MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 33598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008021	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	94987632
2	NC_008021	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	94987632
3	NC_008021	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987632
4	NC_008021	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	94987632
5	NC_008021	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
6	NC_008021	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
7	NC_008021	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	94987632
8	NC_008021	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987632
9	NC_008021	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
10	NC_008021	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987632
11	NC_008021	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	94987632
12	NC_008021	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987632
13	NC_008021	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	94987632
14	NC_008021	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987632
15	NC_008021	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	94987632
16	NC_008021	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	94987632
17	NC_008021	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
18	NC_008021	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987632
19	NC_008021	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	94987632
20	NC_008021	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987632
21	NC_008021	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
22	NC_008021	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987632
23	NC_008021	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	94987632
24	NC_008021	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
25	NC_008021	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
26	NC_008021	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987632
27	NC_008021	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987632
28	NC_008021	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987632
29	NC_008021	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	94987632
30	NC_008021	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
31	NC_008021	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987633
32	NC_008021	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	94987633
33	NC_008021	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
34	NC_008021	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	94987633
35	NC_008021	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
36	NC_008021	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987633
37	NC_008021	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987633
38	NC_008021	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987633
39	NC_008021	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
40	NC_008021	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
41	NC_008021	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987633
42	NC_008021	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	94987633
43	NC_008021	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987633
44	NC_008021	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	94987633
45	NC_008021	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987633
46	NC_008021	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987633
47	NC_008021	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
48	NC_008021	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987633
49	NC_008021	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987633
50	NC_008021	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94987633
51	NC_008021	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	94987633
52	NC_008021	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987633
53	NC_008021	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	94987633
54	NC_008021	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	94987633
55	NC_008021	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94987634
56	NC_008021	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	94987634
57	NC_008021	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987634
58	NC_008021	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	94987634
59	NC_008021	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
60	NC_008021	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987635
61	NC_008021	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	94987635
62	NC_008021	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	94987635
63	NC_008021	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	94987635
64	NC_008021	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
65	NC_008021	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	94987635
66	NC_008021	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	94987635
67	NC_008021	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
68	NC_008021	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987635
69	NC_008021	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987635
70	NC_008021	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	94987635
71	NC_008021	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
72	NC_008021	AGA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
73	NC_008021	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
74	NC_008021	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
75	NC_008021	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987635
76	NC_008021	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
77	NC_008021	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987635
78	NC_008021	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987635
79	NC_008021	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
80	NC_008021	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
81	NC_008021	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
82	NC_008021	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987635
83	NC_008021	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987635
84	NC_008021	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987636
85	NC_008021	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987636
86	NC_008021	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	94987636
87	NC_008021	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987636
88	NC_008021	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987636
89	NC_008021	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987636
90	NC_008021	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987636
91	NC_008021	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987636
92	NC_008021	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987636
93	NC_008021	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94987636
94	NC_008021	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987636
95	NC_008021	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987636
96	NC_008021	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987636
97	NC_008021	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987636
98	NC_008021	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	94987636
99	NC_008021	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	94987636
100	NC_008021	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
101	NC_008021	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987637
102	NC_008021	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
103	NC_008021	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	94987637
104	NC_008021	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
105	NC_008021	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
106	NC_008021	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
107	NC_008021	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
108	NC_008021	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
109	NC_008021	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
110	NC_008021	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987637
111	NC_008021	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
112	NC_008021	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
113	NC_008021	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	94987637
114	NC_008021	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
115	NC_008021	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	94987637
116	NC_008021	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
117	NC_008021	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
118	NC_008021	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
119	NC_008021	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
120	NC_008021	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	94987637
121	NC_008021	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
122	NC_008021	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987637
123	NC_008021	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987637
124	NC_008021	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	94987637
125	NC_008021	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	94987637
126	NC_008021	A	7	7	6384	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	94987637
127	NC_008021	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987637
128	NC_008021	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	94987637
129	NC_008021	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	94987637
130	NC_008021	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
131	NC_008021	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987637
132	NC_008021	GATTCA	2	12	6733	6744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94987637
133	NC_008021	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987637
134	NC_008021	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987637
135	NC_008021	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
136	NC_008021	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
137	NC_008021	AAG	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
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275	NC_008021	A	7	7	12308	12314	100 %	0 %	0 %	0 %	94987643
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