MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007613	AG	3	6	329975	329980	50 %	0 %	50 %	0 %	82542910
5502	NC_007613	CAG	2	6	329998	330003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542910
5503	NC_007613	TTG	2	6	330025	330030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542910
5504	NC_007613	CGC	2	6	330063	330068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542910
5505	NC_007613	GCTC	2	8	330138	330145	0 %	25 %	25 %	50 %	82542910
5506	NC_007613	TTC	2	6	330179	330184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542910
5507	NC_007613	TGCGCT	2	12	330447	330458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542911
5508	NC_007613	ATG	2	6	330504	330509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542911
5509	NC_007613	CGCT	2	8	330513	330520	0 %	25 %	25 %	50 %	82542911
5510	NC_007613	GTC	2	6	330521	330526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542911
5511	NC_007613	CCA	2	6	330613	330618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542911
5512	NC_007613	TCGAAG	2	12	330624	330635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	82542911
5513	NC_007613	CGG	3	9	330778	330786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542911
5514	NC_007613	CG	4	8	330808	330815	0 %	0 %	50 %	50 %	82542911
5515	NC_007613	TGGAAG	2	12	330849	330860	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	82542911
5516	NC_007613	CTG	2	6	330872	330877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542911
5517	NC_007613	GGT	2	6	330950	330955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542911
5518	NC_007613	GGC	2	6	331028	331033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542911
5519	NC_007613	GCG	2	6	331034	331039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542911
5520	NC_007613	GCGT	2	8	331050	331057	0 %	25 %	50 %	25 %	82542911
5521	NC_007613	GTC	2	6	331133	331138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542911
5522	NC_007613	CGA	2	6	331159	331164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542911
5523	NC_007613	ATG	2	6	331193	331198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542911
5524	NC_007613	GTGC	2	8	331199	331206	0 %	25 %	50 %	25 %	82542911
5525	NC_007613	TGAT	2	8	331302	331309	25 %	50 %	25 %	0 %	82542911
5526	NC_007613	CAT	2	6	331363	331368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542911
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5528	NC_007613	GAA	2	6	331523	331528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542911
5529	NC_007613	GTG	2	6	331577	331582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542911
5530	NC_007613	ACG	2	6	331614	331619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542911
5531	NC_007613	CAGAA	2	10	331736	331745	60 %	0 %	20 %	20 %	82542911
5532	NC_007613	TGA	2	6	331773	331778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542911
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5536	NC_007613	CTGG	2	8	332020	332027	0 %	25 %	50 %	25 %	82542912
5537	NC_007613	GAC	2	6	332053	332058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542912
5538	NC_007613	TGGC	2	8	332157	332164	0 %	25 %	50 %	25 %	82542912
5539	NC_007613	GCG	2	6	332165	332170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542912
5540	NC_007613	CGA	2	6	332181	332186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542912
5541	NC_007613	CAG	2	6	332224	332229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542912
5542	NC_007613	CCA	2	6	332264	332269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542912
5543	NC_007613	GCG	2	6	332313	332318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542912
5544	NC_007613	CAG	2	6	332326	332331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542912
5545	NC_007613	CGC	2	6	332337	332342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542912
5546	NC_007613	GTG	2	6	332387	332392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542912
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5549	NC_007613	CTTT	2	8	332498	332505	0 %	75 %	0 %	25 %	82542913
5550	NC_007613	GC	3	6	332551	332556	0 %	0 %	50 %	50 %	82542913
5551	NC_007613	GCG	2	6	332561	332566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542913
5552	NC_007613	GC	3	6	332608	332613	0 %	0 %	50 %	50 %	82542913
5553	NC_007613	CGA	2	6	332630	332635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542913
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5555	NC_007613	ATG	2	6	332699	332704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542913
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5559	NC_007613	AAT	2	6	332972	332977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542913
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5562	NC_007613	GCT	2	6	333028	333033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542913
5563	NC_007613	TGG	2	6	333172	333177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542913
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5576	NC_007613	CTGG	2	8	334472	334479	0 %	25 %	50 %	25 %	82542915
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5590	NC_007613	CGG	2	6	335242	335247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542915
5591	NC_007613	GCCAT	2	10	335391	335400	20 %	20 %	20 %	40 %	82542915
5592	NC_007613	CG	3	6	335474	335479	0 %	0 %	50 %	50 %	82542915
5593	NC_007613	ACC	2	6	335514	335519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542915
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5595	NC_007613	CAGC	2	8	335672	335679	25 %	0 %	25 %	50 %	82542916
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5602	NC_007613	ACC	2	6	335845	335850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542916
5603	NC_007613	AG	4	8	335878	335885	50 %	0 %	50 %	0 %	82542916
5604	NC_007613	GAT	2	6	335910	335915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542916
5605	NC_007613	GTGAT	2	10	335923	335932	20 %	40 %	40 %	0 %	82542916
5606	NC_007613	GCC	2	6	335980	335985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542916
5607	NC_007613	CAG	2	6	336054	336059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542916
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5609	NC_007613	CAAT	2	8	336137	336144	50 %	25 %	0 %	25 %	82542916
5610	NC_007613	CAGC	2	8	336216	336223	25 %	0 %	25 %	50 %	82542916
5611	NC_007613	CAG	2	6	336249	336254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542916
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5617	NC_007613	TGC	2	6	336452	336457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542916
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5972	NC_007613	CAT	2	6	356311	356316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542934
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5987	NC_007613	ACTG	2	8	357038	357045	25 %	25 %	25 %	25 %	82542934
5988	NC_007613	GTG	2	6	357144	357149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542935
5989	NC_007613	A	7	7	357207	357213	100 %	0 %	0 %	0 %	82542935
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5991	NC_007613	GCA	2	6	357269	357274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542935
5992	NC_007613	CT	3	6	357285	357290	0 %	50 %	0 %	50 %	82542935
5993	NC_007613	ACC	2	6	357324	357329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542935
5994	NC_007613	GGA	2	6	357356	357361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542935
5995	NC_007613	CTG	2	6	357390	357395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542935
5996	NC_007613	A	6	6	357403	357408	100 %	0 %	0 %	0 %	82542935
5997	NC_007613	GGT	2	6	357485	357490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542935
5998	NC_007613	ACG	2	6	357580	357585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542935
5999	NC_007613	CTT	2	6	357670	357675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542935
6000	NC_007613	AATA	2	8	357685	357692	75 %	25 %	0 %	0 %	82542935

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