MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007613	CTG	2	6	84266	84271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542691
1502	NC_007613	TGG	2	6	84309	84314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542691
1503	NC_007613	TGA	2	6	84346	84351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542691
1504	NC_007613	GTG	2	6	84362	84367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542691
1505	NC_007613	TGG	2	6	84483	84488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542691
1506	NC_007613	CTG	2	6	84536	84541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542691
1507	NC_007613	GGT	2	6	84632	84637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542691
1508	NC_007613	TGG	2	6	84645	84650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542691
1509	NC_007613	GGT	2	6	84824	84829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542691
1510	NC_007613	CTG	2	6	84869	84874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542691
1511	NC_007613	G	6	6	84883	84888	0 %	0 %	100 %	0 %	82542691
1512	NC_007613	TCA	2	6	84976	84981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542691
1513	NC_007613	CG	3	6	85011	85016	0 %	0 %	50 %	50 %	82542691
1514	NC_007613	ATT	2	6	85034	85039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542691
1515	NC_007613	GTC	2	6	85114	85119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542692
1516	NC_007613	CTCG	2	8	85165	85172	0 %	25 %	25 %	50 %	82542692
1517	NC_007613	CGC	2	6	85181	85186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542692
1518	NC_007613	GCCTG	2	10	85212	85221	0 %	20 %	40 %	40 %	82542692
1519	NC_007613	ATG	2	6	85265	85270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542692
1520	NC_007613	GGC	2	6	85281	85286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542692
1521	NC_007613	CATC	2	8	85324	85331	25 %	25 %	0 %	50 %	82542692
1522	NC_007613	AAGCAC	2	12	85394	85405	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82542692
1523	NC_007613	CAC	2	6	85446	85451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542692
1524	NC_007613	GCG	2	6	85474	85479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542692
1525	NC_007613	GTGG	2	8	85495	85502	0 %	25 %	75 %	0 %	82542692
1526	NC_007613	TGC	2	6	85526	85531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542692
1527	NC_007613	GGC	2	6	85608	85613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542692
1528	NC_007613	GTTTG	2	10	85656	85665	0 %	60 %	40 %	0 %	82542692
1529	NC_007613	GTC	2	6	85717	85722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542692
1530	NC_007613	TGA	2	6	85728	85733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542692
1531	NC_007613	TGA	2	6	85761	85766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542692
1532	NC_007613	ATC	2	6	85811	85816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542692
1533	NC_007613	GCA	2	6	85887	85892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542692
1534	NC_007613	GCA	2	6	85912	85917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542692
1535	NC_007613	CTGGCA	2	12	85918	85929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	82542692
1536	NC_007613	CG	3	6	85946	85951	0 %	0 %	50 %	50 %	82542692
1537	NC_007613	CAG	2	6	85953	85958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542692
1538	NC_007613	ACC	2	6	85972	85977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542692
1539	NC_007613	GTG	2	6	86005	86010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542692
1540	NC_007613	GCG	2	6	86074	86079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542692
1541	NC_007613	TTG	2	6	86113	86118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542692
1542	NC_007613	GCG	2	6	86123	86128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542692
1543	NC_007613	CGG	2	6	86138	86143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542692
1544	NC_007613	GC	3	6	86158	86163	0 %	0 %	50 %	50 %	82542692
1545	NC_007613	GGC	2	6	86220	86225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542692
1546	NC_007613	AAC	2	6	86360	86365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542692
1547	NC_007613	TC	3	6	86415	86420	0 %	50 %	0 %	50 %	82542693
1548	NC_007613	GCG	2	6	86571	86576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542693
1549	NC_007613	TTC	3	9	86640	86648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542693
1550	NC_007613	CATT	2	8	86680	86687	25 %	50 %	0 %	25 %	82542693
1551	NC_007613	TGC	2	6	86746	86751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542693
1552	NC_007613	ATC	2	6	86760	86765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542693
1553	NC_007613	CTG	2	6	86766	86771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542693
1554	NC_007613	GATC	2	8	86819	86826	25 %	25 %	25 %	25 %	82542693
1555	NC_007613	TGC	2	6	86833	86838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542693
1556	NC_007613	CGA	2	6	86909	86914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542693
