MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008048	CGT	2	6	542094	542099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486019
13002	NC_008048	GGC	2	6	542133	542138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486019
13003	NC_008048	AAG	2	6	542230	542235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103486019
13004	NC_008048	GTC	3	9	542248	542256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486019
13005	NC_008048	GAG	2	6	542257	542262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486019
13006	NC_008048	CGA	2	6	542322	542327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486019
13007	NC_008048	AAC	2	6	542383	542388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103486019
13008	NC_008048	CGC	2	6	542414	542419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486019
13009	NC_008048	GTG	2	6	542422	542427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486019
13010	NC_008048	CGG	2	6	542429	542434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486019
13011	NC_008048	CG	3	6	542584	542589	0 %	0 %	50 %	50 %	103486020
13012	NC_008048	GCGCG	2	10	542610	542619	0 %	0 %	60 %	40 %	103486020
13013	NC_008048	GGC	2	6	542627	542632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486020
13014	NC_008048	CGC	2	6	542645	542650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486020
13015	NC_008048	TGC	2	6	542665	542670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13016	NC_008048	CG	4	8	542675	542682	0 %	0 %	50 %	50 %	103486020
13017	NC_008048	TGG	2	6	542712	542717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486020
13018	NC_008048	ATG	2	6	542724	542729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486020
13019	NC_008048	GGC	2	6	542738	542743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486020
13020	NC_008048	CTG	2	6	542749	542754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13021	NC_008048	GCT	2	6	542774	542779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13022	NC_008048	GGGC	2	8	542810	542817	0 %	0 %	75 %	25 %	103486020
13023	NC_008048	TCG	2	6	542827	542832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13024	NC_008048	TGC	2	6	542848	542853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13025	NC_008048	GC	3	6	542899	542904	0 %	0 %	50 %	50 %	103486020
13026	NC_008048	GGC	2	6	542922	542927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486020
13027	NC_008048	GCG	2	6	542935	542940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486020
13028	NC_008048	CGT	2	6	542972	542977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13029	NC_008048	CGC	2	6	543039	543044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486020
13030	NC_008048	GC	3	6	543059	543064	0 %	0 %	50 %	50 %	103486020
13031	NC_008048	CTG	2	6	543066	543071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13032	NC_008048	GCA	2	6	543099	543104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13033	NC_008048	GCGAA	2	10	543125	543134	40 %	0 %	40 %	20 %	103486020
13034	NC_008048	TGC	2	6	543139	543144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
13035	NC_008048	TCGAT	2	10	543283	543292	20 %	40 %	20 %	20 %	103486021
13036	NC_008048	GC	3	6	543297	543302	0 %	0 %	50 %	50 %	103486021
13037	NC_008048	CGC	2	6	543310	543315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486021
13038	NC_008048	GCT	2	6	543347	543352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486021
13039	NC_008048	CG	3	6	543410	543415	0 %	0 %	50 %	50 %	103486021
13040	NC_008048	CATC	2	8	543455	543462	25 %	25 %	0 %	50 %	103486021
13041	NC_008048	CCG	2	6	543523	543528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486021
13042	NC_008048	GGC	2	6	543570	543575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486021
13043	NC_008048	CGA	2	6	543623	543628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486021
13044	NC_008048	TCG	2	6	543634	543639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486021
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13046	NC_008048	CG	7	14	543677	543690	0 %	0 %	50 %	50 %	103486021
13047	NC_008048	GGT	2	6	543704	543709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486021
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13050	NC_008048	GC	3	6	543786	543791	0 %	0 %	50 %	50 %	103486021
13051	NC_008048	CTG	2	6	543855	543860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486021
13052	NC_008048	AGGG	2	8	543952	543959	25 %	0 %	75 %	0 %	103486021
13053	NC_008048	C	6	6	543987	543992	0 %	0 %	0 %	100 %	103486022
13054	NC_008048	CGC	2	6	544081	544086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486022
13055	NC_008048	CGC	2	6	544126	544131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486022
13056	NC_008048	TCT	2	6	544134	544139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103486022
13057	NC_008048	TCG	2	6	544147	544152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486022
13058	NC_008048	CGC	2	6	544153	544158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486022
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13061	NC_008048	GCCGA	2	10	544414	544423	20 %	0 %	40 %	40 %	103486023
13062	NC_008048	AGC	2	6	544519	544524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486023
13063	NC_008048	GC	3	6	544523	544528	0 %	0 %	50 %	50 %	103486023
13064	NC_008048	CGA	2	6	544574	544579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486023
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13069	NC_008048	GC	3	6	544707	544712	0 %	0 %	50 %	50 %	103486023
13070	NC_008048	CAC	2	6	544729	544734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103486023
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13088	NC_008048	CGG	2	6	545300	545305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486023
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13091	NC_008048	CGC	2	6	545733	545738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486024
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13097	NC_008048	ATATT	2	10	545980	545989	40 %	60 %	0 %	0 %	103486024
13098	NC_008048	CGC	2	6	546039	546044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486024
13099	NC_008048	GAG	2	6	546085	546090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486024
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13101	NC_008048	ATG	2	6	546127	546132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486024
13102	NC_008048	ACC	2	6	546181	546186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103486024
13103	NC_008048	CGG	2	6	546197	546202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486024
13104	NC_008048	GTT	2	6	546243	546248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103486024
