MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007775	CGC	2	6	161198	161203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604893
3002	NC_007775	GCA	2	6	161221	161226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3003	NC_007775	GGC	2	6	161320	161325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604893
3004	NC_007775	GCT	2	6	161380	161385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3005	NC_007775	GGT	2	6	161386	161391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604893
3006	NC_007775	CAG	2	6	161549	161554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3007	NC_007775	GGT	3	9	161587	161595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604893
3008	NC_007775	GCC	2	6	161657	161662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604893
3009	NC_007775	AGG	2	6	161697	161702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604893
3010	NC_007775	AGGG	2	8	161715	161722	25 %	0 %	75 %	0 %	86604893
3011	NC_007775	TCA	2	6	161739	161744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604894
3012	NC_007775	GCA	2	6	161748	161753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3013	NC_007775	GCG	2	6	161766	161771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3014	NC_007775	ATC	2	6	161780	161785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604894
3015	NC_007775	ACC	2	6	161810	161815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3016	NC_007775	GAG	2	6	161848	161853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604894
3017	NC_007775	ACC	2	6	161870	161875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3018	NC_007775	GCG	2	6	161887	161892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3019	NC_007775	TCC	2	6	161933	161938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604894
3020	NC_007775	GTC	2	6	161940	161945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3021	NC_007775	GTG	2	6	162028	162033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604894
3022	NC_007775	GCG	2	6	162035	162040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3023	NC_007775	CCA	2	6	162045	162050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3024	NC_007775	TAG	2	6	162068	162073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
3025	NC_007775	CGG	2	6	162074	162079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3026	NC_007775	AAGGT	2	10	162122	162131	40 %	20 %	40 %	0 %	86604894
3027	NC_007775	GCC	2	6	162133	162138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604894
3028	NC_007775	GTA	2	6	162148	162153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
3029	NC_007775	AAG	2	6	162170	162175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604894
3030	NC_007775	TGGCCT	2	12	162198	162209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3031	NC_007775	ACC	2	6	162230	162235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3032	NC_007775	GGGCAG	2	12	162250	162261	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	86604894
3033	NC_007775	TGG	2	6	162308	162313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604894
3034	NC_007775	CCA	2	6	162327	162332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3035	NC_007775	AGT	2	6	162354	162359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
3036	NC_007775	CGG	2	6	162414	162419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3037	NC_007775	ACC	2	6	162422	162427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3038	NC_007775	GGC	2	6	162433	162438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3039	NC_007775	CGG	3	9	162443	162451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3040	NC_007775	CTG	2	6	162568	162573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3041	NC_007775	CGC	2	6	162588	162593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604894
3042	NC_007775	TCC	2	6	162620	162625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604894
3043	NC_007775	GCGTCG	2	12	162650	162661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86604894
3044	NC_007775	GCC	3	9	162862	162870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604894
3045	NC_007775	GAT	2	6	162874	162879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
3046	NC_007775	CGT	2	6	162882	162887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3047	NC_007775	ACT	2	6	162955	162960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604895
3048	NC_007775	GGGC	2	8	162964	162971	0 %	0 %	75 %	25 %	86604895
3049	NC_007775	GGC	2	6	162987	162992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604895
3050	NC_007775	CCA	2	6	163091	163096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604895
3051	NC_007775	GGAC	2	8	163120	163127	25 %	0 %	50 %	25 %	86604895
3052	NC_007775	AAG	2	6	163154	163159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604895
3053	NC_007775	CCA	2	6	163202	163207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604895
3054	NC_007775	CAA	2	6	163275	163280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604895
3055	NC_007775	GTC	2	6	163326	163331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3056	NC_007775	CCA	3	9	163349	163357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604895
3057	NC_007775	GCC	2	6	163362	163367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604895
3058	NC_007775	GCA	2	6	163382	163387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3059	NC_007775	GACCA	2	10	163438	163447	40 %	0 %	20 %	40 %	86604895
3060	NC_007775	G	8	8	163515	163522	0 %	0 %	100 %	0 %	86604895
3061	NC_007775	CTG	2	6	163545	163550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3062	NC_007775	CAC	2	6	163572	163577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604895
3063	NC_007775	CGT	2	6	163641	163646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3064	NC_007775	GCCC	2	8	163667	163674	0 %	0 %	25 %	75 %	86604895
3065	NC_007775	TTC	2	6	163720	163725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604895
