MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007613	CAA	2	6	588232	588237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543137
10002	NC_007613	CGGG	2	8	588290	588297	0 %	0 %	75 %	25 %	82543137
10003	NC_007613	TCGCC	2	10	588301	588310	0 %	20 %	20 %	60 %	82543137
10004	NC_007613	TTG	2	6	588325	588330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543137
10005	NC_007613	TGA	2	6	588413	588418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543137
10006	NC_007613	TGC	2	6	588543	588548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543137
10007	NC_007613	CTGG	2	8	588569	588576	0 %	25 %	50 %	25 %	82543137
10008	NC_007613	GAT	2	6	588594	588599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543137
10009	NC_007613	TTG	2	6	588625	588630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543137
10010	NC_007613	GCGA	2	8	588647	588654	25 %	0 %	50 %	25 %	82543137
10011	NC_007613	TGAT	2	8	588671	588678	25 %	50 %	25 %	0 %	82543137
10012	NC_007613	TGGC	2	8	588702	588709	0 %	25 %	50 %	25 %	82543137
10013	NC_007613	TCG	2	6	588807	588812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543137
10014	NC_007613	GAA	2	6	588955	588960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543137
10015	NC_007613	TAT	2	6	589018	589023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543138
10016	NC_007613	CCAGCG	2	12	589028	589039	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	82543138
10017	NC_007613	CG	3	6	589038	589043	0 %	0 %	50 %	50 %	82543138
10018	NC_007613	ATC	2	6	589075	589080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543138
10019	NC_007613	AC	3	6	589093	589098	50 %	0 %	0 %	50 %	82543138
10020	NC_007613	AT	3	6	589135	589140	50 %	50 %	0 %	0 %	82543138
10021	NC_007613	AGT	2	6	589151	589156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543138
10022	NC_007613	AGC	2	6	589240	589245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543138
10023	NC_007613	AGA	2	6	589374	589379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543138
10024	NC_007613	TCA	2	6	589436	589441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543138
10025	NC_007613	CTTT	2	8	589498	589505	0 %	75 %	0 %	25 %	82543138
10026	NC_007613	ACC	2	6	589507	589512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543138
10027	NC_007613	AC	3	6	589523	589528	50 %	0 %	0 %	50 %	82543138
10028	NC_007613	GCC	2	6	589638	589643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543138
10029	NC_007613	TGT	2	6	589645	589650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543138
10030	NC_007613	AAC	2	6	589663	589668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543138
10031	NC_007613	GAA	2	6	589674	589679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543138
10032	NC_007613	AAT	2	6	589764	589769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543138
10033	NC_007613	CCA	2	6	589838	589843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543138
10034	NC_007613	CAG	2	6	589851	589856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543138
10035	NC_007613	CGCA	2	8	589887	589894	25 %	0 %	25 %	50 %	82543138
10036	NC_007613	T	6	6	589899	589904	0 %	100 %	0 %	0 %	82543138
10037	NC_007613	CGC	2	6	589910	589915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543138
10038	NC_007613	TG	3	6	589921	589926	0 %	50 %	50 %	0 %	82543138
10039	NC_007613	CCG	2	6	589976	589981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543138
10040	NC_007613	ATA	2	6	590044	590049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543138
10041	NC_007613	ACG	2	6	590094	590099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543138
10042	NC_007613	GGAT	2	8	590203	590210	25 %	25 %	50 %	0 %	82543138
10043	NC_007613	CAG	2	6	590406	590411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543138
10044	NC_007613	GC	3	6	590473	590478	0 %	0 %	50 %	50 %	82543138
10045	NC_007613	ATA	2	6	590500	590505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543138
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10049	NC_007613	GCCA	2	8	590901	590908	25 %	0 %	25 %	50 %	82543139
10050	NC_007613	CAT	2	6	590958	590963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543139
10051	NC_007613	TGGC	2	8	591053	591060	0 %	25 %	50 %	25 %	82543139
10052	NC_007613	GGC	2	6	591107	591112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543139
10053	NC_007613	CCT	2	6	591199	591204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543139
10054	NC_007613	GGT	2	6	591260	591265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543139
10055	NC_007613	GCG	2	6	591289	591294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543139
10056	NC_007613	CG	3	6	591317	591322	0 %	0 %	50 %	50 %	82543139
10057	NC_007613	TTA	2	6	591340	591345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543139
10058	NC_007613	CATT	2	8	591368	591375	25 %	50 %	0 %	25 %	82543139
10059	NC_007613	TGC	2	6	591404	591409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543139
10060	NC_007613	GTG	2	6	591430	591435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543139
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10062	NC_007613	GTT	2	6	591551	591556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543140
10063	NC_007613	CGG	2	6	591572	591577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543140
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10067	NC_007613	CGCTGG	2	12	591722	591733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82543140
