MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_008048	TGA	2	6	658104	658109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486137
16003	NC_008048	GTCGT	2	10	658154	658163	0 %	40 %	40 %	20 %	103486137
16004	NC_008048	GGC	2	6	658204	658209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486137
16005	NC_008048	GAC	2	6	658228	658233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486137
16006	NC_008048	GGC	2	6	658431	658436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486137
16007	NC_008048	TCG	2	6	658448	658453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486137
16008	NC_008048	CTG	2	6	658516	658521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486137
16009	NC_008048	TCGCG	2	10	658539	658548	0 %	20 %	40 %	40 %	103486137
16010	NC_008048	CGA	2	6	658551	658556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486137
16011	NC_008048	CGC	2	6	658615	658620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486137
16012	NC_008048	CCGTG	2	10	658647	658656	0 %	20 %	40 %	40 %	103486137
16013	NC_008048	CGG	2	6	658676	658681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486137
16014	NC_008048	CGT	2	6	658711	658716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486137
16015	NC_008048	CG	4	8	658755	658762	0 %	0 %	50 %	50 %	103486137
16016	NC_008048	CG	3	6	658815	658820	0 %	0 %	50 %	50 %	103486137
16017	NC_008048	GCC	2	6	658841	658846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486137
16018	NC_008048	AGC	2	6	658847	658852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486137
16019	NC_008048	AGG	2	6	659157	659162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486138
16020	NC_008048	TCA	2	6	659173	659178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486138
16021	NC_008048	CCG	2	6	659179	659184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486138
16022	NC_008048	ATA	2	6	659192	659197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	103486138
16023	NC_008048	CGC	2	6	659246	659251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486138
16024	NC_008048	TG	3	6	659319	659324	0 %	50 %	50 %	0 %	103486138
16025	NC_008048	CGA	2	6	659341	659346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486138
16026	NC_008048	GCGATC	2	12	659373	659384	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	103486138
16027	NC_008048	CG	3	6	659413	659418	0 %	0 %	50 %	50 %	103486138
16028	NC_008048	CCG	2	6	659440	659445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486138
16029	NC_008048	CAC	2	6	659555	659560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103486138
16030	NC_008048	CGC	2	6	659610	659615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486139
16031	NC_008048	ACG	2	6	659670	659675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486139
16032	NC_008048	CGC	2	6	659678	659683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486139
16033	NC_008048	GAT	2	6	659696	659701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486139
16034	NC_008048	GCG	3	9	659724	659732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486139
16035	NC_008048	GCGCG	2	10	659735	659744	0 %	0 %	60 %	40 %	103486139
16036	NC_008048	GGC	2	6	659755	659760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486139
16037	NC_008048	CTC	2	6	659787	659792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103486139
16038	NC_008048	TCGCG	2	10	659818	659827	0 %	20 %	40 %	40 %	103486139
16039	NC_008048	CG	3	6	659851	659856	0 %	0 %	50 %	50 %	103486139
16040	NC_008048	GCG	2	6	659894	659899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486139
16041	NC_008048	GCC	2	6	659968	659973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486139
16042	NC_008048	TGATC	2	10	659975	659984	20 %	40 %	20 %	20 %	103486139
16043	NC_008048	A	6	6	660001	660006	100 %	0 %	0 %	0 %	103486139
16044	NC_008048	CG	3	6	660024	660029	0 %	0 %	50 %	50 %	103486139
16045	NC_008048	CAGC	2	8	660045	660052	25 %	0 %	25 %	50 %	103486139
16046	NC_008048	GCG	2	6	660059	660064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486139
16047	NC_008048	GCG	2	6	660078	660083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486139
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16050	NC_008048	CGA	2	6	660385	660390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486140
16051	NC_008048	GCG	2	6	660396	660401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486140
16052	NC_008048	GGGC	2	8	660429	660436	0 %	0 %	75 %	25 %	103486140
16053	NC_008048	CG	3	6	660527	660532	0 %	0 %	50 %	50 %	103486140
16054	NC_008048	ATC	2	6	660661	660666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486141
16055	NC_008048	GCTG	2	8	660668	660675	0 %	25 %	50 %	25 %	103486141
16056	NC_008048	CTT	2	6	660735	660740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103486141
16057	NC_008048	CGT	2	6	660786	660791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486141
16058	NC_008048	GCG	2	6	660794	660799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486141
16059	NC_008048	CGA	2	6	660861	660866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486141
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16061	NC_008048	TCA	2	6	660957	660962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486142
16062	NC_008048	GC	3	6	661019	661024	0 %	0 %	50 %	50 %	103486142
16063	NC_008048	TCG	2	6	661047	661052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486142
16064	NC_008048	CGA	2	6	661185	661190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486142
16065	NC_008048	TGA	2	6	661212	661217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486142
16066	NC_008048	CGC	2	6	661251	661256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486142
16067	NC_008048	GATC	2	8	661330	661337	25 %	25 %	25 %	25 %	103486142
16068	NC_008048	GAC	2	6	661361	661366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486142
16069	NC_008048	GC	3	6	661397	661402	0 %	0 %	50 %	50 %	103486142
16070	NC_008048	TCA	2	6	661404	661409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486142
