MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 35285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008022	GCA	2	6	1037745	1037750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19003	NC_008022	CAG	2	6	1037773	1037778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19004	NC_008022	ATC	2	6	1037792	1037797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990600
19005	NC_008022	A	6	6	1037826	1037831	100 %	0 %	0 %	0 %	94990600
19006	NC_008022	TCT	3	9	1037859	1037867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990600
19007	NC_008022	TTC	2	6	1037912	1037917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990600
19008	NC_008022	GGCTT	2	10	1037933	1037942	0 %	40 %	40 %	20 %	94990600
19009	NC_008022	T	6	6	1037983	1037988	0 %	100 %	0 %	0 %	94990600
19010	NC_008022	TGC	2	6	1038080	1038085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19011	NC_008022	GCT	2	6	1038120	1038125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19012	NC_008022	TAA	2	6	1038128	1038133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990600
19013	NC_008022	CAG	2	6	1038235	1038240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19014	NC_008022	CAA	2	6	1038247	1038252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990600
19015	NC_008022	CTT	2	6	1038346	1038351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990600
19016	NC_008022	T	6	6	1038405	1038410	0 %	100 %	0 %	0 %	94990600
19017	NC_008022	TCA	2	6	1038468	1038473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990600
19018	NC_008022	TAA	2	6	1038483	1038488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990600
19019	NC_008022	GTT	2	6	1038493	1038498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990600
19020	NC_008022	CGT	2	6	1038559	1038564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19021	NC_008022	GCT	2	6	1038567	1038572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19022	NC_008022	TCT	2	6	1038603	1038608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990600
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19024	NC_008022	CAA	2	6	1038706	1038711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990600
19025	NC_008022	TGGT	2	8	1038765	1038772	0 %	50 %	50 %	0 %	94990600
19026	NC_008022	GCT	2	6	1038808	1038813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990600
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19029	NC_008022	ATC	2	6	1038872	1038877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990600
19030	NC_008022	CGT	2	6	1038897	1038902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990600
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19032	NC_008022	CAG	2	6	1038955	1038960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990600
19033	NC_008022	TCA	2	6	1038981	1038986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990600
19034	NC_008022	TCA	2	6	1039078	1039083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990600
19035	NC_008022	CGTT	2	8	1039085	1039092	0 %	50 %	25 %	25 %	94990600
19036	NC_008022	ACG	2	6	1039148	1039153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990600
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19038	NC_008022	TAG	2	6	1039201	1039206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990600
19039	NC_008022	CTTT	2	8	1039227	1039234	0 %	75 %	0 %	25 %	94990600
19040	NC_008022	TTA	2	6	1039251	1039256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990600
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19043	NC_008022	TGCC	2	8	1039400	1039407	0 %	25 %	25 %	50 %	94990600
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19045	NC_008022	TAA	2	6	1039424	1039429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990600
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19047	NC_008022	AGTCTT	2	12	1039859	1039870	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94990601
19048	NC_008022	T	6	6	1039869	1039874	0 %	100 %	0 %	0 %	94990601
19049	NC_008022	AAAG	2	8	1039912	1039919	75 %	0 %	25 %	0 %	94990601
19050	NC_008022	T	6	6	1039927	1039932	0 %	100 %	0 %	0 %	94990601
19051	NC_008022	GA	3	6	1039959	1039964	50 %	0 %	50 %	0 %	94990601
19052	NC_008022	GAT	2	6	1039967	1039972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990601
19053	NC_008022	AATT	2	8	1039984	1039991	50 %	50 %	0 %	0 %	94990602
19054	NC_008022	TTGG	2	8	1040028	1040035	0 %	50 %	50 %	0 %	94990602
19055	NC_008022	TTACC	2	10	1040045	1040054	20 %	40 %	0 %	40 %	94990602
19056	NC_008022	T	6	6	1040107	1040112	0 %	100 %	0 %	0 %	94990602
19057	NC_008022	TGC	2	6	1040147	1040152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990602
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19059	NC_008022	TGG	2	6	1040222	1040227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990602
19060	NC_008022	T	7	7	1040261	1040267	0 %	100 %	0 %	0 %	94990602
19061	NC_008022	TGG	2	6	1040342	1040347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990602
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19063	NC_008022	TGG	2	6	1040555	1040560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990602
19064	NC_008022	CATT	2	8	1040561	1040568	25 %	50 %	0 %	25 %	94990602
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19066	NC_008022	TCTA	2	8	1040621	1040628	25 %	50 %	0 %	25 %	94990602
19067	NC_008022	CAG	2	6	1040655	1040660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990602
19068	NC_008022	GCT	2	6	1040709	1040714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990602
19069	NC_008022	TCT	2	6	1040776	1040781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990602
19070	NC_008022	TGC	2	6	1040813	1040818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990602
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19074	NC_008022	TGGAC	2	10	1040937	1040946	20 %	20 %	40 %	20 %	94990602
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19089	NC_008022	TTA	2	6	1041681	1041686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990603
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19091	NC_008022	TGTTA	2	10	1041796	1041805	20 %	60 %	20 %	0 %	94990603
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19100	NC_008022	TGAT	2	8	1042392	1042399	25 %	50 %	25 %	0 %	94990603
19101	NC_008022	TAT	2	6	1042448	1042453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990603
19102	NC_008022	A	6	6	1042494	1042499	100 %	0 %	0 %	0 %	94990603
19103	NC_008022	CCA	2	6	1042579	1042584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990603
