MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_007775	ATG	2	6	612924	612929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605319
11503	NC_007775	TTC	2	6	613173	613178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605319
11504	NC_007775	CCGT	2	8	613267	613274	0 %	25 %	25 %	50 %	86605319
11505	NC_007775	TGC	2	6	613289	613294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605319
11506	NC_007775	GCC	2	6	613341	613346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605319
11507	NC_007775	G	8	8	613354	613361	0 %	0 %	100 %	0 %	86605319
11508	NC_007775	CCGG	2	8	613365	613372	0 %	0 %	50 %	50 %	86605319
11509	NC_007775	AAG	2	6	613419	613424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605319
11510	NC_007775	TGG	2	6	613486	613491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605319
11511	NC_007775	GGA	2	6	613496	613501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605319
11512	NC_007775	GTG	2	6	613582	613587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605320
11513	NC_007775	GGA	2	6	613605	613610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605320
11514	NC_007775	GGA	2	6	613656	613661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605320
11515	NC_007775	TG	3	6	613759	613764	0 %	50 %	50 %	0 %	86605320
11516	NC_007775	GTA	2	6	613786	613791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605320
11517	NC_007775	GGA	2	6	613800	613805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605320
11518	NC_007775	TTGGT	2	10	613949	613958	0 %	60 %	40 %	0 %	86605320
11519	NC_007775	GAAG	2	8	614025	614032	50 %	0 %	50 %	0 %	86605321
11520	NC_007775	CTC	2	6	614038	614043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605321
11521	NC_007775	TTGGA	2	10	614123	614132	20 %	40 %	40 %	0 %	86605321
11522	NC_007775	GCC	2	6	614197	614202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605321
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11525	NC_007775	CTGGCC	2	12	614440	614451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86605321
11526	NC_007775	GCTTT	2	10	614473	614482	0 %	60 %	20 %	20 %	86605321
11527	NC_007775	TGA	2	6	614589	614594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605321
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11529	NC_007775	GCCT	2	8	614613	614620	0 %	25 %	25 %	50 %	86605321
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11533	NC_007775	GGA	2	6	614883	614888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605322
11534	NC_007775	AGG	2	6	614929	614934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605322
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11536	NC_007775	G	7	7	614991	614997	0 %	0 %	100 %	0 %	86605322
11537	NC_007775	GCT	2	6	615006	615011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605322
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11540	NC_007775	A	6	6	615103	615108	100 %	0 %	0 %	0 %	86605322
11541	NC_007775	CAA	2	6	615125	615130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605322
11542	NC_007775	GATC	2	8	615131	615138	25 %	25 %	25 %	25 %	86605322
11543	NC_007775	TTGG	2	8	615147	615154	0 %	50 %	50 %	0 %	86605322
11544	NC_007775	GTG	2	6	615252	615257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605322
11545	NC_007775	AATTGG	2	12	615338	615349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605323
11546	NC_007775	CGG	2	6	615363	615368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605323
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11551	NC_007775	TCCT	2	8	615833	615840	0 %	50 %	0 %	50 %	86605323
11552	NC_007775	GAG	2	6	615841	615846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605323
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11554	NC_007775	TG	3	6	615891	615896	0 %	50 %	50 %	0 %	86605323
11555	NC_007775	CTT	2	6	615924	615929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605323
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11562	NC_007775	GAG	2	6	617545	617550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605324
11563	NC_007775	ACCG	2	8	617593	617600	25 %	0 %	25 %	50 %	86605324
11564	NC_007775	GCA	2	6	618121	618126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605325
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