MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_008258	GCA	2	6	3550766	3550771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807310
58502	NC_008258	CGC	2	6	3550790	3550795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807310
58503	NC_008258	GT	3	6	3550881	3550886	0 %	50 %	50 %	0 %	110807310
58504	NC_008258	CG	3	6	3550934	3550939	0 %	0 %	50 %	50 %	110807310
58505	NC_008258	GCA	3	9	3550970	3550978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807310
58506	NC_008258	CAG	2	6	3550989	3550994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807310
58507	NC_008258	GTG	2	6	3551047	3551052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807310
58508	NC_008258	ACC	2	6	3551155	3551160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807310
58509	NC_008258	CAC	2	6	3551163	3551168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807310
58510	NC_008258	CAT	2	6	3551193	3551198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807310
58511	NC_008258	CCGTG	2	10	3551240	3551249	0 %	20 %	40 %	40 %	110807310
58512	NC_008258	TGT	2	6	3551303	3551308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807310
58513	NC_008258	TGA	2	6	3551309	3551314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807310
58514	NC_008258	GC	3	6	3551409	3551414	0 %	0 %	50 %	50 %	110807310
58515	NC_008258	TTCAC	2	10	3551425	3551434	20 %	40 %	0 %	40 %	110807310
58516	NC_008258	ATA	2	6	3551440	3551445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110807310
58517	NC_008258	CATC	2	8	3551597	3551604	25 %	25 %	0 %	50 %	110807310
58518	NC_008258	CGG	2	6	3551609	3551614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807310
58519	NC_008258	ATC	2	6	3551617	3551622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807310
58520	NC_008258	ACACCG	2	12	3551750	3551761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	110807310
58521	NC_008258	CAT	2	6	3551856	3551861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807310
58522	NC_008258	T	6	6	3551870	3551875	0 %	100 %	0 %	0 %	110807311
58523	NC_008258	CAG	3	9	3551876	3551884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58524	NC_008258	TCAG	2	8	3551946	3551953	25 %	25 %	25 %	25 %	110807311
58525	NC_008258	GATC	2	8	3552055	3552062	25 %	25 %	25 %	25 %	110807311
58526	NC_008258	GGC	2	6	3552116	3552121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807311
58527	NC_008258	CAG	2	6	3552149	3552154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58528	NC_008258	ATG	2	6	3552171	3552176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807311
58529	NC_008258	CAG	2	6	3552182	3552187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58530	NC_008258	CGC	2	6	3552188	3552193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807311
58531	NC_008258	CAAACA	2	12	3552232	3552243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807311
58532	NC_008258	GTG	2	6	3552327	3552332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807311
58533	NC_008258	CAC	2	6	3552377	3552382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807311
58534	NC_008258	ATC	3	9	3552408	3552416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807311
58535	NC_008258	CCG	2	6	3552433	3552438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807311
58536	NC_008258	TCA	2	6	3552496	3552501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807311
58537	NC_008258	TGGC	2	8	3552510	3552517	0 %	25 %	50 %	25 %	110807311
58538	NC_008258	CG	3	6	3552648	3552653	0 %	0 %	50 %	50 %	110807311
58539	NC_008258	CGCA	2	8	3552704	3552711	25 %	0 %	25 %	50 %	110807311
58540	NC_008258	CGA	2	6	3552714	3552719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58541	NC_008258	GCG	2	6	3552742	3552747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807311
58542	NC_008258	CGG	2	6	3552948	3552953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807311
58543	NC_008258	GTGG	2	8	3552998	3553005	0 %	25 %	75 %	0 %	110807311
58544	NC_008258	GCG	2	6	3553021	3553026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807311
58545	NC_008258	CTGCC	2	10	3553043	3553052	0 %	20 %	20 %	60 %	110807311
58546	NC_008258	GGC	2	6	3553091	3553096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807311
58547	NC_008258	GTGG	2	8	3553196	3553203	0 %	25 %	75 %	0 %	110807311
58548	NC_008258	GA	3	6	3553233	3553238	50 %	0 %	50 %	0 %	110807311
58549	NC_008258	CACCGC	2	12	3553328	3553339	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	110807311
58550	NC_008258	CGT	2	6	3553396	3553401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58551	NC_008258	CGCT	2	8	3553413	3553420	0 %	25 %	25 %	50 %	110807311
58552	NC_008258	CG	3	6	3553434	3553439	0 %	0 %	50 %	50 %	110807311
58553	NC_008258	AAAC	2	8	3553463	3553470	75 %	0 %	0 %	25 %	110807311
58554	NC_008258	ACG	2	6	3553544	3553549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58555	NC_008258	GCA	2	6	3553615	3553620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58556	NC_008258	TGG	3	9	3553639	3553647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807311
58557	NC_008258	CG	3	6	3553753	3553758	0 %	0 %	50 %	50 %	110807311
58558	NC_008258	TAA	2	6	3553846	3553851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110807311
58559	NC_008258	CTT	2	6	3553855	3553860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807311
58560	NC_008258	TGC	2	6	3553881	3553886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58561	NC_008258	CCAG	2	8	3553939	3553946	25 %	0 %	25 %	50 %	110807311
58562	NC_008258	GTT	2	6	3554067	3554072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807311
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58564	NC_008258	GCA	2	6	3554114	3554119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58565	NC_008258	CCG	2	6	3554142	3554147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807311
58566	NC_008258	CAG	2	6	3554198	3554203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807311
58567	NC_008258	CCGCT	2	10	3554222	3554231	0 %	20 %	20 %	60 %	110807311
58568	NC_008258	GCGA	2	8	3554249	3554256	25 %	0 %	50 %	25 %	110807311
58569	NC_008258	A	6	6	3554256	3554261	100 %	0 %	0 %	0 %	110807311
58570	NC_008258	CAC	3	9	3554381	3554389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807311
58571	NC_008258	CGCC	2	8	3554542	3554549	0 %	0 %	25 %	75 %	110807311
58572	NC_008258	CGGGA	2	10	3554564	3554573	20 %	0 %	60 %	20 %	110807311
58573	NC_008258	CAC	2	6	3554605	3554610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807312
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58576	NC_008258	TGC	2	6	3554690	3554695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807312
58577	NC_008258	GAA	2	6	3554899	3554904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110807312
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58580	NC_008258	GCT	2	6	3555065	3555070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807312
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58582	NC_008258	GCG	3	9	3555179	3555187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807312
58583	NC_008258	GTC	2	6	3555190	3555195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807312
58584	NC_008258	GCGA	2	8	3555230	3555237	25 %	0 %	50 %	25 %	110807312
58585	NC_008258	TTGA	2	8	3555286	3555293	25 %	50 %	25 %	0 %	110807312
58586	NC_008258	GCG	2	6	3555347	3555352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807312
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58589	NC_008258	CCG	2	6	3555567	3555572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807312
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58600	NC_008258	ATG	2	6	3556398	3556403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807313
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58602	NC_008258	TCA	2	6	3556456	3556461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807313
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58605	NC_008258	ATT	2	6	3556534	3556539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807313
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58613	NC_008258	TCT	2	6	3556930	3556935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807313
58614	NC_008258	CAT	2	6	3557207	3557212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807313
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58968	NC_008258	GAA	2	6	3580250	3580255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110807333
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58970	NC_008258	GCT	2	6	3580375	3580380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807333
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