MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60002	NC_008258	GCG	2	6	3650532	3650537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807385
60003	NC_008258	CGG	2	6	3650576	3650581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807385
60004	NC_008258	GCA	2	6	3650652	3650657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807385
60005	NC_008258	CAA	2	6	3650715	3650720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807385
60006	NC_008258	CAT	2	6	3650731	3650736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807385
60007	NC_008258	GGCAA	2	10	3650782	3650791	40 %	0 %	40 %	20 %	110807385
60008	NC_008258	GA	3	6	3650793	3650798	50 %	0 %	50 %	0 %	110807385
60009	NC_008258	A	7	7	3650893	3650899	100 %	0 %	0 %	0 %	110807385
60010	NC_008258	CCG	2	6	3651119	3651124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807386
60011	NC_008258	CAGC	2	8	3651205	3651212	25 %	0 %	25 %	50 %	110807386
60012	NC_008258	GC	3	6	3651214	3651219	0 %	0 %	50 %	50 %	110807386
60013	NC_008258	TCA	2	6	3651224	3651229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807386
60014	NC_008258	CCAT	2	8	3651270	3651277	25 %	25 %	0 %	50 %	110807386
60015	NC_008258	GGC	2	6	3651433	3651438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807386
60016	NC_008258	GTT	2	6	3651456	3651461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807386
60017	NC_008258	TCA	2	6	3651497	3651502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807386
60018	NC_008258	GGT	2	6	3651655	3651660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807386
60019	NC_008258	GAC	2	6	3651675	3651680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807386
60020	NC_008258	CG	3	6	3651730	3651735	0 %	0 %	50 %	50 %	110807386
60021	NC_008258	GGGC	2	8	3651757	3651764	0 %	0 %	75 %	25 %	110807386
60022	NC_008258	AGC	2	6	3651845	3651850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807386
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60024	NC_008258	TCCA	2	8	3651914	3651921	25 %	25 %	0 %	50 %	110807386
60025	NC_008258	GGT	2	6	3651942	3651947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807386
60026	NC_008258	GCG	2	6	3651955	3651960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807386
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60028	NC_008258	CCA	2	6	3651993	3651998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807386
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60035	NC_008258	CAG	2	6	3652219	3652224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807386
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60042	NC_008258	TGC	2	6	3652907	3652912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807387
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60051	NC_008258	TCT	2	6	3653405	3653410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807388
60052	NC_008258	CTG	2	6	3653415	3653420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807388
60053	NC_008258	TGGC	2	8	3653453	3653460	0 %	25 %	50 %	25 %	110807388
60054	NC_008258	AATCTG	2	12	3653535	3653546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110807388
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60058	NC_008258	AGCA	2	8	3653914	3653921	50 %	0 %	25 %	25 %	110807389
60059	NC_008258	CA	3	6	3653920	3653925	50 %	0 %	0 %	50 %	110807389
60060	NC_008258	CGC	2	6	3653934	3653939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807389
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60062	NC_008258	ACA	2	6	3654229	3654234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807390
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60065	NC_008258	CAG	2	6	3654384	3654389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807390
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60103	NC_008258	T	7	7	3656464	3656470	0 %	100 %	0 %	0 %	110807392
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60233	NC_008258	ACC	2	6	3663137	3663142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807399
60234	NC_008258	GGCT	2	8	3663223	3663230	0 %	25 %	50 %	25 %	110807399
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60320	NC_008258	GTA	2	6	3669294	3669299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807405
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60324	NC_008258	GCCAG	2	10	3669453	3669462	20 %	0 %	40 %	40 %	110807405
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60328	NC_008258	GCA	2	6	3669684	3669689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807405
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60331	NC_008258	A	7	7	3669961	3669967	100 %	0 %	0 %	0 %	110807405
60332	NC_008258	TGC	2	6	3670537	3670542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807406
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60336	NC_008258	CTG	2	6	3670749	3670754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807406
60337	NC_008258	CCA	3	9	3670813	3670821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807406
60338	NC_008258	CA	3	6	3670820	3670825	50 %	0 %	0 %	50 %	110807406
60339	NC_008258	TCAATA	2	12	3670831	3670842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	110807406
60340	NC_008258	CGA	2	6	3670844	3670849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807406
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60342	NC_008258	GGT	2	6	3670964	3670969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807406
60343	NC_008258	GCCA	2	8	3670977	3670984	25 %	0 %	25 %	50 %	110807406
60344	NC_008258	TCGCC	2	10	3671005	3671014	0 %	20 %	20 %	60 %	110807406
60345	NC_008258	CGC	2	6	3671030	3671035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807406
60346	NC_008258	TC	3	6	3671039	3671044	0 %	50 %	0 %	50 %	110807406
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