MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_007613	CGA	2	6	935079	935084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543453
16002	NC_007613	CT	3	6	935158	935163	0 %	50 %	0 %	50 %	82543453
16003	NC_007613	ATC	2	6	935204	935209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543453
16004	NC_007613	GAC	2	6	935215	935220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543453
16005	NC_007613	GTA	2	6	935227	935232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543453
16006	NC_007613	ACCG	2	8	935233	935240	25 %	0 %	25 %	50 %	82543453
16007	NC_007613	TC	3	6	935284	935289	0 %	50 %	0 %	50 %	82543453
16008	NC_007613	TCAA	2	8	935541	935548	50 %	25 %	0 %	25 %	82543454
16009	NC_007613	TGGT	2	8	935563	935570	0 %	50 %	50 %	0 %	82543454
16010	NC_007613	AAG	2	6	935712	935717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543454
16011	NC_007613	A	7	7	935729	935735	100 %	0 %	0 %	0 %	82543454
16012	NC_007613	GCC	2	6	935771	935776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543454
16013	NC_007613	ATC	2	6	935778	935783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543454
16014	NC_007613	CCAG	2	8	935796	935803	25 %	0 %	25 %	50 %	82543454
16015	NC_007613	AAT	2	6	936070	936075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543455
16016	NC_007613	CAA	2	6	936106	936111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543455
16017	NC_007613	ATT	2	6	936140	936145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543455
16018	NC_007613	CAT	2	6	936196	936201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543455
16019	NC_007613	AT	3	6	936210	936215	50 %	50 %	0 %	0 %	82543455
16020	NC_007613	AGA	2	6	936267	936272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543455
16021	NC_007613	ATT	2	6	936273	936278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543455
16022	NC_007613	TGC	2	6	936315	936320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543455
16023	NC_007613	CG	3	6	936520	936525	0 %	0 %	50 %	50 %	82543455
16024	NC_007613	ATG	2	6	936560	936565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543455
16025	NC_007613	ACC	2	6	936622	936627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543455
16026	NC_007613	CAA	2	6	936640	936645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543455
16027	NC_007613	AAGCG	2	10	936654	936663	40 %	0 %	40 %	20 %	82543455
16028	NC_007613	GCACA	2	10	936759	936768	40 %	0 %	20 %	40 %	82543455
16029	NC_007613	CTG	2	6	936772	936777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543455
16030	NC_007613	TGT	2	6	936855	936860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543455
16031	NC_007613	CGC	2	6	937068	937073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543455
16032	NC_007613	TTC	4	12	937226	937237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543455
16033	NC_007613	GAA	2	6	937258	937263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543455
16034	NC_007613	CGG	2	6	937759	937764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543456
16035	NC_007613	CAA	2	6	937850	937855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543456
16036	NC_007613	GGT	2	6	937985	937990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543456
16037	NC_007613	GCA	2	6	938123	938128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543456
16038	NC_007613	CT	3	6	938151	938156	0 %	50 %	0 %	50 %	82543456
16039	NC_007613	GAGATC	2	12	938211	938222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	82543456
16040	NC_007613	CTGC	2	8	938261	938268	0 %	25 %	25 %	50 %	82543456
16041	NC_007613	CAA	2	6	938282	938287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543456
16042	NC_007613	AGA	2	6	938354	938359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543456
16043	NC_007613	GC	3	6	938431	938436	0 %	0 %	50 %	50 %	82543456
16044	NC_007613	GAA	2	6	938460	938465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543456
16045	NC_007613	CAT	2	6	938519	938524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543456
16046	NC_007613	GC	3	6	938540	938545	0 %	0 %	50 %	50 %	82543456
16047	NC_007613	CTA	2	6	938618	938623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543456
16048	NC_007613	GCAC	2	8	938628	938635	25 %	0 %	25 %	50 %	82543456
16049	NC_007613	GAT	2	6	938661	938666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543456
16050	NC_007613	CTG	2	6	938697	938702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543456
16051	NC_007613	CGT	2	6	938751	938756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543456
16052	NC_007613	ACG	2	6	938764	938769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543456
16053	NC_007613	CAG	2	6	938811	938816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543456
16054	NC_007613	TTG	2	6	938818	938823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543456
16055	NC_007613	AGCGGT	2	12	938858	938869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82543456
16056	NC_007613	AAAT	2	8	938873	938880	75 %	25 %	0 %	0 %	82543456
16057	NC_007613	TGA	2	6	938905	938910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543456
16058	NC_007613	CGC	2	6	938911	938916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543456
