MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60501	NC_008258	TGC	2	6	3679317	3679322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807415
60502	NC_008258	CTT	2	6	3679333	3679338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807415
60503	NC_008258	CGG	2	6	3679344	3679349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807415
60504	NC_008258	CCG	2	6	3679395	3679400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807415
60505	NC_008258	GCG	2	6	3679431	3679436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807415
60506	NC_008258	CAGT	2	8	3679447	3679454	25 %	25 %	25 %	25 %	110807415
60507	NC_008258	CAT	2	6	3679492	3679497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807415
60508	NC_008258	TTG	2	6	3679503	3679508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807415
60509	NC_008258	CGC	2	6	3679573	3679578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807415
60510	NC_008258	CGG	2	6	3679611	3679616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807415
60511	NC_008258	GCG	2	6	3679637	3679642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807415
60512	NC_008258	AGGA	2	8	3679678	3679685	50 %	0 %	50 %	0 %	110807415
60513	NC_008258	CG	3	6	3679708	3679713	0 %	0 %	50 %	50 %	110807415
60514	NC_008258	TAT	2	6	3679721	3679726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807415
60515	NC_008258	CAT	2	6	3679781	3679786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807415
60516	NC_008258	CAC	2	6	3679787	3679792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807415
60517	NC_008258	CTT	2	6	3679828	3679833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807415
60518	NC_008258	ATC	2	6	3679865	3679870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807415
60519	NC_008258	CGC	2	6	3679872	3679877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807415
60520	NC_008258	T	7	7	3679939	3679945	0 %	100 %	0 %	0 %	110807415
60521	NC_008258	CAG	2	6	3680150	3680155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807416
60522	NC_008258	GGCA	2	8	3680189	3680196	25 %	0 %	50 %	25 %	110807416
60523	NC_008258	CTG	2	6	3680259	3680264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807416
60524	NC_008258	A	6	6	3680345	3680350	100 %	0 %	0 %	0 %	110807416
60525	NC_008258	ATCT	2	8	3680360	3680367	25 %	50 %	0 %	25 %	110807416
60526	NC_008258	TGG	2	6	3680434	3680439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807416
60527	NC_008258	GCA	2	6	3680504	3680509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807416
60528	NC_008258	ATCGC	2	10	3680533	3680542	20 %	20 %	20 %	40 %	110807416
60529	NC_008258	TGA	2	6	3680548	3680553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807416
60530	NC_008258	AAG	2	6	3680554	3680559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110807416
60531	NC_008258	TG	3	6	3680632	3680637	0 %	50 %	50 %	0 %	110807416
60532	NC_008258	CG	3	6	3680685	3680690	0 %	0 %	50 %	50 %	110807416
60533	NC_008258	ACCA	2	8	3680781	3680788	50 %	0 %	0 %	50 %	110807416
60534	NC_008258	TCG	2	6	3680815	3680820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807416
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60536	NC_008258	GATC	2	8	3680912	3680919	25 %	25 %	25 %	25 %	110807416
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60543	NC_008258	GAT	2	6	3681419	3681424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807416
60544	NC_008258	GCT	3	9	3681428	3681436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807416
60545	NC_008258	CGG	3	9	3681455	3681463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807416
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60547	NC_008258	GCT	2	6	3681608	3681613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807416
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60551	NC_008258	CTT	2	6	3681674	3681679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807416
60552	NC_008258	CGG	2	6	3681694	3681699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807416
60553	NC_008258	ACG	2	6	3681745	3681750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807416
60554	NC_008258	GAT	2	6	3681767	3681772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807416
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60556	NC_008258	TGTC	2	8	3681855	3681862	0 %	50 %	25 %	25 %	110807416
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60589	NC_008258	GCTGA	2	10	3683805	3683814	20 %	20 %	40 %	20 %	110807417
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