MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007613	TCA	2	6	878504	878509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543414
15002	NC_007613	AAT	2	6	878534	878539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543414
15003	NC_007613	ATT	2	6	878558	878563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543414
15004	NC_007613	GAAG	2	8	878564	878571	50 %	0 %	50 %	0 %	82543414
15005	NC_007613	TTCA	2	8	878608	878615	25 %	50 %	0 %	25 %	82543414
15006	NC_007613	ATC	2	6	878632	878637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543414
15007	NC_007613	A	6	6	878638	878643	100 %	0 %	0 %	0 %	82543414
15008	NC_007613	ATG	2	6	878654	878659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543414
15009	NC_007613	T	7	7	878668	878674	0 %	100 %	0 %	0 %	82543414
15010	NC_007613	ATTT	2	8	878679	878686	25 %	75 %	0 %	0 %	82543414
15011	NC_007613	A	6	6	878687	878692	100 %	0 %	0 %	0 %	82543414
15012	NC_007613	CAA	2	6	878721	878726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543414
15013	NC_007613	TTA	2	6	878816	878821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543414
15014	NC_007613	T	6	6	878834	878839	0 %	100 %	0 %	0 %	82543414
15015	NC_007613	T	8	8	878911	878918	0 %	100 %	0 %	0 %	82543414
15016	NC_007613	TAT	2	6	878934	878939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543414
15017	NC_007613	ATG	2	6	879026	879031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543414
15018	NC_007613	ATC	2	6	879037	879042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543414
15019	NC_007613	GAT	2	6	879053	879058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543414
15020	NC_007613	TCT	2	6	879072	879077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543414
15021	NC_007613	TCT	2	6	879189	879194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543414
15022	NC_007613	T	6	6	879197	879202	0 %	100 %	0 %	0 %	82543414
15023	NC_007613	AT	3	6	879211	879216	50 %	50 %	0 %	0 %	82543414
15024	NC_007613	TAGA	2	8	879255	879262	50 %	25 %	25 %	0 %	82543414
15025	NC_007613	ATTC	2	8	879300	879307	25 %	50 %	0 %	25 %	82543414
15026	NC_007613	AAT	3	9	879331	879339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543414
15027	NC_007613	AT	3	6	879396	879401	50 %	50 %	0 %	0 %	82543415
15028	NC_007613	TTA	2	6	879418	879423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543415
15029	NC_007613	AAG	2	6	879438	879443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543415
15030	NC_007613	T	7	7	879444	879450	0 %	100 %	0 %	0 %	82543415
15031	NC_007613	A	6	6	879459	879464	100 %	0 %	0 %	0 %	82543415
15032	NC_007613	ATA	2	6	879480	879485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543415
15033	NC_007613	CTT	2	6	879511	879516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543415
15034	NC_007613	TCTAG	2	10	879556	879565	20 %	40 %	20 %	20 %	82543415
15035	NC_007613	AATG	2	8	879568	879575	50 %	25 %	25 %	0 %	82543415
15036	NC_007613	CACT	2	8	879586	879593	25 %	25 %	0 %	50 %	82543415
15037	NC_007613	A	7	7	879636	879642	100 %	0 %	0 %	0 %	82543415
15038	NC_007613	ATAAAA	2	12	879657	879668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	82543415
15039	NC_007613	T	6	6	879717	879722	0 %	100 %	0 %	0 %	82543415
15040	NC_007613	AGCA	2	8	879747	879754	50 %	0 %	25 %	25 %	82543415
15041	NC_007613	CTA	2	6	879815	879820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543415
15042	NC_007613	AT	3	6	879907	879912	50 %	50 %	0 %	0 %	82543415
15043	NC_007613	TAA	2	6	879932	879937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543415
15044	NC_007613	TA	5	10	879944	879953	50 %	50 %	0 %	0 %	82543415
15045	NC_007613	ATT	2	6	879966	879971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543415
15046	NC_007613	ATT	2	6	880038	880043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543415
15047	NC_007613	AAT	2	6	880056	880061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543415
15048	NC_007613	ATC	2	6	880062	880067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543415
15049	NC_007613	T	9	9	880081	880089	0 %	100 %	0 %	0 %	82543415
15050	NC_007613	CTAT	2	8	880096	880103	25 %	50 %	0 %	25 %	82543415
15051	NC_007613	CTT	2	6	880130	880135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543415
15052	NC_007613	TAA	2	6	880168	880173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543415
15053	NC_007613	TCCAT	2	10	880183	880192	20 %	40 %	0 %	40 %	82543415
15054	NC_007613	ATC	2	6	880294	880299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543416
15055	NC_007613	AAT	2	6	880303	880308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543416
15056	NC_007613	CT	3	6	880319	880324	0 %	50 %	0 %	50 %	82543416
15057	NC_007613	GAT	2	6	880326	880331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543416
15058	NC_007613	AAT	2	6	880332	880337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543416
