MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_007775	GCT	2	6	729196	729201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605436
13503	NC_007775	GCTT	2	8	729317	729324	0 %	50 %	25 %	25 %	86605436
13504	NC_007775	CTC	2	6	729412	729417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605436
13505	NC_007775	GGC	2	6	729421	729426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605436
13506	NC_007775	GGCC	2	8	729518	729525	0 %	0 %	50 %	50 %	86605436
13507	NC_007775	CCA	2	6	729555	729560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605436
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13509	NC_007775	AGCGCC	2	12	729596	729607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86605436
13510	NC_007775	GTC	2	6	729616	729621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605436
13511	NC_007775	GCC	2	6	729622	729627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605436
13512	NC_007775	CCA	2	6	729705	729710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605436
13513	NC_007775	CAGC	2	8	729720	729727	25 %	0 %	25 %	50 %	86605436
13514	NC_007775	GCC	2	6	729853	729858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605436
13515	NC_007775	G	6	6	729891	729896	0 %	0 %	100 %	0 %	86605436
13516	NC_007775	TGC	2	6	729899	729904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605436
13517	NC_007775	GCA	2	6	729936	729941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605436
13518	NC_007775	GCC	2	6	729950	729955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605436
13519	NC_007775	CGG	3	9	729961	729969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605436
13520	NC_007775	GCG	2	6	730006	730011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605436
13521	NC_007775	GGC	2	6	730027	730032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605436
13522	NC_007775	GCG	2	6	730048	730053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605436
13523	NC_007775	TTC	2	6	730128	730133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605437
13524	NC_007775	CTC	2	6	730197	730202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605437
13525	NC_007775	TGA	2	6	730208	730213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605437
13526	NC_007775	CCATCC	2	12	730216	730227	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	86605437
13527	NC_007775	GCG	2	6	730255	730260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605437
13528	NC_007775	CTT	2	6	730355	730360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605437
13529	NC_007775	CAA	2	6	730506	730511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605437
13530	NC_007775	GAT	2	6	730551	730556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605437
13531	NC_007775	CGG	2	6	730658	730663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605437
13532	NC_007775	TG	3	6	730683	730688	0 %	50 %	50 %	0 %	86605437
13533	NC_007775	T	6	6	730689	730694	0 %	100 %	0 %	0 %	86605437
13534	NC_007775	CTT	2	6	730805	730810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605437
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13540	NC_007775	GCT	2	6	731137	731142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605437
13541	NC_007775	TGG	3	9	731159	731167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605437
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13543	NC_007775	TC	3	6	731231	731236	0 %	50 %	0 %	50 %	86605437
13544	NC_007775	CTG	2	6	731391	731396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605438
13545	NC_007775	TCCGTT	2	12	731433	731444	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	86605438
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13553	NC_007775	TC	3	6	731883	731888	0 %	50 %	0 %	50 %	86605438
13554	NC_007775	CGC	2	6	731901	731906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605438
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13557	NC_007775	CTT	2	6	732052	732057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605438
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13593	NC_007775	CAA	2	6	735256	735261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605442
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13595	NC_007775	CTTA	2	8	735326	735333	25 %	50 %	0 %	25 %	86605442
13596	NC_007775	GGGA	2	8	735735	735742	25 %	0 %	75 %	0 %	86605443
13597	NC_007775	GCT	2	6	735798	735803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605443
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13601	NC_007775	TG	3	6	735988	735993	0 %	50 %	50 %	0 %	86605443
13602	NC_007775	CCTT	2	8	736013	736020	0 %	50 %	0 %	50 %	86605443
13603	NC_007775	ATC	2	6	736054	736059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605443
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13605	NC_007775	ACG	2	6	736129	736134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605443
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13607	NC_007775	TCTT	2	8	736286	736293	0 %	75 %	0 %	25 %	86605444
13608	NC_007775	CAGC	2	8	736320	736327	25 %	0 %	25 %	50 %	86605444
13609	NC_007775	ACA	2	6	736337	736342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605444
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13614	NC_007775	CAAC	2	8	736635	736642	50 %	0 %	0 %	50 %	86605444
13615	NC_007775	GTA	2	6	736669	736674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605444
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13986	NC_007775	CTC	2	6	756369	756374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605458
13987	NC_007775	AGC	3	9	756383	756391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605458
13988	NC_007775	C	7	7	756453	756459	0 %	0 %	0 %	100 %	86605458
13989	NC_007775	GCT	2	6	756769	756774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605459
13990	NC_007775	GCG	2	6	756807	756812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605459
13991	NC_007775	CCA	2	6	756859	756864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605459
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13994	NC_007775	GCAG	2	8	757063	757070	25 %	0 %	50 %	25 %	86605459
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13998	NC_007775	CCGC	2	8	757177	757184	0 %	0 %	25 %	75 %	86605459
13999	NC_007775	T	6	6	757240	757245	0 %	100 %	0 %	0 %	86605459
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