19104	NC_008022	CA	4	8	1042616	1042623	50 %	0 %	0 %	50 %	94990603
19105	NC_008022	TTG	2	6	1043072	1043077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990604
19106	NC_008022	TG	3	6	1043115	1043120	0 %	50 %	50 %	0 %	94990604
19107	NC_008022	TTTC	2	8	1043178	1043185	0 %	75 %	0 %	25 %	94990604
19108	NC_008022	TTTA	2	8	1043207	1043214	25 %	75 %	0 %	0 %	94990604
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19116	NC_008022	CAT	2	6	1044184	1044189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990605
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19237	NC_008022	TTG	2	6	1050437	1050442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990611
19238	NC_008022	AAT	2	6	1050459	1050464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990611
19239	NC_008022	AAT	2	6	1050656	1050661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990611
19240	NC_008022	CGT	2	6	1050664	1050669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990611
19241	NC_008022	CAT	2	6	1050736	1050741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990611
19242	NC_008022	CTACTT	2	12	1050760	1050771	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94990611
19243	NC_008022	TTGA	2	8	1050823	1050830	25 %	50 %	25 %	0 %	94990611
19244	NC_008022	T	6	6	1050856	1050861	0 %	100 %	0 %	0 %	94990611
19245	NC_008022	CAT	2	6	1050889	1050894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990611
19246	NC_008022	TCT	2	6	1050966	1050971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990611
19247	NC_008022	AATT	2	8	1051058	1051065	50 %	50 %	0 %	0 %	94990611
19248	NC_008022	T	8	8	1051072	1051079	0 %	100 %	0 %	0 %	94990611
19249	NC_008022	TTC	2	6	1051085	1051090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990611
19250	NC_008022	TCT	2	6	1051119	1051124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990611
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19252	NC_008022	ACC	2	6	1051136	1051141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990611
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19254	NC_008022	ATT	2	6	1051311	1051316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990612
19255	NC_008022	AAT	2	6	1051320	1051325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990612
19256	NC_008022	CTT	2	6	1051331	1051336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990612
19257	NC_008022	CTT	2	6	1051358	1051363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990612
19258	NC_008022	CAA	2	6	1051388	1051393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990612
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19260	NC_008022	ACC	2	6	1051422	1051427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990612
19261	NC_008022	CTT	2	6	1051433	1051438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990612
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19264	NC_008022	CTT	2	6	1051559	1051564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990612
19265	NC_008022	TTG	2	6	1051658	1051663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990612
19266	NC_008022	CTT	2	6	1051688	1051693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990612
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19271	NC_008022	TACC	2	8	1051907	1051914	25 %	25 %	0 %	50 %	94990612
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19339	NC_008022	TTATCC	2	12	1055336	1055347	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94990613
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19342	NC_008022	T	9	9	1055585	1055593	0 %	100 %	0 %	0 %	94990614
19343	NC_008022	TGA	2	6	1055659	1055664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990614
19344	NC_008022	ATG	2	6	1055702	1055707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990614
19345	NC_008022	ATT	2	6	1055711	1055716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990614
19346	NC_008022	GTG	2	6	1055733	1055738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990614
19347	NC_008022	GGAA	2	8	1055824	1055831	50 %	0 %	50 %	0 %	94990614
19348	NC_008022	CTG	2	6	1055850	1055855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990614
19349	NC_008022	TGAC	2	8	1055865	1055872	25 %	25 %	25 %	25 %	94990614
19350	NC_008022	AATT	2	8	1055880	1055887	50 %	50 %	0 %	0 %	94990614
19351	NC_008022	AGG	2	6	1056000	1056005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94990614
19352	NC_008022	AAT	2	6	1056012	1056017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990614
19353	NC_008022	CAT	2	6	1056037	1056042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990615
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19475	NC_008022	TAA	2	6	1062308	1062313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990621
19476	NC_008022	TTC	2	6	1062431	1062436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990621
19477	NC_008022	ACC	2	6	1062462	1062467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990621
19478	NC_008022	GCT	2	6	1062601	1062606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990621
19479	NC_008022	TCA	2	6	1062615	1062620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990621
19480	NC_008022	GAT	2	6	1062641	1062646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990621
19481	NC_008022	AAT	2	6	1062681	1062686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990621
19482	NC_008022	CAG	2	6	1062736	1062741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990621
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19485	NC_008022	AAT	2	6	1063022	1063027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990621
19486	NC_008022	TTG	2	6	1063070	1063075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990621
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19490	NC_008022	ATG	2	6	1063136	1063141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990621
19491	NC_008022	GCT	2	6	1063146	1063151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990621
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19496	NC_008022	CTT	2	6	1063408	1063413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990621
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19498	NC_008022	TG	3	6	1063455	1063460	0 %	50 %	50 %	0 %	94990621
19499	NC_008022	TCG	2	6	1063507	1063512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990621
19500	NC_008022	GTTT	2	8	1063539	1063546	0 %	75 %	25 %	0 %	94990621

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