MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007613	CGG	2	6	30219	30224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542648
502	NC_007613	A	6	6	30238	30243	100 %	0 %	0 %	0 %	82542648
503	NC_007613	CGT	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542648
504	NC_007613	TGG	2	6	30311	30316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542648
505	NC_007613	TCA	2	6	30498	30503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542648
506	NC_007613	GCT	2	6	30504	30509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542648
507	NC_007613	CAC	2	6	30553	30558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542648
508	NC_007613	GGC	2	6	30559	30564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542648
509	NC_007613	GTG	2	6	30595	30600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542648
510	NC_007613	AGCC	2	8	30750	30757	25 %	0 %	25 %	50 %	82542648
511	NC_007613	ACG	2	6	30767	30772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542648
512	NC_007613	GTT	2	6	30780	30785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542648
513	NC_007613	ACT	2	6	30931	30936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
514	NC_007613	GC	3	6	30940	30945	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
515	NC_007613	CAT	2	6	31010	31015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
516	NC_007613	GACC	2	8	31016	31023	25 %	0 %	25 %	50 %	82542649
517	NC_007613	AGT	2	6	31067	31072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542649
518	NC_007613	ATT	2	6	31080	31085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542649
519	NC_007613	TGC	2	6	31108	31113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542649
520	NC_007613	CTGGAG	2	12	31149	31160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82542649
521	NC_007613	CCG	2	6	31207	31212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542649
522	NC_007613	AGA	2	6	31229	31234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
523	NC_007613	CCG	2	6	31235	31240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542649
524	NC_007613	GAA	2	6	31259	31264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
525	NC_007613	CG	3	6	31280	31285	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
526	NC_007613	CA	3	6	31297	31302	50 %	0 %	0 %	50 %	82542649
527	NC_007613	GAA	2	6	31308	31313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
528	NC_007613	ATT	2	6	31350	31355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542649
529	NC_007613	GCG	3	9	31381	31389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
530	NC_007613	GAA	2	6	31416	31421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
531	NC_007613	TC	3	6	31442	31447	0 %	50 %	0 %	50 %	82542649
532	NC_007613	GCT	2	6	31460	31465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542649
533	NC_007613	TGA	2	6	31469	31474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542649
534	NC_007613	GTG	2	6	31509	31514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542649
535	NC_007613	CAT	2	6	31535	31540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
536	NC_007613	TGC	2	6	31663	31668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542649
537	NC_007613	GGT	2	6	31689	31694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542649
538	NC_007613	TTC	2	6	31769	31774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542649
539	NC_007613	GGC	2	6	31817	31822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
540	NC_007613	CGA	2	6	31847	31852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542649
541	NC_007613	TGA	2	6	31855	31860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542649
542	NC_007613	CCT	2	6	31888	31893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542649
543	NC_007613	CGCA	2	8	32016	32023	25 %	0 %	25 %	50 %	82542649
544	NC_007613	CTGT	2	8	32190	32197	0 %	50 %	25 %	25 %	82542649
545	NC_007613	GAA	2	6	32250	32255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
546	NC_007613	GGCG	2	8	32366	32373	0 %	0 %	75 %	25 %	82542649
547	NC_007613	GAA	2	6	32493	32498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
548	NC_007613	GCGAA	2	10	32503	32512	40 %	0 %	40 %	20 %	82542649
549	NC_007613	ACCG	2	8	32520	32527	25 %	0 %	25 %	50 %	82542649
550	NC_007613	A	6	6	32530	32535	100 %	0 %	0 %	0 %	82542649
551	NC_007613	CGG	3	9	32546	32554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
552	NC_007613	ACT	2	6	32587	32592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
553	NC_007613	CGG	2	6	32777	32782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
554	NC_007613	GC	5	10	32802	32811	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
555	NC_007613	GCT	2	6	32817	32822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542649
556	NC_007613	AGA	2	6	32867	32872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
557	NC_007613	CTGAAA	2	12	32904	32915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82542649
558	NC_007613	TGG	2	6	32986	32991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542649
559	NC_007613	CGTC	2	8	32994	33001	0 %	25 %	25 %	50 %	82542649
560	NC_007613	CGG	2	6	33011	33016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
561	NC_007613	CGG	2	6	33070	33075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
562	NC_007613	TGA	2	6	33119	33124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542649
563	NC_007613	GGC	2	6	33177	33182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
564	NC_007613	GGCG	2	8	33203	33210	0 %	0 %	75 %	25 %	82542649