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10070	NC_007613	GGT	2	6	591810	591815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543140
10071	NC_007613	GGT	2	6	591820	591825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543140
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10073	NC_007613	GTT	2	6	591883	591888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543140
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10080	NC_007613	CTCA	2	8	592098	592105	25 %	25 %	0 %	50 %	82543140
10081	NC_007613	TTA	2	6	592138	592143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543140
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10092	NC_007613	GCA	2	6	592570	592575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543141
10093	NC_007613	GCT	2	6	592688	592693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543141
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10101	NC_007613	GGC	2	6	593098	593103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543141
10102	NC_007613	TGCG	2	8	593236	593243	0 %	25 %	50 %	25 %	82543142
10103	NC_007613	A	6	6	593253	593258	100 %	0 %	0 %	0 %	82543142
10104	NC_007613	GCC	2	6	593328	593333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543142
10105	NC_007613	GC	3	6	593369	593374	0 %	0 %	50 %	50 %	82543142
10106	NC_007613	GGC	2	6	593398	593403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543142
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10110	NC_007613	GCAA	2	8	593552	593559	50 %	0 %	25 %	25 %	82543142
10111	NC_007613	CG	3	6	593573	593578	0 %	0 %	50 %	50 %	82543142
10112	NC_007613	TTGA	2	8	593647	593654	25 %	50 %	25 %	0 %	82543142
10113	NC_007613	GAA	2	6	593659	593664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543142
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10115	NC_007613	GCAC	2	8	593775	593782	25 %	0 %	25 %	50 %	82543142
10116	NC_007613	CGCC	2	8	593790	593797	0 %	0 %	25 %	75 %	82543142
10117	NC_007613	TTG	2	6	593828	593833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543142
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10120	NC_007613	GGC	2	6	593924	593929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543143
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10122	NC_007613	GTT	2	6	594041	594046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543143
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10232	NC_007613	TGG	2	6	600583	600588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543150
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10239	NC_007613	GGC	2	6	600921	600926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543150
10240	NC_007613	GCT	2	6	600932	600937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543150
10241	NC_007613	TGG	2	6	600943	600948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543150
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10243	NC_007613	AAT	2	6	601065	601070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543150
10244	NC_007613	GCA	2	6	601121	601126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543150
10245	NC_007613	GC	3	6	601333	601338	0 %	0 %	50 %	50 %	82543150
10246	NC_007613	TGA	3	9	601364	601372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543150
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10326	NC_007613	A	6	6	605408	605413	100 %	0 %	0 %	0 %	82543154
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10354	NC_007613	AGA	2	6	607026	607031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543155
10355	NC_007613	AGC	2	6	607125	607130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543155
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10361	NC_007613	GAACT	2	10	607573	607582	40 %	20 %	20 %	20 %	82543155
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10484	NC_007613	TGA	2	6	618081	618086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543161
10485	NC_007613	TAC	2	6	618100	618105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543161
10486	NC_007613	CTT	2	6	618114	618119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543161
10487	NC_007613	CTG	2	6	618142	618147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543161
10488	NC_007613	GTG	2	6	618154	618159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543161
10489	NC_007613	GAT	2	6	618168	618173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543161
10490	NC_007613	CTGG	2	8	618283	618290	0 %	25 %	50 %	25 %	82543161
10491	NC_007613	AAG	2	6	618371	618376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543161
10492	NC_007613	CAA	2	6	618411	618416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543161
10493	NC_007613	CTG	4	12	618457	618468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543161
10494	NC_007613	TCC	2	6	618517	618522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543161
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10496	NC_007613	ATG	2	6	618592	618597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543161
10497	NC_007613	CCAG	2	8	618629	618636	25 %	0 %	25 %	50 %	82543161
10498	NC_007613	GGT	2	6	618666	618671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543161
10499	NC_007613	AGA	2	6	618738	618743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543161
10500	NC_007613	CT	3	6	618762	618767	0 %	50 %	0 %	50 %	82543161

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