MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_007613	ACA	2	6	193517	193522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542783
3503	NC_007613	GGT	2	6	193530	193535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542783
3504	NC_007613	TGG	2	6	193541	193546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542783
3505	NC_007613	CCA	2	6	193579	193584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542783
3506	NC_007613	ACG	3	9	193619	193627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542783
3507	NC_007613	CAT	2	6	193686	193691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542783
3508	NC_007613	TAA	2	6	193701	193706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542783
3509	NC_007613	GGC	2	6	193708	193713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542783
3510	NC_007613	CGG	2	6	193768	193773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542783
3511	NC_007613	CG	3	6	193825	193830	0 %	0 %	50 %	50 %	82542783
3512	NC_007613	TGA	2	6	193835	193840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542783
3513	NC_007613	GGT	2	6	193983	193988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542783
3514	NC_007613	TCA	2	6	194120	194125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542783
3515	NC_007613	GTT	2	6	194140	194145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542783
3516	NC_007613	CG	3	6	194148	194153	0 %	0 %	50 %	50 %	82542783
3517	NC_007613	GGC	2	6	194213	194218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542783
3518	NC_007613	TGT	2	6	194228	194233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542783
3519	NC_007613	TGA	2	6	194310	194315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542783
3520	NC_007613	TGA	2	6	194421	194426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542783
3521	NC_007613	CTA	2	6	194492	194497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542783
3522	NC_007613	CG	4	8	194514	194521	0 %	0 %	50 %	50 %	82542783
3523	NC_007613	TC	3	6	194548	194553	0 %	50 %	0 %	50 %	82542783
3524	NC_007613	TTA	2	6	194565	194570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542783
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3527	NC_007613	TGA	2	6	194885	194890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542784
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3529	NC_007613	CG	3	6	194913	194918	0 %	0 %	50 %	50 %	82542784
3530	NC_007613	TCG	2	6	194938	194943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542784
3531	NC_007613	GTC	2	6	194965	194970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542784
3532	NC_007613	TGA	2	6	194974	194979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542784
3533	NC_007613	TCA	2	6	194987	194992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542784
3534	NC_007613	A	6	6	195013	195018	100 %	0 %	0 %	0 %	82542784
3535	NC_007613	ATC	2	6	195105	195110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542784
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3537	NC_007613	GGT	2	6	195243	195248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542784
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3540	NC_007613	ATC	2	6	195393	195398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542784
3541	NC_007613	CAT	2	6	195434	195439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542784
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3546	NC_007613	TCG	2	6	195557	195562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542784
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3550	NC_007613	CCG	2	6	198050	198055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984985
3551	NC_007613	TGA	2	6	198109	198114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984985
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3553	NC_007613	CAT	2	6	198311	198316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542786
3554	NC_007613	GCG	2	6	198373	198378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542786
3555	NC_007613	CTG	2	6	198396	198401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542786
3556	NC_007613	CGGA	2	8	198420	198427	25 %	0 %	50 %	25 %	82542786
3557	NC_007613	GC	3	6	198446	198451	0 %	0 %	50 %	50 %	82542786
3558	NC_007613	TGG	2	6	198538	198543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542786
3559	NC_007613	CGA	2	6	198665	198670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542786
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3561	NC_007613	TTGC	2	8	198777	198784	0 %	50 %	25 %	25 %	82542786
3562	NC_007613	G	6	6	198793	198798	0 %	0 %	100 %	0 %	82542786
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3589	NC_007613	TCAT	2	8	199909	199916	25 %	50 %	0 %	25 %	82542787
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3593	NC_007613	CT	3	6	200349	200354	0 %	50 %	0 %	50 %	82542789
3594	NC_007613	GC	3	6	200362	200367	0 %	0 %	50 %	50 %	82542789
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3606	NC_007613	TTAAC	2	10	200789	200798	40 %	40 %	0 %	20 %	82542789
3607	NC_007613	CAA	2	6	200806	200811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542789
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3609	NC_007613	GCA	2	6	200897	200902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542790
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3871	NC_007613	T	6	6	221697	221702	0 %	100 %	0 %	0 %	82542807
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3989	NC_007613	CCAC	2	8	232732	232739	25 %	0 %	0 %	75 %	82542820
3990	NC_007613	TG	3	6	232896	232901	0 %	50 %	50 %	0 %	82542820
3991	NC_007613	ATAC	2	8	232912	232919	50 %	25 %	0 %	25 %	82542820
3992	NC_007613	GTC	2	6	233001	233006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542820
3993	NC_007613	ATG	2	6	233058	233063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542820
3994	NC_007613	GTAA	2	8	233099	233106	50 %	25 %	25 %	0 %	82542820
3995	NC_007613	CCAC	2	8	233113	233120	25 %	0 %	0 %	75 %	82542820
3996	NC_007613	AAC	2	6	233289	233294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542820
3997	NC_007613	TGA	2	6	233325	233330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542820
3998	NC_007613	TCTT	2	8	233355	233362	0 %	75 %	0 %	25 %	82542820
3999	NC_007613	GAT	2	6	233404	233409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542820
4000	NC_007613	CAG	2	6	233501	233506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542820

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