15059	NC_007613	TA	3	6	880347	880352	50 %	50 %	0 %	0 %	82543416
15060	NC_007613	CCG	2	6	880359	880364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543416
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15062	NC_007613	CTT	2	6	880632	880637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543416
15063	NC_007613	A	6	6	880663	880668	100 %	0 %	0 %	0 %	82543416
15064	NC_007613	TAAT	2	8	880745	880752	50 %	50 %	0 %	0 %	82543417
15065	NC_007613	CAG	2	6	880769	880774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543417
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15070	NC_007613	CAT	2	6	880973	880978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543417
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15081	NC_007613	CAG	2	6	881423	881428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543417
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15083	NC_007613	GAG	2	6	881440	881445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543417
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15087	NC_007613	CCGC	2	8	881592	881599	0 %	0 %	25 %	75 %	82543417
15088	NC_007613	ATA	2	6	881604	881609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543417
15089	NC_007613	AAT	2	6	881703	881708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543418
15090	NC_007613	CTG	2	6	881765	881770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543418
15091	NC_007613	GAC	2	6	881803	881808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543418
15092	NC_007613	TGT	2	6	881828	881833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543418
15093	NC_007613	TTG	2	6	881850	881855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543418
15094	NC_007613	GC	3	6	881879	881884	0 %	0 %	50 %	50 %	82543418
15095	NC_007613	GCA	2	6	881901	881906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543418
15096	NC_007613	TAA	2	6	882046	882051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543418
15097	NC_007613	TTC	2	6	882059	882064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543418
15098	NC_007613	GCGGT	2	10	882211	882220	0 %	20 %	60 %	20 %	82543418
15099	NC_007613	CCT	2	6	882229	882234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543418
15100	NC_007613	AGTAG	2	10	882272	882281	40 %	20 %	40 %	0 %	82543418
15101	NC_007613	GCT	2	6	882309	882314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543418
15102	NC_007613	AGC	2	6	882395	882400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543418
15103	NC_007613	T	7	7	882427	882433	0 %	100 %	0 %	0 %	82543418
15104	NC_007613	CAC	2	6	882469	882474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543418
15105	NC_007613	AAT	2	6	882475	882480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543418
15106	NC_007613	ACCT	2	8	882545	882552	25 %	25 %	0 %	50 %	82543418
15107	NC_007613	AGG	2	6	882570	882575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543418
15108	NC_007613	GGC	2	6	882588	882593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543419
15109	NC_007613	CAC	2	6	882627	882632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543419
15110	NC_007613	TCT	2	6	882738	882743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543419
15111	NC_007613	TTTTC	2	10	882873	882882	0 %	80 %	0 %	20 %	82543419
15112	NC_007613	CCA	2	6	882890	882895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543419
15113	NC_007613	ACG	2	6	882929	882934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543419
15114	NC_007613	TA	3	6	882936	882941	50 %	50 %	0 %	0 %	82543419
15115	NC_007613	ACGC	2	8	882942	882949	25 %	0 %	25 %	50 %	82543419
15116	NC_007613	CG	3	6	883129	883134	0 %	0 %	50 %	50 %	82543419
15117	NC_007613	GTC	2	6	883193	883198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543419
15118	NC_007613	TTC	2	6	883216	883221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543419
15119	NC_007613	TAT	2	6	883224	883229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543419
15120	NC_007613	ATG	2	6	883279	883284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543419
15121	NC_007613	CAA	2	6	883362	883367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543419
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15123	NC_007613	TCAGAA	2	12	883520	883531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82543419
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15488	NC_007613	GCG	2	6	903140	903145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543435
15489	NC_007613	CAG	2	6	903212	903217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543435
15490	NC_007613	GCC	2	6	903222	903227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543435
15491	NC_007613	TTG	2	6	903234	903239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543435
15492	NC_007613	GCA	2	6	903299	903304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543435
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