MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57502	NC_008258	CGA	2	6	3496432	3496437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807260
57503	NC_008258	CAA	2	6	3496484	3496489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807260
57504	NC_008258	TGG	2	6	3496509	3496514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110807260
57505	NC_008258	GCA	2	6	3496522	3496527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807260
57506	NC_008258	CGT	2	6	3496542	3496547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807260
57507	NC_008258	CAT	2	6	3496781	3496786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807261
57508	NC_008258	TTG	2	6	3496886	3496891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807261
57509	NC_008258	AGCCC	2	10	3496930	3496939	20 %	0 %	20 %	60 %	110807261
57510	NC_008258	A	6	6	3496962	3496967	100 %	0 %	0 %	0 %	110807261
57511	NC_008258	A	6	6	3496990	3496995	100 %	0 %	0 %	0 %	110807261
57512	NC_008258	ATT	2	6	3497035	3497040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807261
57513	NC_008258	CAGT	2	8	3497149	3497156	25 %	25 %	25 %	25 %	110807262
57514	NC_008258	ACTG	2	8	3497163	3497170	25 %	25 %	25 %	25 %	110807262
57515	NC_008258	CCCTTC	2	12	3497230	3497241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110807262
57516	NC_008258	TCG	2	6	3497242	3497247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807262
57517	NC_008258	TCA	2	6	3497326	3497331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807262
57518	NC_008258	TCA	2	6	3497338	3497343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807262
57519	NC_008258	ATC	2	6	3497412	3497417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807262
57520	NC_008258	TCC	2	6	3497582	3497587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110807262
57521	NC_008258	CGTC	2	8	3497602	3497609	0 %	25 %	25 %	50 %	110807262
57522	NC_008258	CAG	2	6	3497618	3497623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807262
57523	NC_008258	CAG	2	6	3497654	3497659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807262
57524	NC_008258	T	6	6	3497694	3497699	0 %	100 %	0 %	0 %	110807262
57525	NC_008258	GAT	2	6	3497731	3497736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807262
57526	NC_008258	ATC	2	6	3497790	3497795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807262
57527	NC_008258	TAA	2	6	3497847	3497852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110807262
57528	NC_008258	TTC	2	6	3497925	3497930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807262
57529	NC_008258	CAG	2	6	3497954	3497959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807262
57530	NC_008258	AC	3	6	3498079	3498084	50 %	0 %	0 %	50 %	110807262
57531	NC_008258	CAG	2	6	3498095	3498100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807262
57532	NC_008258	GCG	2	6	3498124	3498129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807262
57533	NC_008258	GCA	2	6	3498245	3498250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807263
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57535	NC_008258	CAT	2	6	3498324	3498329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807263
57536	NC_008258	GGCAA	2	10	3498375	3498384	40 %	0 %	40 %	20 %	110807263
57537	NC_008258	GA	3	6	3498386	3498391	50 %	0 %	50 %	0 %	110807263
57538	NC_008258	A	7	7	3498486	3498492	100 %	0 %	0 %	0 %	110807263
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57542	NC_008258	GTA	2	6	3498909	3498914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807264
57543	NC_008258	GAC	2	6	3498935	3498940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807264
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57545	NC_008258	CTT	2	6	3498953	3498958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807264
57546	NC_008258	CAGA	2	8	3499115	3499122	50 %	0 %	25 %	25 %	110807264
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57550	NC_008258	GCC	2	6	3499276	3499281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807264
57551	NC_008258	CG	3	6	3499301	3499306	0 %	0 %	50 %	50 %	110807264
57552	NC_008258	TCA	2	6	3499370	3499375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807264
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57569	NC_008258	CAT	2	6	3500055	3500060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807264
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57583	NC_008258	CGC	2	6	3501404	3501409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807265
57584	NC_008258	ATGCG	2	10	3501415	3501424	20 %	20 %	40 %	20 %	110807265
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57588	NC_008258	CTGG	2	8	3501591	3501598	0 %	25 %	50 %	25 %	110807265
57589	NC_008258	CAC	2	6	3501609	3501614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807265
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57604	NC_008258	CG	3	6	3502540	3502545	0 %	0 %	50 %	50 %	110807266
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57612	NC_008258	AGAAC	2	10	3502744	3502753	60 %	0 %	20 %	20 %	110807266
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