MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_007775	CGG	2	6	530428	530433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605229
10003	NC_007775	GGC	2	6	530444	530449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605229
10004	NC_007775	GCT	2	6	530498	530503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10005	NC_007775	TTGG	2	8	530600	530607	0 %	50 %	50 %	0 %	86605229
10006	NC_007775	GAG	2	6	530615	530620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605229
10007	NC_007775	CTT	2	6	530629	530634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605229
10008	NC_007775	GCA	2	6	530659	530664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10009	NC_007775	GGA	2	6	530668	530673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605229
10010	NC_007775	CTG	2	6	530699	530704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10011	NC_007775	CGC	2	6	530733	530738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605229
10012	NC_007775	CAG	2	6	530954	530959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10013	NC_007775	TTG	2	6	530985	530990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605229
10014	NC_007775	GCC	2	6	531003	531008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605229
10015	NC_007775	GGCC	2	8	531061	531068	0 %	0 %	50 %	50 %	86605229
10016	NC_007775	CAC	2	6	531071	531076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
10017	NC_007775	CTTGGA	2	12	531152	531163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86605229
10018	NC_007775	CAT	2	6	531245	531250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605229
10019	NC_007775	AGA	3	9	531268	531276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605229
10020	NC_007775	GTA	2	6	531311	531316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605229
10021	NC_007775	TCC	2	6	531327	531332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
10022	NC_007775	TCC	2	6	531336	531341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
10023	NC_007775	CCAGC	2	10	531344	531353	20 %	0 %	20 %	60 %	86605229
10024	NC_007775	CCA	2	6	531478	531483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
10025	NC_007775	CAC	2	6	531552	531557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
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10031	NC_007775	CTC	2	6	531770	531775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
10032	NC_007775	CAG	2	6	531785	531790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10033	NC_007775	CAC	2	6	531812	531817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
10034	NC_007775	TTG	2	6	531885	531890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605229
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10036	NC_007775	TCG	2	6	531999	532004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
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10039	NC_007775	TGG	2	6	532129	532134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605229
10040	NC_007775	CCA	3	9	532135	532143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
10041	NC_007775	CTGG	2	8	532148	532155	0 %	25 %	50 %	25 %	86605229
10042	NC_007775	CGG	2	6	532159	532164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605229
10043	NC_007775	TGT	2	6	532207	532212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605229
10044	NC_007775	CTG	2	6	532231	532236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10045	NC_007775	TCG	2	6	532338	532343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10046	NC_007775	GTCCA	2	10	532362	532371	20 %	20 %	20 %	40 %	86605229
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10052	NC_007775	GCA	2	6	532657	532662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10053	NC_007775	TCC	2	6	532716	532721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
10054	NC_007775	CTGG	2	8	532763	532770	0 %	25 %	50 %	25 %	86605229
10055	NC_007775	GCA	2	6	532791	532796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
10056	NC_007775	CTG	2	6	532964	532969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605230
10057	NC_007775	GGGT	2	8	532971	532978	0 %	25 %	75 %	0 %	86605230
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10060	NC_007775	GGCT	2	8	533103	533110	0 %	25 %	50 %	25 %	86605230
10061	NC_007775	CAA	2	6	533306	533311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605230
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10101	NC_007775	CCTA	2	8	535023	535030	25 %	25 %	0 %	50 %	86605235
10102	NC_007775	AAT	2	6	535068	535073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86605235
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10105	NC_007775	TAC	2	6	535233	535238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605236
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10110	NC_007775	AGC	2	6	535523	535528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605236
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10112	NC_007775	CAA	2	6	535592	535597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605236
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10120	NC_007775	TGC	2	6	536609	536614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605237
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10233	NC_007775	CTG	2	6	542969	542974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605244
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10485	NC_007775	GCT	2	6	555880	555885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605260
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