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13107	NC_008048	GCC	2	6	546327	546332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486024
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13109	NC_008048	CGCGG	2	10	546354	546363	0 %	0 %	60 %	40 %	103486024
13110	NC_008048	ACC	2	6	546373	546378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103486024
13111	NC_008048	CG	3	6	546410	546415	0 %	0 %	50 %	50 %	103486024
13112	NC_008048	CCG	2	6	546418	546423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486024
13113	NC_008048	GCGCC	2	10	546445	546454	0 %	0 %	40 %	60 %	103486024
13114	NC_008048	CGC	2	6	546488	546493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486024
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13119	NC_008048	GC	4	8	546799	546806	0 %	0 %	50 %	50 %	103486025
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13229	NC_008048	GGGC	2	8	551153	551160	0 %	0 %	75 %	25 %	103486029
13230	NC_008048	CAACCT	2	12	551182	551193	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	103486029
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13233	NC_008048	CGC	2	6	551243	551248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486029
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13239	NC_008048	TCG	2	6	551478	551483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486030
13240	NC_008048	TGA	2	6	551565	551570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486030
13241	NC_008048	GTC	2	6	551606	551611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486030
13242	NC_008048	AGC	2	6	551630	551635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486030
13243	NC_008048	AGC	2	6	551663	551668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486030
13244	NC_008048	CCGAC	2	10	551685	551694	20 %	0 %	20 %	60 %	103486030
13245	NC_008048	AGC	2	6	551717	551722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486030
13246	NC_008048	CGC	2	6	551728	551733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486030
13247	NC_008048	ATA	2	6	551860	551865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	103486030
13248	NC_008048	TCA	2	6	551889	551894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486030
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13260	NC_008048	CCG	2	6	552327	552332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486030
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13322	NC_008048	GCGCG	3	15	554468	554482	0 %	0 %	60 %	40 %	103486033
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13325	NC_008048	CGC	2	6	554551	554556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486033
13326	NC_008048	GGA	2	6	554579	554584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486033
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13329	NC_008048	ATC	2	6	554661	554666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486034
13330	NC_008048	GGGCT	2	10	554682	554691	0 %	20 %	60 %	20 %	103486034
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13333	NC_008048	GCGG	2	8	554830	554837	0 %	0 %	75 %	25 %	103486034
13334	NC_008048	GGT	2	6	554915	554920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486034
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13341	NC_008048	AT	3	6	555239	555244	50 %	50 %	0 %	0 %	103486034
13342	NC_008048	CGCT	2	8	555246	555253	0 %	25 %	25 %	50 %	103486034
13343	NC_008048	CG	5	10	555266	555275	0 %	0 %	50 %	50 %	103486034
13344	NC_008048	CCG	2	6	555305	555310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486034
13345	NC_008048	CG	3	6	555339	555344	0 %	0 %	50 %	50 %	103486034
13346	NC_008048	ATT	2	6	555396	555401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	103486034
13347	NC_008048	GCAC	2	8	555499	555506	25 %	0 %	25 %	50 %	103486034
13348	NC_008048	GACGC	2	10	555523	555532	20 %	0 %	40 %	40 %	103486034
13349	NC_008048	CCG	2	6	555641	555646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486035
13350	NC_008048	TCA	2	6	555662	555667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486035
13351	NC_008048	ACCG	2	8	555727	555734	25 %	0 %	25 %	50 %	103486035
13352	NC_008048	TGA	2	6	555800	555805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486035
13353	NC_008048	CAA	2	6	555810	555815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103486035
13354	NC_008048	CCT	2	6	555825	555830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103486035
13355	NC_008048	AAG	2	6	555844	555849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103486035
13356	NC_008048	A	6	6	556105	556110	100 %	0 %	0 %	0 %	103486036
13357	NC_008048	ATCG	2	8	556113	556120	25 %	25 %	25 %	25 %	103486036
13358	NC_008048	GCG	2	6	556127	556132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486036
13359	NC_008048	GTC	2	6	556207	556212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486036
13360	NC_008048	CCG	2	6	556226	556231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486036
13361	NC_008048	CGG	2	6	556314	556319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486036
13362	NC_008048	CCGC	2	8	556389	556396	0 %	0 %	25 %	75 %	103486036
13363	NC_008048	CGC	2	6	556488	556493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486036
13364	NC_008048	CG	4	8	556545	556552	0 %	0 %	50 %	50 %	103486036
13365	NC_008048	AT	3	6	556572	556577	50 %	50 %	0 %	0 %	103486036
13366	NC_008048	CGAC	2	8	556586	556593	25 %	0 %	25 %	50 %	103486036
13367	NC_008048	GACCTC	2	12	556612	556623	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	103486036
13368	NC_008048	GTC	2	6	556624	556629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486036
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13372	NC_008048	ACG	2	6	556718	556723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486036
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13473	NC_008048	ACCG	2	8	560480	560487	25 %	0 %	25 %	50 %	103486039
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13479	NC_008048	CGG	2	6	560652	560657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486039
13480	NC_008048	GCT	2	6	560659	560664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486039
13481	NC_008048	CGG	2	6	560674	560679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486039
13482	NC_008048	ACG	2	6	560706	560711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486039
13483	NC_008048	GCT	2	6	560719	560724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486039
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13491	NC_008048	CGG	2	6	561022	561027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486039
13492	NC_008048	GCT	2	6	561034	561039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486039
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13499	NC_008048	CG	3	6	561167	561172	0 %	0 %	50 %	50 %	103486039
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