MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_007775	CAG	2	6	321450	321455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605033
6003	NC_007775	CGGCCT	2	12	321505	321516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86605033
6004	NC_007775	GAA	2	6	321808	321813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605034
6005	NC_007775	GGC	2	6	321831	321836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605034
6006	NC_007775	TCGC	2	8	321839	321846	0 %	25 %	25 %	50 %	86605034
6007	NC_007775	GCG	2	6	321861	321866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605034
6008	NC_007775	TTG	2	6	321896	321901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605034
6009	NC_007775	C	6	6	321944	321949	0 %	0 %	0 %	100 %	86605034
6010	NC_007775	ACA	2	6	322025	322030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605034
6011	NC_007775	GCTG	2	8	322043	322050	0 %	25 %	50 %	25 %	86605034
6012	NC_007775	GTG	2	6	322147	322152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605034
6013	NC_007775	AGC	2	6	322208	322213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605034
6014	NC_007775	CGG	2	6	322221	322226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605034
6015	NC_007775	GGT	2	6	322314	322319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605034
6016	NC_007775	GCC	2	6	322328	322333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605034
6017	NC_007775	ATC	2	6	322354	322359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605034
6018	NC_007775	CT	3	6	322360	322365	0 %	50 %	0 %	50 %	86605034
6019	NC_007775	AGC	2	6	322373	322378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605034
6020	NC_007775	GAA	2	6	322411	322416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605034
6021	NC_007775	CGG	2	6	322437	322442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605034
6022	NC_007775	GCTG	2	8	322460	322467	0 %	25 %	50 %	25 %	86605034
6023	NC_007775	ACC	2	6	322579	322584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605034
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6025	NC_007775	CTG	2	6	322688	322693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605034
6026	NC_007775	CGA	2	6	322722	322727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605034
6027	NC_007775	CGG	2	6	322773	322778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605034
6028	NC_007775	TTC	2	6	322915	322920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605034
6029	NC_007775	GAA	2	6	322971	322976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605034
6030	NC_007775	GCG	3	9	322977	322985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605034
6031	NC_007775	GCC	3	9	323017	323025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605034
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6033	NC_007775	GCA	2	6	323125	323130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605034
6034	NC_007775	CAG	2	6	323197	323202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605034
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6041	NC_007775	CAG	2	6	323902	323907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605036
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6043	NC_007775	GCC	2	6	323975	323980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605036
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6053	NC_007775	CAG	2	6	324397	324402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605036
6054	NC_007775	CAG	2	6	324421	324426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605036
6055	NC_007775	TAG	2	6	324447	324452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605036
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6061	NC_007775	CAG	2	6	324709	324714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605036
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6492	NC_007775	AGC	2	6	345151	345156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605048
6493	NC_007775	CCAA	2	8	345164	345171	50 %	0 %	0 %	50 %	86605048
6494	NC_007775	CGG	2	6	345175	345180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605048
6495	NC_007775	TGC	2	6	346501	346506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605049
6496	NC_007775	CAGC	2	8	346609	346616	25 %	0 %	25 %	50 %	86605049
6497	NC_007775	CCAG	2	8	346674	346681	25 %	0 %	25 %	50 %	86605049
6498	NC_007775	GGC	2	6	346704	346709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605049
6499	NC_007775	CTC	2	6	346732	346737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605049
6500	NC_007775	GTA	2	6	346771	346776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605049

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