16059	NC_007613	TG	3	6	938999	939004	0 %	50 %	50 %	0 %	82543456
16060	NC_007613	GCT	2	6	939041	939046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543456
16061	NC_007613	T	7	7	939502	939508	0 %	100 %	0 %	0 %	82543457
16062	NC_007613	CAT	2	6	939535	939540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543457
16063	NC_007613	T	6	6	939540	939545	0 %	100 %	0 %	0 %	82543457
16064	NC_007613	GCTTCG	2	12	939588	939599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543457
16065	NC_007613	GTA	2	6	939602	939607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543457
16066	NC_007613	TCA	2	6	939672	939677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543457
16067	NC_007613	GCACA	2	10	939682	939691	40 %	0 %	20 %	40 %	82543457
16068	NC_007613	ATA	2	6	939699	939704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543457
16069	NC_007613	TAAT	2	8	939712	939719	50 %	50 %	0 %	0 %	82543457
16070	NC_007613	AGC	2	6	939725	939730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543457
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16072	NC_007613	TAAT	2	8	941144	941151	50 %	50 %	0 %	0 %	82543458
16073	NC_007613	TCT	2	6	941162	941167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543458
16074	NC_007613	CAT	2	6	941198	941203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543458
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16077	NC_007613	TTA	2	6	941293	941298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543458
16078	NC_007613	GAC	2	6	941475	941480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543458
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16086	NC_007613	GAT	2	6	941877	941882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543458
16087	NC_007613	GAAT	2	8	941898	941905	50 %	25 %	25 %	0 %	82543458
16088	NC_007613	GGCAT	2	10	942040	942049	20 %	20 %	40 %	20 %	82543459
16089	NC_007613	CCA	2	6	942278	942283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543459
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16091	NC_007613	TGCCAG	2	12	942453	942464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	82543459
16092	NC_007613	CAG	2	6	942531	942536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543459
16093	NC_007613	AAT	3	9	942555	942563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543459
16094	NC_007613	T	6	6	942676	942681	0 %	100 %	0 %	0 %	82543459
16095	NC_007613	AT	3	6	942694	942699	50 %	50 %	0 %	0 %	82543459
16096	NC_007613	CCA	2	6	942709	942714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543459
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16103	NC_007613	ATT	2	6	943102	943107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543460
16104	NC_007613	TAA	2	6	943132	943137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543460
16105	NC_007613	ATA	2	6	943191	943196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543460
16106	NC_007613	CCA	2	6	943276	943281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543460
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16108	NC_007613	ATG	3	9	943368	943376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543460
16109	NC_007613	AAG	2	6	943437	943442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543460
16110	NC_007613	TGG	2	6	943447	943452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543460
16111	NC_007613	ACC	2	6	943539	943544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543460
16112	NC_007613	CAG	2	6	943556	943561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543460
16113	NC_007613	CCG	2	6	943596	943601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543460
16114	NC_007613	CCAT	2	8	943650	943657	25 %	25 %	0 %	50 %	82543460
16115	NC_007613	AGC	2	6	943683	943688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543460
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16119	NC_007613	AAAC	2	8	943987	943994	75 %	0 %	0 %	25 %	82543460
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16121	NC_007613	GCA	2	6	944050	944055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543460
16122	NC_007613	ACC	2	6	944103	944108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543460
16123	NC_007613	CCA	2	6	944164	944169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543460
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16233	NC_007613	CG	3	6	952220	952225	0 %	0 %	50 %	50 %	82543467
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16236	NC_007613	CTTG	2	8	952317	952324	0 %	50 %	25 %	25 %	82543468
16237	NC_007613	GCTG	2	8	952428	952435	0 %	25 %	50 %	25 %	82543468
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16486	NC_007613	TGG	2	6	967755	967760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543482
16487	NC_007613	AAAC	2	8	967768	967775	75 %	0 %	0 %	25 %	82543482
16488	NC_007613	CGC	2	6	967828	967833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543482
16489	NC_007613	CTG	2	6	967844	967849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543482
16490	NC_007613	ACC	2	6	967861	967866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543482
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