MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007613	GAT	2	6	648975	648980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543193
11002	NC_007613	CAG	2	6	649072	649077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543193
11003	NC_007613	GCG	2	6	649155	649160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543194
11004	NC_007613	GGT	2	6	649209	649214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543194
11005	NC_007613	GCC	2	6	649315	649320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543194
11006	NC_007613	GCAG	2	8	649554	649561	25 %	0 %	50 %	25 %	82543195
11007	NC_007613	CAGA	2	8	649591	649598	50 %	0 %	25 %	25 %	82543195
11008	NC_007613	CTG	2	6	649618	649623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543195
11009	NC_007613	CTT	2	6	649645	649650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543195
11010	NC_007613	GAA	2	6	649660	649665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543195
11011	NC_007613	GGT	2	6	649678	649683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543195
11012	NC_007613	TGT	2	6	649823	649828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543196
11013	NC_007613	TCAGAT	2	12	649830	649841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82543196
11014	NC_007613	GCCA	2	8	649917	649924	25 %	0 %	25 %	50 %	82543196
11015	NC_007613	CAG	2	6	649957	649962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543196
11016	NC_007613	AGA	2	6	649967	649972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543196
11017	NC_007613	TCC	2	6	650022	650027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543196
11018	NC_007613	CAGC	2	8	650050	650057	25 %	0 %	25 %	50 %	82543196
11019	NC_007613	ATCAC	2	10	650114	650123	40 %	20 %	0 %	40 %	82543196
11020	NC_007613	T	6	6	650164	650169	0 %	100 %	0 %	0 %	82543196
11021	NC_007613	CAC	2	6	650367	650372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543197
11022	NC_007613	AGGA	2	8	650390	650397	50 %	0 %	50 %	0 %	82543197
11023	NC_007613	ATGGAA	2	12	650404	650415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82543197
11024	NC_007613	CAT	2	6	650440	650445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543197
11025	NC_007613	GCA	2	6	650465	650470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543197
11026	NC_007613	TTAA	2	8	650511	650518	50 %	50 %	0 %	0 %	82543197
11027	NC_007613	TTTC	2	8	650572	650579	0 %	75 %	0 %	25 %	82543197
11028	NC_007613	ATAA	2	8	650602	650609	75 %	25 %	0 %	0 %	82543197
11029	NC_007613	T	7	7	650795	650801	0 %	100 %	0 %	0 %	82543198
11030	NC_007613	AGC	2	6	650803	650808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543198
11031	NC_007613	TGA	2	6	650813	650818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543198
11032	NC_007613	GAC	2	6	650865	650870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543198
11033	NC_007613	TTA	2	6	650930	650935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543198
11034	NC_007613	CAGAC	2	10	651034	651043	40 %	0 %	20 %	40 %	82543198
11035	NC_007613	GTG	2	6	651097	651102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543198
11036	NC_007613	TG	3	6	651251	651256	0 %	50 %	50 %	0 %	82543198
11037	NC_007613	CAG	2	6	651319	651324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543198
11038	NC_007613	GGTTCG	2	12	651348	651359	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	82543198
11039	NC_007613	GAT	2	6	651439	651444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543198
11040	NC_007613	GCC	2	6	651471	651476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543198
11041	NC_007613	GGC	2	6	651681	651686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543199
11042	NC_007613	CAC	2	6	651786	651791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543199
11043	NC_007613	CTG	2	6	651924	651929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543200
11044	NC_007613	CAT	2	6	652020	652025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543200
11045	NC_007613	GAA	2	6	652067	652072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543200
11046	NC_007613	ATC	2	6	652099	652104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543200
11047	NC_007613	GTT	2	6	652136	652141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543200
11048	NC_007613	TTAC	2	8	652324	652331	25 %	50 %	0 %	25 %	82543200
11049	NC_007613	ATT	2	6	652368	652373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543200
11050	NC_007613	GTAT	2	8	652511	652518	25 %	50 %	25 %	0 %	82543200
11051	NC_007613	AC	3	6	652528	652533	50 %	0 %	0 %	50 %	82543200
11052	NC_007613	GTGG	2	8	652691	652698	0 %	25 %	75 %	0 %	82543200
11053	NC_007613	TAA	2	6	652706	652711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543200
11054	NC_007613	CGA	2	6	652713	652718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543200
11055	NC_007613	GCAGAA	2	12	652749	652760	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82543200
11056	NC_007613	TTA	2	6	652766	652771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543200
11057	NC_007613	GAT	2	6	652788	652793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543200
11058	NC_007613	CTT	2	6	652911	652916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543201
11059	NC_007613	GTT	2	6	652941	652946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543201
11060	NC_007613	TTG	2	6	652966	652971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543201
11061	NC_007613	CTGG	2	8	652988	652995	0 %	25 %	50 %	25 %	82543201
11062	NC_007613	T	6	6	653006	653011	0 %	100 %	0 %	0 %	82543201
11063	NC_007613	CTTT	2	8	653029	653036	0 %	75 %	0 %	25 %	82543201
11064	NC_007613	AAGA	2	8	653043	653050	75 %	0 %	25 %	0 %	82543201
11065	NC_007613	GCA	2	6	653129	653134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543201
11066	NC_007613	GGGA	2	8	653169	653176	25 %	0 %	75 %	0 %	82543201
11067	NC_007613	AGC	2	6	653177	653182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543201
11068	NC_007613	TGCG	2	8	653209	653216	0 %	25 %	50 %	25 %	82543201
11069	NC_007613	CGAC	2	8	653256	653263	25 %	0 %	25 %	50 %	82543201
11070	NC_007613	GGCT	2	8	653286	653293	0 %	25 %	50 %	25 %	82543201
11071	NC_007613	GGA	2	6	653315	653320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543201
