MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_007613	TAAG	2	8	618772	618779	50 %	25 %	25 %	0 %	82543161
10502	NC_007613	TGA	2	6	618900	618905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543162
10503	NC_007613	ATGT	2	8	618991	618998	25 %	50 %	25 %	0 %	82543162
10504	NC_007613	T	6	6	619134	619139	0 %	100 %	0 %	0 %	82543162
10505	NC_007613	TTGC	2	8	619145	619152	0 %	50 %	25 %	25 %	82543162
10506	NC_007613	TCT	3	9	619182	619190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543162
10507	NC_007613	CTA	2	6	619380	619385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543163
10508	NC_007613	GGT	2	6	619402	619407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543163
10509	NC_007613	GTG	2	6	619408	619413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543163
10510	NC_007613	GCAC	2	8	619447	619454	25 %	0 %	25 %	50 %	82543163
10511	NC_007613	TGC	2	6	619460	619465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543163
10512	NC_007613	TCA	3	9	619467	619475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543163
10513	NC_007613	TCAG	2	8	619478	619485	25 %	25 %	25 %	25 %	82543163
10514	NC_007613	CGA	2	6	619560	619565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543163
10515	NC_007613	TGAA	2	8	619655	619662	50 %	25 %	25 %	0 %	82543163
10516	NC_007613	GTT	2	6	619675	619680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543163
10517	NC_007613	TGAC	2	8	619747	619754	25 %	25 %	25 %	25 %	82543163
10518	NC_007613	TTGATT	2	12	619809	619820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	82543164
10519	NC_007613	ATT	2	6	619845	619850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543164
10520	NC_007613	GCG	2	6	619878	619883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543164
10521	NC_007613	TCTGG	2	10	619912	619921	0 %	40 %	40 %	20 %	82543164
10522	NC_007613	CT	3	6	619929	619934	0 %	50 %	0 %	50 %	82543164
10523	NC_007613	AG	3	6	619946	619951	50 %	0 %	50 %	0 %	82543164
10524	NC_007613	CGC	2	6	620294	620299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543164
10525	NC_007613	CGG	2	6	620305	620310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543164
10526	NC_007613	AAAC	2	8	620342	620349	75 %	0 %	0 %	25 %	82543164
10527	NC_007613	CAA	2	6	620426	620431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543164
10528	NC_007613	GTC	2	6	620464	620469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543165
10529	NC_007613	CTG	2	6	620514	620519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543165
10530	NC_007613	CAT	2	6	620552	620557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543165
10531	NC_007613	TTG	2	6	620635	620640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543165
10532	NC_007613	GTG	2	6	620667	620672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543165
10533	NC_007613	ACC	2	6	620699	620704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543165
10534	NC_007613	GGT	2	6	620711	620716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543165
10535	NC_007613	AAT	2	6	620798	620803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543165
10536	NC_007613	GGTT	2	8	620843	620850	0 %	50 %	50 %	0 %	82543165
10537	NC_007613	ATT	2	6	620980	620985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543166
10538	NC_007613	CAG	2	6	620987	620992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10539	NC_007613	TGC	2	6	620993	620998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10540	NC_007613	GCG	2	6	621013	621018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543166
10541	NC_007613	GTTC	2	8	621029	621036	0 %	50 %	25 %	25 %	82543166
10542	NC_007613	GGC	2	6	621064	621069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543166
10543	NC_007613	GGT	2	6	621070	621075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543166
10544	NC_007613	TGA	2	6	621165	621170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543166
10545	NC_007613	CAG	2	6	621190	621195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10546	NC_007613	GCT	2	6	621196	621201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10547	NC_007613	GAA	2	6	621202	621207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543166
10548	NC_007613	GAA	2	6	621295	621300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543166
10549	NC_007613	AAGC	2	8	621328	621335	50 %	0 %	25 %	25 %	82543166
10550	NC_007613	GGC	2	6	621342	621347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543166
10551	NC_007613	GCG	2	6	621355	621360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543166
10552	NC_007613	GAA	2	6	621379	621384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543166
10553	NC_007613	GAA	2	6	621390	621395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543166
10554	NC_007613	GAA	2	6	621411	621416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543166
10555	NC_007613	A	6	6	621415	621420	100 %	0 %	0 %	0 %	82543166
10556	NC_007613	GCAGAA	2	12	621421	621432	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82543166
10557	NC_007613	GCC	2	6	621433	621438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543166
10558	NC_007613	A	6	6	621460	621465	100 %	0 %	0 %	0 %	82543166
10559	NC_007613	GAA	3	9	621489	621497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543166
10560	NC_007613	AGC	2	6	621513	621518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10561	NC_007613	AAGA	2	8	621531	621538	75 %	0 %	25 %	0 %	82543166
10562	NC_007613	GCT	2	6	621553	621558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543166
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10564	NC_007613	GCT	2	6	621592	621597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10565	NC_007613	GCA	2	6	621625	621630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10566	NC_007613	A	6	6	621649	621654	100 %	0 %	0 %	0 %	82543166
10567	NC_007613	GCA	2	6	621655	621660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10568	NC_007613	GCT	2	6	621670	621675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10569	NC_007613	GCA	2	6	621682	621687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10570	NC_007613	AGC	2	6	621699	621704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
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10572	NC_007613	A	6	6	621727	621732	100 %	0 %	0 %	0 %	82543166
10573	NC_007613	GCGGCA	2	12	621733	621744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	82543166
10574	NC_007613	AGC	3	9	621747	621755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
10575	NC_007613	GCA	2	6	621769	621774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
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10578	NC_007613	AAGT	2	8	621957	621964	50 %	25 %	25 %	0 %	82543166
10579	NC_007613	GCA	2	6	622087	622092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543166
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10582	NC_007613	GTC	2	6	622409	622414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543167
10583	NC_007613	GTT	2	6	622423	622428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543167
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10587	NC_007613	GGTCA	2	10	622612	622621	20 %	20 %	40 %	20 %	82543167
10588	NC_007613	TTG	2	6	622661	622666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543167
10589	NC_007613	GGC	2	6	622672	622677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543167
10590	NC_007613	GTACT	2	10	622685	622694	20 %	40 %	20 %	20 %	82543167
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10594	NC_007613	GCA	2	6	623072	623077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543167
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10596	NC_007613	GTC	2	6	623237	623242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543167
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10601	NC_007613	GTC	2	6	623421	623426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543167
10602	NC_007613	GGGAT	2	10	623494	623503	20 %	20 %	60 %	0 %	82543167
10603	NC_007613	CCTG	2	8	623578	623585	0 %	25 %	25 %	50 %	82543167
10604	NC_007613	ATA	2	6	623601	623606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543167
10605	NC_007613	TGA	2	6	623664	623669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543168
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10608	NC_007613	CGG	2	6	623773	623778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543168
10609	NC_007613	GCA	2	6	623830	623835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543168
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10611	NC_007613	ACA	2	6	623985	623990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543168
10612	NC_007613	CGT	2	6	624005	624010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543168
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10616	NC_007613	CAGC	2	8	624322	624329	25 %	0 %	25 %	50 %	82543169
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10618	NC_007613	AATC	2	8	624362	624369	50 %	25 %	0 %	25 %	82543169
10619	NC_007613	CAG	2	6	624469	624474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543169
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