1557	NC_007613	TAA	2	6	86921	86926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542693
1558	NC_007613	CTG	2	6	86979	86984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542693
1559	NC_007613	GGT	4	12	87005	87016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542693
1560	NC_007613	TGT	2	6	87037	87042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542693
1561	NC_007613	ACCGT	2	10	87125	87134	20 %	20 %	20 %	40 %	82542693
1562	NC_007613	CCG	2	6	87137	87142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542693
1563	NC_007613	GAA	2	6	87318	87323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542693
1564	NC_007613	GTG	2	6	87339	87344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542693
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1566	NC_007613	CG	3	6	87378	87383	0 %	0 %	50 %	50 %	82542693
1567	NC_007613	ACC	2	6	87415	87420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542693
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1569	NC_007613	GGT	2	6	87543	87548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542693
1570	NC_007613	CAT	2	6	87575	87580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542693
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1573	NC_007613	GGT	2	6	87974	87979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542694
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1578	NC_007613	GTGG	2	8	88208	88215	0 %	25 %	75 %	0 %	82542694
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1581	NC_007613	GCA	2	6	88354	88359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542694
1582	NC_007613	TGA	2	6	88378	88383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542694
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1584	NC_007613	GTC	2	6	88412	88417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542694
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1592	NC_007613	GAAT	2	8	88766	88773	50 %	25 %	25 %	0 %	82542695
1593	NC_007613	ACA	2	6	88776	88781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542695
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1595	NC_007613	ATCAG	2	10	88898	88907	40 %	20 %	20 %	20 %	82542695
1596	NC_007613	GCA	2	6	88938	88943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542695
1597	NC_007613	CGA	2	6	88961	88966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542695
1598	NC_007613	ACGT	2	8	88991	88998	25 %	25 %	25 %	25 %	82542695
1599	NC_007613	GTT	2	6	89014	89019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542695
1600	NC_007613	CGT	2	6	89086	89091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542695
1601	NC_007613	GCTG	2	8	89100	89107	0 %	25 %	50 %	25 %	82542695
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1603	NC_007613	CGG	2	6	89223	89228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542695
1604	NC_007613	GCG	2	6	89239	89244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542695
1605	NC_007613	TGG	2	6	89330	89335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542695
1606	NC_007613	TACC	2	8	89370	89377	25 %	25 %	0 %	50 %	82542695
1607	NC_007613	TTA	2	6	89408	89413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542695
1608	NC_007613	TG	3	6	89453	89458	0 %	50 %	50 %	0 %	82542695
1609	NC_007613	TGA	2	6	89460	89465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542695
1610	NC_007613	CGTG	2	8	89538	89545	0 %	25 %	50 %	25 %	82542695
1611	NC_007613	AGA	2	6	89547	89552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542695
1612	NC_007613	CAG	2	6	89557	89562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542695
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1614	NC_007613	CGC	2	6	89655	89660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542695
1615	NC_007613	TGCGGT	2	12	89664	89675	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	82542695
1616	NC_007613	GAC	2	6	89695	89700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542695
1617	NC_007613	TGCG	2	8	89711	89718	0 %	25 %	50 %	25 %	82542695
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1619	NC_007613	CCA	2	6	89849	89854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542695
1620	NC_007613	GCG	2	6	89860	89865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542695
1621	NC_007613	CG	3	6	89864	89869	0 %	0 %	50 %	50 %	82542695
1622	NC_007613	CG	3	6	89927	89932	0 %	0 %	50 %	50 %	82542695
1623	NC_007613	ATG	2	6	89939	89944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542695
1624	NC_007613	GGA	2	6	90222	90227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542695
1625	NC_007613	AAC	2	6	90230	90235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542695
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1882	NC_007613	GCTG	2	8	105671	105678	0 %	25 %	50 %	25 %	82542711
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1999	NC_007613	CTT	2	6	112048	112053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542717
2000	NC_007613	GGC	2	6	112076	112081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542717

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