MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 76389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007677	CCGCC	2	10	657202	657211	0 %	0 %	20 %	80 %	83816760
13002	NC_007677	GCCC	2	8	657247	657254	0 %	0 %	25 %	75 %	83816760
13003	NC_007677	GGCGG	2	10	657370	657379	0 %	0 %	80 %	20 %	83816760
13004	NC_007677	CCG	2	6	657406	657411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816760
13005	NC_007677	ACG	2	6	657415	657420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816760
13006	NC_007677	CCCA	2	8	657472	657479	25 %	0 %	0 %	75 %	83816760
13007	NC_007677	GAGC	2	8	657536	657543	25 %	0 %	50 %	25 %	83816760
13008	NC_007677	CGT	2	6	657560	657565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816760
13009	NC_007677	GC	3	6	657650	657655	0 %	0 %	50 %	50 %	83816760
13010	NC_007677	TGT	2	6	657656	657661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83816760
13011	NC_007677	CCG	2	6	657662	657667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816760
13012	NC_007677	CGT	2	6	657672	657677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816760
13013	NC_007677	CGTC	2	8	657685	657692	0 %	25 %	25 %	50 %	83816760
13014	NC_007677	ATCG	2	8	657783	657790	25 %	25 %	25 %	25 %	83816760
13015	NC_007677	CCCAT	2	10	657876	657885	20 %	20 %	0 %	60 %	83816760
13016	NC_007677	GGC	2	6	657942	657947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816760
13017	NC_007677	CAG	2	6	657960	657965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816760
13018	NC_007677	ACG	2	6	657976	657981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816760
13019	NC_007677	GCA	2	6	658025	658030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816760
13020	NC_007677	CGG	2	6	658058	658063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816760
13021	NC_007677	CGT	2	6	658700	658705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816118
13022	NC_007677	GCG	2	6	658722	658727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816118
13023	NC_007677	GATGTC	2	12	658757	658768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	83816118
13024	NC_007677	CTC	2	6	658847	658852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816118
13025	NC_007677	CGT	2	6	658858	658863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816118
13026	NC_007677	GCGT	2	8	658947	658954	0 %	25 %	50 %	25 %	83816118
13027	NC_007677	ATG	2	6	658968	658973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816118
13028	NC_007677	CTC	2	6	659003	659008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816118
13029	NC_007677	GCTCCC	2	12	659017	659028	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83816118
13030	NC_007677	GGGC	2	8	659035	659042	0 %	0 %	75 %	25 %	83816118
13031	NC_007677	TGA	2	6	659050	659055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816118
13032	NC_007677	GAA	2	6	659084	659089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816118
13033	NC_007677	GAT	2	6	659102	659107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816118
13034	NC_007677	CAC	2	6	659117	659122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83816118
13035	NC_007677	GGAA	2	8	659129	659136	50 %	0 %	50 %	0 %	83816118
13036	NC_007677	G	6	6	659137	659142	0 %	0 %	100 %	0 %	83816118
13037	NC_007677	GC	3	6	659251	659256	0 %	0 %	50 %	50 %	83816118
13038	NC_007677	TCG	2	6	659367	659372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816118
13039	NC_007677	TCC	2	6	659373	659378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816118
13040	NC_007677	TAG	2	6	659513	659518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814832
13041	NC_007677	TGA	2	6	659544	659549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814832
13042	NC_007677	CCT	2	6	659553	659558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814832
13043	NC_007677	GTC	2	6	659560	659565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814832
13044	NC_007677	TCG	2	6	659621	659626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814832
13045	NC_007677	CTC	2	6	659632	659637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814832
13046	NC_007677	CGG	2	6	659688	659693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814832
13047	NC_007677	GTC	2	6	659770	659775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814832
13048	NC_007677	TTC	2	6	659786	659791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83814832
13049	NC_007677	GC	3	6	659792	659797	0 %	0 %	50 %	50 %	83814832
13050	NC_007677	GTC	2	6	659815	659820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814832
13051	NC_007677	GTC	2	6	659839	659844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814832
13052	NC_007677	CAT	2	6	659869	659874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814832
13053	NC_007677	GCTC	2	8	659886	659893	0 %	25 %	25 %	50 %	83814832
13054	NC_007677	TCG	2	6	659918	659923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814832
13055	NC_007677	CG	3	6	659955	659960	0 %	0 %	50 %	50 %	83814832
