MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14003	NC_007775	CCCT	2	8	757494	757501	0 %	25 %	0 %	75 %	86605460
14004	NC_007775	GGC	2	6	757518	757523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605460
14005	NC_007775	CAC	2	6	757584	757589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605460
14006	NC_007775	CCA	2	6	757598	757603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605460
14007	NC_007775	CCA	2	6	757619	757624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605460
14008	NC_007775	GCC	2	6	758379	758384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605461
14009	NC_007775	C	6	6	758421	758426	0 %	0 %	0 %	100 %	86605461
14010	NC_007775	GCC	2	6	758452	758457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605461
14011	NC_007775	CGG	2	6	758482	758487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605461
14012	NC_007775	CTG	2	6	758489	758494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605461
14013	NC_007775	CCA	2	6	758506	758511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605461
14014	NC_007775	CCA	2	6	758619	758624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605461
14015	NC_007775	GGC	2	6	758745	758750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605461
14016	NC_007775	CAG	2	6	758788	758793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605461
14017	NC_007775	GCC	2	6	758832	758837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605461
14018	NC_007775	CCA	2	6	758881	758886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605461
14019	NC_007775	CTG	2	6	758923	758928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605461
14020	NC_007775	CTGG	2	8	759007	759014	0 %	25 %	50 %	25 %	86605461
14021	NC_007775	GCA	2	6	759085	759090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605461
14022	NC_007775	GGT	2	6	759144	759149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605461
14023	NC_007775	GCTG	2	8	759241	759248	0 %	25 %	50 %	25 %	86605462
14024	NC_007775	CTC	2	6	759249	759254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605462
14025	NC_007775	CTG	2	6	759273	759278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605462
14026	NC_007775	TGG	2	6	759493	759498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605462
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14028	NC_007775	CGA	2	6	759581	759586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605462
14029	NC_007775	GAT	2	6	759587	759592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605462
14030	NC_007775	GCC	2	6	759612	759617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605462
14031	NC_007775	GCC	2	6	759690	759695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605462
14032	NC_007775	ACT	2	6	759793	759798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605462
14033	NC_007775	T	6	6	759834	759839	0 %	100 %	0 %	0 %	86605462
14034	NC_007775	GCT	2	6	759842	759847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605462
14035	NC_007775	GCC	2	6	759907	759912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605462
14036	NC_007775	TGC	3	9	759964	759972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605462
14037	NC_007775	GCTG	2	8	759988	759995	0 %	25 %	50 %	25 %	86605462
14038	NC_007775	TCG	2	6	760114	760119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605462
14039	NC_007775	CATC	2	8	760144	760151	25 %	25 %	0 %	50 %	86605462
14040	NC_007775	CCCTGC	2	12	760162	760173	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	86605462
14041	NC_007775	TCCC	2	8	760187	760194	0 %	25 %	0 %	75 %	86605462
14042	NC_007775	AAC	2	6	760336	760341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605462
14043	NC_007775	ACC	4	12	760425	760436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605462
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14045	NC_007775	GCG	2	6	760499	760504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605462
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14047	NC_007775	AGATCA	2	12	760588	760599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	86605462
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14051	NC_007775	CTG	2	6	760971	760976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605463
14052	NC_007775	GA	3	6	760988	760993	50 %	0 %	50 %	0 %	86605463
14053	NC_007775	CCAC	2	8	761039	761046	25 %	0 %	0 %	75 %	86605463
14054	NC_007775	GGGCCT	2	12	761075	761086	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86605463
14055	NC_007775	CCCA	2	8	761257	761264	25 %	0 %	0 %	75 %	86605463
14056	NC_007775	GCA	2	6	761282	761287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605463
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14062	NC_007775	CTG	2	6	761492	761497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605463
14063	NC_007775	GCGGA	3	15	761509	761523	20 %	0 %	60 %	20 %	86605463
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14077	NC_007775	AACCAG	2	12	762025	762036	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	86605463
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14087	NC_007775	GCA	2	6	762377	762382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605463
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14089	NC_007775	GGCT	2	8	762723	762730	0 %	25 %	50 %	25 %	86605464
14090	NC_007775	AG	3	6	762734	762739	50 %	0 %	50 %	0 %	86605464
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14099	NC_007775	CCGC	2	8	763293	763300	0 %	0 %	25 %	75 %	86605464
14100	NC_007775	AGGT	2	8	763301	763308	25 %	25 %	50 %	0 %	86605464
14101	NC_007775	GAA	2	6	763312	763317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605464
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