16071	NC_008048	GCG	2	6	661427	661432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486142
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16073	NC_008048	TGA	2	6	661476	661481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486142
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16076	NC_008048	TA	3	6	661589	661594	50 %	50 %	0 %	0 %	103486142
16077	NC_008048	GC	3	6	661621	661626	0 %	0 %	50 %	50 %	103486142
16078	NC_008048	CG	4	8	661636	661643	0 %	0 %	50 %	50 %	103486142
16079	NC_008048	TGC	2	6	661647	661652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486142
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16084	NC_008048	GAG	2	6	661781	661786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486142
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16086	NC_008048	CGT	2	6	662101	662106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486143
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16088	NC_008048	TCA	2	6	662179	662184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486143
16089	NC_008048	TCG	2	6	662343	662348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486143
16090	NC_008048	CGGG	2	8	662400	662407	0 %	0 %	75 %	25 %	103486143
16091	NC_008048	GGGCG	2	10	662421	662430	0 %	0 %	80 %	20 %	103486143
16092	NC_008048	CG	4	8	662436	662443	0 %	0 %	50 %	50 %	103486143
16093	NC_008048	CCA	2	6	662490	662495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103486143
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16099	NC_008048	GGA	2	6	662668	662673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486143
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16101	NC_008048	CGC	2	6	662715	662720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486143
16102	NC_008048	GCC	2	6	662827	662832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486143
16103	NC_008048	GC	4	8	663096	663103	0 %	0 %	50 %	50 %	103486144
16104	NC_008048	GAG	2	6	663114	663119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486144
16105	NC_008048	AAC	2	6	663239	663244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103486144
16106	NC_008048	CG	4	8	663248	663255	0 %	0 %	50 %	50 %	103486144
16107	NC_008048	GGC	2	6	663261	663266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486144
16108	NC_008048	GGCA	2	8	663349	663356	25 %	0 %	50 %	25 %	103486144
16109	NC_008048	GCC	2	6	663357	663362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486144
16110	NC_008048	CGGCT	2	10	663367	663376	0 %	20 %	40 %	40 %	103486144
16111	NC_008048	GCGG	2	8	663397	663404	0 %	0 %	75 %	25 %	103486144
16112	NC_008048	GGCGTC	2	12	663418	663429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	103486144
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16114	NC_008048	A	6	6	663484	663489	100 %	0 %	0 %	0 %	103486145
16115	NC_008048	GCT	2	6	663492	663497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486145
16116	NC_008048	GCC	2	6	663505	663510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486145
16117	NC_008048	GGC	2	6	663543	663548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486145
16118	NC_008048	GGGCA	2	10	663550	663559	20 %	0 %	60 %	20 %	103486145
16119	NC_008048	GCGCCC	2	12	663574	663585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486145
16120	NC_008048	CGA	2	6	663603	663608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486145
16121	NC_008048	TCC	2	6	663628	663633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103486145
16122	NC_008048	CG	5	10	663661	663670	0 %	0 %	50 %	50 %	103486145
16123	NC_008048	CG	4	8	663710	663717	0 %	0 %	50 %	50 %	103486145
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16360	NC_008048	AAGC	2	8	672315	672322	50 %	0 %	25 %	25 %	103486154
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16478	NC_008048	GAT	2	6	676433	676438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486157
16479	NC_008048	CGC	2	6	676481	676486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486157
16480	NC_008048	CGT	2	6	676532	676537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486157
16481	NC_008048	GTC	2	6	676572	676577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486157
16482	NC_008048	GCGCG	2	10	676624	676633	0 %	0 %	60 %	40 %	103486157
16483	NC_008048	TCA	2	6	676705	676710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486157
16484	NC_008048	TCC	2	6	676744	676749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103486157
16485	NC_008048	CATTTC	2	12	676824	676835	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	103486157
16486	NC_008048	CG	3	6	676844	676849	0 %	0 %	50 %	50 %	103486157
16487	NC_008048	TCG	2	6	676923	676928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486158
16488	NC_008048	AAG	2	6	676931	676936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103486158
16489	NC_008048	CGC	2	6	676975	676980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486158
16490	NC_008048	CGG	2	6	676985	676990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486158
16491	NC_008048	TCG	2	6	677046	677051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486158
16492	NC_008048	CGC	2	6	677071	677076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486158
16493	NC_008048	GC	3	6	677265	677270	0 %	0 %	50 %	50 %	103486159
16494	NC_008048	CGC	2	6	677283	677288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486159
16495	NC_008048	CAG	2	6	677289	677294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486159
16496	NC_008048	GCC	2	6	677304	677309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486159
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16498	NC_008048	ACG	2	6	677365	677370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486159
16499	NC_008048	CG	3	6	677415	677420	0 %	0 %	50 %	50 %	103486159
16500	NC_008048	CGT	2	6	677454	677459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486159

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