MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_007613	AGCC	2	8	712439	712446	25 %	0 %	25 %	50 %	82543253
12003	NC_007613	GCCA	2	8	712511	712518	25 %	0 %	25 %	50 %	82543253
12004	NC_007613	AAAC	2	8	712536	712543	75 %	0 %	0 %	25 %	82543253
12005	NC_007613	AAT	2	6	712555	712560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543253
12006	NC_007613	CAT	2	6	712585	712590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543253
12007	NC_007613	AAC	2	6	712616	712621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543253
12008	NC_007613	GAAAA	2	10	712622	712631	80 %	0 %	20 %	0 %	82543253
12009	NC_007613	GCCA	2	8	712655	712662	25 %	0 %	25 %	50 %	82543253
12010	NC_007613	T	6	6	712750	712755	0 %	100 %	0 %	0 %	82543253
12011	NC_007613	ATG	2	6	712802	712807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543253
12012	NC_007613	CGA	2	6	712907	712912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543253
12013	NC_007613	A	6	6	712974	712979	100 %	0 %	0 %	0 %	82543253
12014	NC_007613	GTA	2	6	712986	712991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543253
12015	NC_007613	AAAC	2	8	713029	713036	75 %	0 %	0 %	25 %	82543253
12016	NC_007613	TTG	2	6	713038	713043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543253
12017	NC_007613	CTGC	2	8	713060	713067	0 %	25 %	25 %	50 %	82543253
12018	NC_007613	AAT	2	6	713099	713104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543253
12019	NC_007613	ATA	2	6	713129	713134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543253
12020	NC_007613	ATC	2	6	713147	713152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543253
12021	NC_007613	T	7	7	713186	713192	0 %	100 %	0 %	0 %	82543253
12022	NC_007613	GCGG	2	8	713368	713375	0 %	0 %	75 %	25 %	82543253
12023	NC_007613	GGC	2	6	713394	713399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543253
12024	NC_007613	GCA	2	6	713418	713423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543253
12025	NC_007613	CGG	2	6	713446	713451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543253
12026	NC_007613	T	8	8	713569	713576	0 %	100 %	0 %	0 %	82543253
12027	NC_007613	CGTTGT	2	12	713617	713628	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	82543253
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12029	NC_007613	AGA	2	6	713679	713684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543253
12030	NC_007613	CAT	2	6	713820	713825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543254
12031	NC_007613	CGT	2	6	713845	713850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543254
12032	NC_007613	GTA	2	6	713907	713912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543254
12033	NC_007613	GCG	2	6	713938	713943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543254
12034	NC_007613	AAC	2	6	713956	713961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543254
12035	NC_007613	TTA	2	6	713977	713982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543254
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12038	NC_007613	TGA	2	6	714224	714229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543254
12039	NC_007613	TAC	2	6	714252	714257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543254
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12042	NC_007613	TGC	2	6	714363	714368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543254
12043	NC_007613	CTT	2	6	714372	714377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543254
12044	NC_007613	AGCGA	2	10	714385	714394	40 %	0 %	40 %	20 %	82543254
12045	NC_007613	CCG	2	6	714434	714439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543254
12046	NC_007613	ATC	3	9	714540	714548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543254
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12050	NC_007613	GCTG	2	8	714778	714785	0 %	25 %	50 %	25 %	82543254
12051	NC_007613	CAA	2	6	714788	714793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543254
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12054	NC_007613	GTTT	2	8	714842	714849	0 %	75 %	25 %	0 %	82543254
12055	NC_007613	TCG	2	6	714850	714855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543254
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12062	NC_007613	GC	3	6	715688	715693	0 %	0 %	50 %	50 %	82543255
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12068	NC_007613	CTG	2	6	715884	715889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543255
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12088	NC_007613	GCCA	2	8	716699	716706	25 %	0 %	25 %	50 %	82543256
12089	NC_007613	TTA	2	6	716930	716935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543257
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12119	NC_007613	GA	3	6	719120	719125	50 %	0 %	50 %	0 %	82543259
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12121	NC_007613	CGA	2	6	719420	719425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543259
12122	NC_007613	A	6	6	719508	719513	100 %	0 %	0 %	0 %	82543259
12123	NC_007613	CCCA	2	8	719524	719531	25 %	0 %	0 %	75 %	82543259
12124	NC_007613	ACA	2	6	719547	719552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543259
12125	NC_007613	CGCAG	2	10	719633	719642	20 %	0 %	40 %	40 %	82543259
12126	NC_007613	A	7	7	720128	720134	100 %	0 %	0 %	0 %	82543260
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12129	NC_007613	ACA	2	6	720363	720368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543260
12130	NC_007613	TAC	2	6	720377	720382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543260
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12134	NC_007613	ATTT	2	8	720806	720813	25 %	75 %	0 %	0 %	82543261
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12226	NC_007613	CGA	2	6	726174	726179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543265
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12229	NC_007613	GCTG	2	8	726212	726219	0 %	25 %	50 %	25 %	82543265
12230	NC_007613	ATC	3	9	726253	726261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543265
12231	NC_007613	CGG	2	6	726362	726367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543265
12232	NC_007613	CTG	2	6	726388	726393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543265
12233	NC_007613	AAG	2	6	726406	726411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543265
12234	NC_007613	CG	5	10	726488	726497	0 %	0 %	50 %	50 %	82543265
12235	NC_007613	TGGAAG	2	12	726596	726607	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	82543265
12236	NC_007613	CTG	3	9	726655	726663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543265
12237	NC_007613	TGA	2	6	726719	726724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543265
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12239	NC_007613	CG	3	6	726780	726785	0 %	0 %	50 %	50 %	82543265
12240	NC_007613	TAC	2	6	726793	726798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543265
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12486	NC_007613	CGC	2	6	740998	741003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543276
12487	NC_007613	GCTG	2	8	741120	741127	0 %	25 %	50 %	25 %	82543276
12488	NC_007613	GCA	2	6	741151	741156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543276
12489	NC_007613	TCC	2	6	741167	741172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543276
12490	NC_007613	GC	3	6	741206	741211	0 %	0 %	50 %	50 %	82543276
12491	NC_007613	CG	3	6	741218	741223	0 %	0 %	50 %	50 %	82543276
12492	NC_007613	GAT	2	6	741322	741327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543276
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12494	NC_007613	GGT	2	6	741371	741376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543276
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