13056	NC_007677	GCG	2	6	660037	660042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814832
13057	NC_007677	CAC	2	6	660049	660054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814832
13058	NC_007677	AGG	2	6	660062	660067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814832
13059	NC_007677	GCC	2	6	660193	660198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814832
13060	NC_007677	CAC	2	6	660220	660225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814832
13061	NC_007677	CTC	2	6	660235	660240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814832
13062	NC_007677	TTG	2	6	660293	660298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83814832
13063	NC_007677	CG	3	6	660405	660410	0 %	0 %	50 %	50 %	83814832
13064	NC_007677	GCC	2	6	660478	660483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814832
13065	NC_007677	CG	4	8	660489	660496	0 %	0 %	50 %	50 %	83814832
13066	NC_007677	TCC	2	6	660560	660565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814832
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13068	NC_007677	GGT	2	6	660628	660633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814832
13069	NC_007677	GCC	2	6	660652	660657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814832
13070	NC_007677	CCA	2	6	660720	660725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814832
13071	NC_007677	TCC	2	6	660743	660748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814832
13072	NC_007677	ATG	2	6	660752	660757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814832
13073	NC_007677	TCG	2	6	660776	660781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814832
13074	NC_007677	CGG	2	6	660849	660854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814832
13075	NC_007677	GCTCCA	2	12	660963	660974	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83814832
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13077	NC_007677	GCC	2	6	661108	661113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814832
13078	NC_007677	GCC	2	6	661118	661123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814832
13079	NC_007677	ACC	2	6	661157	661162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814832
13080	NC_007677	GGC	2	6	661195	661200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814832
13081	NC_007677	CCCG	2	8	661213	661220	0 %	0 %	25 %	75 %	83814832
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13089	NC_007677	TCA	2	6	661484	661489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814218
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13104	NC_007677	T	6	6	661996	662001	0 %	100 %	0 %	0 %	83815294
13105	NC_007677	GGCCAC	2	12	662065	662076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83815294
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13111	NC_007677	CGGTC	2	10	662525	662534	0 %	20 %	40 %	40 %	83816245
13112	NC_007677	GC	3	6	662554	662559	0 %	0 %	50 %	50 %	83816245
13113	NC_007677	GCCG	2	8	662610	662617	0 %	0 %	50 %	50 %	83816245
13114	NC_007677	TGG	2	6	662636	662641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816245
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13118	NC_007677	GTG	2	6	662746	662751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816245
13119	NC_007677	GGA	2	6	662807	662812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816245
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13121	NC_007677	TCG	2	6	662869	662874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816245
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13123	NC_007677	TCG	2	6	662920	662925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816245
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13229	NC_007677	GCC	2	6	667822	667827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814273
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13233	NC_007677	CTGGCG	2	12	668299	668310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83815941
13234	NC_007677	TCT	2	6	668363	668368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815941
13235	NC_007677	TGG	2	6	668399	668404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83815941
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13237	NC_007677	GCAC	2	8	668465	668472	25 %	0 %	25 %	50 %	83815941
13238	NC_007677	TGG	2	6	668491	668496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83815941
13239	NC_007677	TGGTGC	2	12	668501	668512	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	83815941
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13357	NC_007677	GGAGA	2	10	672887	672896	40 %	0 %	60 %	0 %	83815422
13358	NC_007677	CGA	2	6	672907	672912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815422
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13483	NC_007677	GTG	2	6	678526	678531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814158
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13485	NC_007677	TAC	2	6	678556	678561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814158
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