3066	NC_007775	CGC	2	6	163726	163731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604895
3067	NC_007775	TCG	2	6	163804	163809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3068	NC_007775	GCGG	2	8	163845	163852	0 %	0 %	75 %	25 %	86604895
3069	NC_007775	A	6	6	163901	163906	100 %	0 %	0 %	0 %	86604895
3070	NC_007775	CTC	2	6	164155	164160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604896
3071	NC_007775	CCA	2	6	164181	164186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604896
3072	NC_007775	CAGGG	2	10	164194	164203	20 %	0 %	60 %	20 %	86604896
3073	NC_007775	TCC	2	6	164210	164215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604896
3074	NC_007775	GCG	2	6	164218	164223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604896
3075	NC_007775	CCG	2	6	164322	164327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604896
3076	NC_007775	CGT	2	6	164337	164342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3077	NC_007775	TGG	2	6	164360	164365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604896
3078	NC_007775	GCA	2	6	164388	164393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3079	NC_007775	TGC	3	9	164403	164411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3080	NC_007775	GAT	2	6	164461	164466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604896
3081	NC_007775	T	6	6	164581	164586	0 %	100 %	0 %	0 %	86604896
3082	NC_007775	CAGGGC	2	12	164671	164682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86604896
3083	NC_007775	GGGCGA	2	12	164822	164833	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	86604896
3084	NC_007775	G	6	6	164854	164859	0 %	0 %	100 %	0 %	86604896
3085	NC_007775	ACGC	2	8	164860	164867	25 %	0 %	25 %	50 %	86604896
3086	NC_007775	AAAGC	2	10	164906	164915	60 %	0 %	20 %	20 %	86604896
3087	NC_007775	GTT	2	6	164922	164927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604896
3088	NC_007775	CCA	2	6	164940	164945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604896
3089	NC_007775	TCT	2	6	164993	164998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604896
3090	NC_007775	GGATGC	2	12	165000	165011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86604896
3091	NC_007775	TGG	3	9	165123	165131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604896
3092	NC_007775	GCT	2	6	165168	165173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3093	NC_007775	AGGGA	2	10	165177	165186	40 %	0 %	60 %	0 %	86604896
3094	NC_007775	G	6	6	165241	165246	0 %	0 %	100 %	0 %	86604896
3095	NC_007775	CTG	2	6	165271	165276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3096	NC_007775	CTG	3	9	165286	165294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3097	NC_007775	GGC	2	6	165295	165300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604896
3098	NC_007775	CAG	2	6	165328	165333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3099	NC_007775	ACC	2	6	165335	165340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604896
3100	NC_007775	AGC	2	6	165406	165411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3101	NC_007775	GAGC	2	8	165430	165437	25 %	0 %	50 %	25 %	86604896
3102	NC_007775	AAG	2	6	165438	165443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604896
3103	NC_007775	CGG	2	6	165561	165566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604896
3104	NC_007775	GTC	2	6	165670	165675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3105	NC_007775	AG	3	6	165840	165845	50 %	0 %	50 %	0 %	86604896
3106	NC_007775	AGC	2	6	165848	165853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3107	NC_007775	C	6	6	165864	165869	0 %	0 %	0 %	100 %	86604896
3108	NC_007775	AAG	2	6	165898	165903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604896
3109	NC_007775	GAG	2	6	165916	165921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604896
3110	NC_007775	GTC	2	6	165979	165984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604896
3111	NC_007775	GGTAGT	2	12	166029	166040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	86604896
3112	NC_007775	CCT	2	6	166080	166085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604896
3113	NC_007775	GGGA	2	8	166137	166144	25 %	0 %	75 %	0 %	86604896
3114	NC_007775	CCAG	2	8	166152	166159	25 %	0 %	25 %	50 %	86604896
3115	NC_007775	CAA	2	6	166273	166278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604896
3116	NC_007775	GCC	2	6	166297	166302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604896
3117	NC_007775	TTC	2	6	166322	166327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604896
3118	NC_007775	CGC	2	6	167128	167133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604897
3119	NC_007775	GCTTT	2	10	167179	167188	0 %	60 %	20 %	20 %	86604897
3120	NC_007775	CGG	2	6	167207	167212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604897
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3122	NC_007775	T	6	6	167231	167236	0 %	100 %	0 %	0 %	86604897
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3491	NC_007775	CGG	2	6	187288	187293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604911
3492	NC_007775	CTC	2	6	187327	187332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604911
3493	NC_007775	TCCG	2	8	187449	187456	0 %	25 %	25 %	50 %	86604911
3494	NC_007775	GT	3	6	187737	187742	0 %	50 %	50 %	0 %	86604912
3495	NC_007775	TGGG	2	8	187788	187795	0 %	25 %	75 %	0 %	86604912
3496	NC_007775	CTG	2	6	187828	187833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604912
3497	NC_007775	AGCC	2	8	187840	187847	25 %	0 %	25 %	50 %	86604912
3498	NC_007775	CGG	2	6	187907	187912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604913
3499	NC_007775	TCC	2	6	187965	187970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604913
3500	NC_007775	CGG	2	6	188146	188151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604914

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