3881876	3881881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807585
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64036	NC_008258	TGGG	2	8	3882016	3882023	0 %	25 %	75 %	0 %	110807585
64037	NC_008258	CTGGA	2	10	3882058	3882067	20 %	20 %	40 %	20 %	110807585
64038	NC_008258	GAT	2	6	3882163	3882168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807585
64039	NC_008258	CAG	2	6	3882193	3882198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807585
64040	NC_008258	ATA	2	6	3882320	3882325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110807585
64041	NC_008258	TAT	2	6	3882331	3882336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807585
64042	NC_008258	TCCT	2	8	3882409	3882416	0 %	50 %	0 %	50 %	110807585
64043	NC_008258	ACC	2	6	3882475	3882480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807585
64044	NC_008258	TTA	2	6	3882492	3882497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807585
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64049	NC_008258	GAC	2	6	3882904	3882909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807585
64050	NC_008258	TGG	2	6	3882940	3882945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807585
64051	NC_008258	GCCA	2	8	3883052	3883059	25 %	0 %	25 %	50 %	110807586
64052	NC_008258	A	6	6	3883148	3883153	100 %	0 %	0 %	0 %	110807586
64053	NC_008258	GTG	2	6	3883164	3883169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807586
64054	NC_008258	GTTCCG	2	12	3883173	3883184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807586
64055	NC_008258	T	6	6	3883268	3883273	0 %	100 %	0 %	0 %	110807586
64056	NC_008258	GCA	2	6	3883291	3883296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807586
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64058	NC_008258	CTG	2	6	3883581	3883586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807586
64059	NC_008258	TGG	2	6	3883612	3883617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807586
64060	NC_008258	ATT	2	6	3883650	3883655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807586
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64062	NC_008258	CG	3	6	3883791	3883796	0 %	0 %	50 %	50 %	110807586
64063	NC_008258	GAAT	2	8	3883840	3883847	50 %	25 %	25 %	0 %	110807586
64064	NC_008258	TGGC	3	12	3883862	3883873	0 %	25 %	50 %	25 %	110807586
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64066	NC_008258	A	7	7	3884043	3884049	100 %	0 %	0 %	0 %	110807586
64067	NC_008258	GGC	2	6	3884101	3884106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807586
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64082	NC_008258	GCGT	2	8	3885190	3885197	0 %	25 %	50 %	25 %	110807588
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