565	NC_007613	CAG	2	6	33282	33287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542649
566	NC_007613	TGA	2	6	33325	33330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542649
567	NC_007613	AAC	2	6	33351	33356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542649
568	NC_007613	GCG	2	6	33387	33392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
569	NC_007613	CCGTT	2	10	33397	33406	0 %	40 %	20 %	40 %	82542649
570	NC_007613	GGC	2	6	33443	33448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
571	NC_007613	TGGC	2	8	33457	33464	0 %	25 %	50 %	25 %	82542649
572	NC_007613	GCTG	2	8	33470	33477	0 %	25 %	50 %	25 %	82542649
573	NC_007613	AAG	2	6	33493	33498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
574	NC_007613	TAC	2	6	33510	33515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
575	NC_007613	GTG	2	6	33528	33533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542649
576	NC_007613	GCA	2	6	33652	33657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542649
577	NC_007613	CCA	2	6	33661	33666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542649
578	NC_007613	GAA	2	6	33668	33673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
579	NC_007613	GTG	2	6	33720	33725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542649
580	NC_007613	GGC	2	6	33731	33736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542649
581	NC_007613	CTG	2	6	33741	33746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542649
582	NC_007613	CACGG	2	10	33774	33783	20 %	0 %	40 %	40 %	82542649
583	NC_007613	CAT	2	6	33887	33892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
584	NC_007613	CG	3	6	33912	33917	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
585	NC_007613	ACC	2	6	33975	33980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542649
586	NC_007613	GGT	2	6	33987	33992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542649
587	NC_007613	ATA	2	6	34070	34075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542649
588	NC_007613	TGT	2	6	34294	34299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542650
589	NC_007613	TCAGAT	2	12	34301	34312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82542650
590	NC_007613	GCCA	2	8	34388	34395	25 %	0 %	25 %	50 %	82542650
591	NC_007613	CAG	2	6	34428	34433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542650
592	NC_007613	AGA	2	6	34438	34443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542650
593	NC_007613	TCC	2	6	34493	34498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542650
594	NC_007613	CAGC	2	8	34521	34528	25 %	0 %	25 %	50 %	82542650
595	NC_007613	ATCAC	2	10	34585	34594	40 %	20 %	0 %	40 %	82542650
596	NC_007613	T	6	6	34635	34640	0 %	100 %	0 %	0 %	82542650
597	NC_007613	CAC	2	6	34838	34843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161984994
598	NC_007613	AGGA	2	8	34861	34868	50 %	0 %	50 %	0 %	161984994
599	NC_007613	ATGGAA	2	12	34875	34886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161984994
600	NC_007613	CAT	2	6	34911	34916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984994
601	NC_007613	GCA	2	6	34936	34941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984994
602	NC_007613	TGGCG	2	10	34978	34987	0 %	20 %	60 %	20 %	161984994
603	NC_007613	TTG	2	6	35036	35041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984994
604	NC_007613	ATC	2	6	35135	35140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984994
605	NC_007613	CGA	2	6	35163	35168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984994
606	NC_007613	TGTT	2	8	35169	35176	0 %	75 %	25 %	0 %	161984994
607	NC_007613	CGC	2	6	35308	35313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984994
608	NC_007613	ATG	2	6	35364	35369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984994
609	NC_007613	GGC	2	6	35375	35380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984994
610	NC_007613	GCG	2	6	35402	35407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984994
611	NC_007613	TGTT	2	8	35414	35421	0 %	75 %	25 %	0 %	161984994
612	NC_007613	TTA	2	6	35465	35470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161984994
613	NC_007613	GAT	3	9	35500	35508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984994
614	NC_007613	AGC	2	6	35544	35549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984994
615	NC_007613	GCA	2	6	35551	35556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984994
616	NC_007613	CGC	2	6	35582	35587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984994
617	NC_007613	TGTT	2	8	35604	35611	0 %	75 %	25 %	0 %	161984994
618	NC_007613	GCC	2	6	35612	35617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984994
619	NC_007613	TTG	2	6	35681	35686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984994
620	NC_007613	GTG	2	6	35723	35728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984994
621	NC_007613	CCG	2	6	35759	35764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984994
622	NC_007613	TTG	2	6	35798	35803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984994
623	NC_007613	ATG	2	6	35819	35824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984994
624	NC_007613	CGCTGG	2	12	35826	35837	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161984994
625	NC_007613	CTGG	2	8	35869	35876	0 %	25 %	50 %	25 %	161984994
626	NC_007613	AAT	2	6	36050	36055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161984994
627	NC_007613	TTG	2	6	36107	36112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984994
628	NC_007613	TC	3	6	36213	36218	0 %	50 %	0 %	50 %	161984994
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