11072	NC_007613	GCC	2	6	653333	653338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543201
11073	NC_007613	CTG	2	6	653343	653348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543201
11074	NC_007613	CTG	2	6	653398	653403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543201
11075	NC_007613	GCC	2	6	653496	653501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543201
11076	NC_007613	TGG	2	6	653513	653518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543201
11077	NC_007613	T	7	7	653528	653534	0 %	100 %	0 %	0 %	82543201
11078	NC_007613	GGC	2	6	653558	653563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543201
11079	NC_007613	GCT	3	9	653604	653612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543201
11080	NC_007613	GGA	2	6	653615	653620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543201
11081	NC_007613	CAC	2	6	653756	653761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543201
11082	NC_007613	ATA	2	6	653871	653876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543202
11083	NC_007613	GGC	2	6	653930	653935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543202
11084	NC_007613	TATT	2	8	653980	653987	25 %	75 %	0 %	0 %	82543202
11085	NC_007613	TGT	2	6	654052	654057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543202
11086	NC_007613	ACC	2	6	654116	654121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543202
11087	NC_007613	TAA	2	6	654124	654129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543202
11088	NC_007613	CCA	2	6	654219	654224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543202
11089	NC_007613	TAA	2	6	654352	654357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543202
11090	NC_007613	GTC	2	6	654439	654444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543202
11091	NC_007613	GAT	2	6	655390	655395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543203
11092	NC_007613	GCTGAT	2	12	655565	655576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82543203
11093	NC_007613	GGA	2	6	655603	655608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543203
11094	NC_007613	CTG	2	6	655626	655631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543203
11095	NC_007613	CTC	2	6	655676	655681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543203
11096	NC_007613	TGT	2	6	655734	655739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543203
11097	NC_007613	CGT	2	6	655991	655996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543204
11098	NC_007613	CTG	2	6	656018	656023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543204
11099	NC_007613	AAC	2	6	656025	656030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543204
11100	NC_007613	TCG	2	6	656107	656112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543204
11101	NC_007613	AAAT	2	8	656139	656146	75 %	25 %	0 %	0 %	82543204
11102	NC_007613	AGA	2	6	656158	656163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543204
11103	NC_007613	AAC	2	6	656220	656225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543204
11104	NC_007613	AGC	2	6	656237	656242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543204
11105	NC_007613	A	7	7	656272	656278	100 %	0 %	0 %	0 %	82543204
11106	NC_007613	TGC	2	6	656480	656485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543205
11107	NC_007613	CGC	2	6	656496	656501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543205
11108	NC_007613	ATG	2	6	656505	656510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543205
11109	NC_007613	TGA	2	6	656551	656556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543205
11110	NC_007613	GAA	2	6	656587	656592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543205
11111	NC_007613	AT	3	6	656605	656610	50 %	50 %	0 %	0 %	82543205
11112	NC_007613	CGG	2	6	656658	656663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543205
11113	NC_007613	AGC	2	6	656706	656711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543205
11114	NC_007613	GCAG	2	8	656737	656744	25 %	0 %	50 %	25 %	82543205
11115	NC_007613	GGC	2	6	656789	656794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543205
11116	NC_007613	GCG	2	6	656827	656832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543205
11117	NC_007613	TA	3	6	656847	656852	50 %	50 %	0 %	0 %	82543205
11118	NC_007613	GAA	2	6	656876	656881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543205
11119	NC_007613	AC	3	6	657019	657024	50 %	0 %	0 %	50 %	82543205
11120	NC_007613	A	6	6	657032	657037	100 %	0 %	0 %	0 %	82543205
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11122	NC_007613	TGA	2	6	657100	657105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543205
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11239	NC_007613	TGAAA	2	10	663766	663775	60 %	20 %	20 %	0 %	82543213
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11243	NC_007613	CTG	2	6	664087	664092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543214
11244	NC_007613	TCCGCA	2	12	664130	664141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82543214
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11246	NC_007613	TCC	2	6	664499	664504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543214
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11484	NC_007613	GGC	2	6	678646	678651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543225
11485	NC_007613	AAC	2	6	678704	678709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543225
11486	NC_007613	ACA	2	6	678780	678785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543225
11487	NC_007613	GACT	2	8	678791	678798	25 %	25 %	25 %	25 %	82543225
11488	NC_007613	AT	3	6	678852	678857	50 %	50 %	0 %	0 %	82543225
11489	NC_007613	CGC	2	6	678884	678889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543225
11490	NC_007613	GA	3	6	678896	678901	50 %	0 %	50 %	0 %	82543225
11491	NC_007613	CCTTG	2	10	678954	678963	0 %	40 %	20 %	40 %	82543225
11492	NC_007613	CAA	2	6	679742	679747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543226
11493	NC_007613	GGC	2	6	679754	679759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543226
11494	NC_007613	TTC	2	6	679785	679790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543226
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