MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007775	GCT	2	6	212596	212601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604931
4002	NC_007775	GCTG	2	8	212621	212628	0 %	25 %	50 %	25 %	86604931
4003	NC_007775	CTAGCT	2	12	212633	212644	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86604931
4004	NC_007775	CCA	2	6	212657	212662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604931
4005	NC_007775	AGG	2	6	212701	212706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604931
4006	NC_007775	A	6	6	212746	212751	100 %	0 %	0 %	0 %	86604931
4007	NC_007775	GTC	2	6	212856	212861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604931
4008	NC_007775	CCA	2	6	212894	212899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604931
4009	NC_007775	GCCC	2	8	212904	212911	0 %	0 %	25 %	75 %	86604931
4010	NC_007775	AAC	2	6	212920	212925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604931
4011	NC_007775	GC	3	6	213048	213053	0 %	0 %	50 %	50 %	86604931
4012	NC_007775	CGC	3	9	213051	213059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604931
4013	NC_007775	TGC	2	6	213073	213078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604931
4014	NC_007775	CGTC	2	8	213119	213126	0 %	25 %	25 %	50 %	86604931
4015	NC_007775	ATC	2	6	213139	213144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604931
4016	NC_007775	GACA	2	8	213194	213201	50 %	0 %	25 %	25 %	86604931
4017	NC_007775	GCA	2	6	213308	213313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604931
4018	NC_007775	GTA	2	6	213336	213341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604931
4019	NC_007775	CGG	2	6	213364	213369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604931
4020	NC_007775	T	6	6	213429	213434	0 %	100 %	0 %	0 %	86604931
4021	NC_007775	GAG	2	6	213444	213449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604931
4022	NC_007775	GGC	2	6	213460	213465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604931
4023	NC_007775	GAG	2	6	213569	213574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604931
4024	NC_007775	GGC	2	6	213704	213709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604931
4025	NC_007775	GCG	2	6	214122	214127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4026	NC_007775	TGC	4	12	214129	214140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4027	NC_007775	CGT	3	9	214156	214164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4028	NC_007775	GGT	3	9	214235	214243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604932
4029	NC_007775	GGCG	2	8	214273	214280	0 %	0 %	75 %	25 %	86604932
4030	NC_007775	CGGTGC	2	12	214282	214293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86604932
4031	NC_007775	CGG	2	6	214318	214323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4032	NC_007775	CTG	2	6	214328	214333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4033	NC_007775	GTC	2	6	214412	214417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4034	NC_007775	GCT	2	6	214433	214438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4035	NC_007775	GCG	2	6	214448	214453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4036	NC_007775	CAG	2	6	214517	214522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4037	NC_007775	CCA	2	6	214600	214605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604932
4038	NC_007775	CGT	2	6	215012	215017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4039	NC_007775	GA	3	6	215043	215048	50 %	0 %	50 %	0 %	86604932
4040	NC_007775	GGC	2	6	215146	215151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4041	NC_007775	CCG	2	6	215162	215167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604932
4042	NC_007775	CGG	2	6	215233	215238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4043	NC_007775	GGGC	2	8	215272	215279	0 %	0 %	75 %	25 %	86604932
4044	NC_007775	GGC	2	6	215285	215290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
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4046	NC_007775	GGC	2	6	215320	215325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
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4050	NC_007775	GTT	2	6	215524	215529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604932
4051	NC_007775	C	6	6	215544	215549	0 %	0 %	0 %	100 %	86604932
4052	NC_007775	TGC	2	6	215550	215555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4053	NC_007775	CAG	2	6	215600	215605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604932
4054	NC_007775	CGG	2	6	215641	215646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4055	NC_007775	CCA	3	9	215647	215655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604932
4056	NC_007775	TGG	2	6	215715	215720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604932
4057	NC_007775	CGG	2	6	215773	215778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4058	NC_007775	GCG	2	6	215782	215787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4059	NC_007775	ATCAGG	2	12	215853	215864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86604932
4060	NC_007775	GCG	3	9	215887	215895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604932
4061	NC_007775	GGGC	2	8	215936	215943	0 %	0 %	75 %	25 %	86604932
4062	NC_007775	CGC	2	6	215979	215984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604932
4063	NC_007775	GCC	2	6	215996	216001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604932
4064	NC_007775	TGG	2	6	216028	216033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604932
4065	NC_007775	AGG	2	6	216084	216089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604932
4066	NC_007775	TGG	2	6	216190	216195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604932
4067	NC_007775	G	6	6	216293	216298	0 %	0 %	100 %	0 %	86604932
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4070	NC_007775	GCGA	2	8	216368	216375	25 %	0 %	50 %	25 %	86604932
4071	NC_007775	CG	5	10	216436	216445	0 %	0 %	50 %	50 %	86604933
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4078	NC_007775	GCGGG	2	10	216721	216730	0 %	0 %	80 %	20 %	86604933
4079	NC_007775	CGT	2	6	216733	216738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604933
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4082	NC_007775	TGC	2	6	216805	216810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604933
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4087	NC_007775	CTG	2	6	216996	217001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604933
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4091	NC_007775	GCCG	2	8	217265	217272	0 %	0 %	50 %	50 %	86604933
4092	NC_007775	G	7	7	217279	217285	0 %	0 %	100 %	0 %	86604933
4093	NC_007775	CTC	2	6	217348	217353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604933
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4096	NC_007775	CGG	2	6	217471	217476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604933
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4103	NC_007775	TCG	2	6	217779	217784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604933
4104	NC_007775	AGG	2	6	217848	217853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604933
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4106	NC_007775	A	6	6	217904	217909	100 %	0 %	0 %	0 %	86604933
4107	NC_007775	GCG	2	6	218052	218057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604933
4108	NC_007775	AGC	2	6	218118	218123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604933
4109	NC_007775	CCT	2	6	218184	218189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604933
4110	NC_007775	CAG	2	6	218195	218200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604933
4111	NC_007775	CGG	2	6	218273	218278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604934
4112	NC_007775	AG	3	6	218280	218285	50 %	0 %	50 %	0 %	86604934
4113	NC_007775	CGT	2	6	218403	218408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604935
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4115	NC_007775	C	6	6	218429	218434	0 %	0 %	0 %	100 %	86604935
4116	NC_007775	GCC	2	6	218436	218441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604935
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4119	NC_007775	C	8	8	218538	218545	0 %	0 %	0 %	100 %	86604935
4120	NC_007775	GCG	2	6	218622	218627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604935
4121	NC_007775	CG	3	6	218671	218676	0 %	0 %	50 %	50 %	86604935
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