MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus RF122

Total Repeats: 51777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007622	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749778
2	NC_007622	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82749778
3	NC_007622	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749778
4	NC_007622	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82749778
5	NC_007622	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
6	NC_007622	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749778
7	NC_007622	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82749778
8	NC_007622	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82749778
9	NC_007622	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	82749778
10	NC_007622	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749778
11	NC_007622	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	82749778
12	NC_007622	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82749778
13	NC_007622	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749778
14	NC_007622	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749778
15	NC_007622	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749778
16	NC_007622	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749778
17	NC_007622	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
18	NC_007622	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
19	NC_007622	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749778
20	NC_007622	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82749778
21	NC_007622	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
22	NC_007622	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
23	NC_007622	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82749778
24	NC_007622	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	82749778
25	NC_007622	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	82749778
26	NC_007622	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749778
27	NC_007622	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82749778
28	NC_007622	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	82749778
29	NC_007622	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	82749778
30	NC_007622	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	82749778
31	NC_007622	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
32	NC_007622	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82749778
33	NC_007622	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	82749778
34	NC_007622	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	82749778
35	NC_007622	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
36	NC_007622	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749778
37	NC_007622	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	82749779
38	NC_007622	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749779
39	NC_007622	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749779
40	NC_007622	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82749779
41	NC_007622	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749779
42	NC_007622	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749779
43	NC_007622	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	82749779
44	NC_007622	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	82749779
45	NC_007622	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	82749779
46	NC_007622	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749779
47	NC_007622	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	82749779
48	NC_007622	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	82749779
49	NC_007622	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749779
50	NC_007622	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82749779
51	NC_007622	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	82749779
52	NC_007622	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749779
53	NC_007622	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82749779
54	NC_007622	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	82749779
55	NC_007622	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749779
56	NC_007622	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82749779
57	NC_007622	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	82749779
58	NC_007622	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749779
59	NC_007622	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82749779
60	NC_007622	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749779
61	NC_007622	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749779
62	NC_007622	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82749779
63	NC_007622	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749779
64	NC_007622	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82749779
65	NC_007622	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	82749779
66	NC_007622	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	82749779
67	NC_007622	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	82749779
68	NC_007622	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749779
69	NC_007622	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749779
70	NC_007622	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82749779
71	NC_007622	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82749779
72	NC_007622	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	82749779
73	NC_007622	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749780
74	NC_007622	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749780
75	NC_007622	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749780
76	NC_007622	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749780
77	NC_007622	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82749780
78	NC_007622	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	82749780
79	NC_007622	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	82749780
80	NC_007622	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	82749780
81	NC_007622	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749781
82	NC_007622	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	82749781
83	NC_007622	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82749781
84	NC_007622	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	82749781
85	NC_007622	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749781
86	NC_007622	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82749781
87	NC_007622	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82749781
88	NC_007622	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82749781
89	NC_007622	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749781
90	NC_007622	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	82749781
91	NC_007622	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82749781
92	NC_007622	GTT	2	6	4523	4528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749781
93	NC_007622	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749781
94	NC_007622	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749781
95	NC_007622	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749781
96	NC_007622	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749781
97	NC_007622	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749781
98	NC_007622	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749781
99	NC_007622	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749781
100	NC_007622	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749781
101	NC_007622	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82749782
102	NC_007622	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	82749782
103	NC_007622	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	82749782
104	NC_007622	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749782
105	NC_007622	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	82749782
106	NC_007622	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749782
107	NC_007622	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	82749782
108	NC_007622	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82749782
109	NC_007622	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82749782
110	NC_007622	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82749782
111	NC_007622	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82749782
112	NC_007622	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	82749782
113	NC_007622	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82749782
114	NC_007622	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	82749782
115	NC_007622	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749782
116	NC_007622	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	82749782
117	NC_007622	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749782
118	NC_007622	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749782
119	NC_007622	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749782
120	NC_007622	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82749782
121	NC_007622	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749782
122	NC_007622	TACG	2	8	5888	5895	25 %	25 %	25 %	25 %	82749782
123	NC_007622	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82749782
124	NC_007622	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749782
125	NC_007622	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	82749782
126	NC_007622	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749782
127	NC_007622	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749782
128	NC_007622	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82749782
129	NC_007622	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82749782
130	NC_007622	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	82749782
131	NC_007622	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82749782
132	NC_007622	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749782
133	NC_007622	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	82749782
134	NC_007622	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	82749782
135	NC_007622	TGA	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749782
136	NC_007622	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	82749782
137	NC_007622	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749782
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265	NC_007622	ATG	2	6	12286	12291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749785
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398	NC_007622	ATG	2	6	19522	19527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749791
399	NC_007622	TTG	2	6	19550	19555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749791
400	NC_007622	TAAA	2	8	19595	19602	75 %	25 %	0 %	0 %	82749791
401	NC_007622	GTT	2	6	19615	19620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82749791
402	NC_007622	ATC	2	6	19625	19630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82749791
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405	NC_007622	TA	3	6	19670	19675	50 %	50 %	0 %	0 %	82749791
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