MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007613	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
2	NC_007613	CAGG	2	8	418	425	25 %	0 %	50 %	25 %	82542619
3	NC_007613	CT	3	6	443	448	0 %	50 %	0 %	50 %	82542619
4	NC_007613	ACCA	2	8	464	471	50 %	0 %	0 %	50 %	82542619
5	NC_007613	TGG	2	6	474	479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
6	NC_007613	GAT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
7	NC_007613	A	6	6	489	494	100 %	0 %	0 %	0 %	82542619
8	NC_007613	CGC	3	9	568	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542619
9	NC_007613	TCG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
10	NC_007613	TTG	2	6	662	667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
11	NC_007613	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	82542619
12	NC_007613	CTG	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
13	NC_007613	CCG	2	6	847	852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542619
14	NC_007613	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
15	NC_007613	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
16	NC_007613	CGG	2	6	966	971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
17	NC_007613	GCTG	2	8	973	980	0 %	25 %	50 %	25 %	82542619
18	NC_007613	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
19	NC_007613	GGAC	2	8	1011	1018	25 %	0 %	50 %	25 %	82542619
20	NC_007613	GTT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
21	NC_007613	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
22	NC_007613	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
23	NC_007613	AAT	2	6	1271	1276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542619
24	NC_007613	GGC	2	6	1327	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
25	NC_007613	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	82542619
26	NC_007613	TGC	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
27	NC_007613	GTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
28	NC_007613	ATC	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
29	NC_007613	TG	3	6	1433	1438	0 %	50 %	50 %	0 %	82542619
30	NC_007613	AAG	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542619
31	NC_007613	GGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
32	NC_007613	TCT	2	6	1634	1639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
33	NC_007613	GAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
34	NC_007613	TCA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
35	NC_007613	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
36	NC_007613	GCTG	2	8	1800	1807	0 %	25 %	50 %	25 %	82542619
37	NC_007613	GCG	2	6	1836	1841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
38	NC_007613	GAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542619
39	NC_007613	ATC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
40	NC_007613	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
41	NC_007613	CCAG	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	82542619
42	NC_007613	CTT	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
43	NC_007613	TCG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
44	NC_007613	TAC	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
45	NC_007613	GCG	2	6	2117	2122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
46	NC_007613	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
47	NC_007613	TGA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
48	NC_007613	ACT	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
49	NC_007613	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
50	NC_007613	ATTGAA	2	12	2429	2440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82542619
51	NC_007613	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
52	NC_007613	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542619
53	NC_007613	CG	4	8	2524	2531	0 %	0 %	50 %	50 %	82542619
54	NC_007613	TGA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
55	NC_007613	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
56	NC_007613	TGCC	2	8	2593	2600	0 %	25 %	25 %	50 %	82542619
57	NC_007613	TAT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542619
58	NC_007613	TGC	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
59	NC_007613	GCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
60	NC_007613	GGC	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
61	NC_007613	CAA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542620
62	NC_007613	GCAA	2	8	3028	3035	50 %	0 %	25 %	25 %	82542620
63	NC_007613	GGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542620
64	NC_007613	ATGA	2	8	3126	3133	50 %	25 %	25 %	0 %	82542620
65	NC_007613	GCA	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542620
66	NC_007613	TGG	2	6	3242	3247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542620
67	NC_007613	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
68	NC_007613	GAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542620
69	NC_007613	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542620
70	NC_007613	CAGC	2	8	3281	3288	25 %	0 %	25 %	50 %	82542620
71	NC_007613	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
72	NC_007613	CGC	2	6	3384	3389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542620
73	NC_007613	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	82542620
74	NC_007613	CTGG	2	8	3417	3424	0 %	25 %	50 %	25 %	82542620
75	NC_007613	TTCA	2	8	3426	3433	25 %	50 %	0 %	25 %	82542620
76	NC_007613	TGA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
77	NC_007613	AGCG	2	8	3563	3570	25 %	0 %	50 %	25 %	82542620
78	NC_007613	TCCGGC	2	12	3576	3587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	82542620
79	NC_007613	TG	3	6	3604	3609	0 %	50 %	50 %	0 %	82542620
80	NC_007613	CGG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
81	NC_007613	T	6	6	3819	3824	0 %	100 %	0 %	0 %	82542621
82	NC_007613	CTGA	2	8	3849	3856	25 %	25 %	25 %	25 %	82542621
83	NC_007613	TGA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
84	NC_007613	TGA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
85	NC_007613	GC	3	6	3959	3964	0 %	0 %	50 %	50 %	82542621
86	NC_007613	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
87	NC_007613	GGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
88	NC_007613	TGA	3	9	4322	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
89	NC_007613	CTA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542621
90	NC_007613	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	82542621
91	NC_007613	CGG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
92	NC_007613	CTG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
93	NC_007613	TGC	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
94	NC_007613	ACG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542621
95	NC_007613	AAC	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542621
96	NC_007613	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542621
97	NC_007613	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542621
98	NC_007613	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
99	NC_007613	AG	3	6	4880	4885	50 %	0 %	50 %	0 %	82542621
100	NC_007613	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542621
101	NC_007613	TGC	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
102	NC_007613	TGA	3	9	4999	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
103	NC_007613	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542621
104	NC_007613	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542622
105	NC_007613	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542622
106	NC_007613	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542622
107	NC_007613	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542622
108	NC_007613	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542622
109	NC_007613	CCA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542622
110	NC_007613	CTC	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542622
111	NC_007613	ATC	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542622
112	NC_007613	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542622
113	NC_007613	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
114	NC_007613	GGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542623
115	NC_007613	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542623
116	NC_007613	AAG	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542623
117	NC_007613	CAGT	2	8	5764	5771	25 %	25 %	25 %	25 %	82542623
118	NC_007613	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542623
119	NC_007613	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542623
120	NC_007613	TGA	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542623
121	NC_007613	TTC	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542623
122	NC_007613	TTC	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542623
123	NC_007613	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542623
124	NC_007613	TGC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
125	NC_007613	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542623
126	NC_007613	TGA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542623
127	NC_007613	AAATCG	2	12	6150	6161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82542623
128	NC_007613	AGCG	2	8	6268	6275	25 %	0 %	50 %	25 %	82542623
129	NC_007613	CTG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
130	NC_007613	GTG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542623
131	NC_007613	TGC	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542624
132	NC_007613	ATG	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542624
133	NC_007613	TTCCAT	2	12	6773	6784	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82542624
134	NC_007613	TCCT	2	8	6791	6798	0 %	50 %	0 %	50 %	82542624
135	NC_007613	GTG	2	6	6816	6821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542624
136	NC_007613	A	6	6	7019	7024	100 %	0 %	0 %	0 %	82542625
137	NC_007613	GTGAT	2	10	7065	7074	20 %	40 %	40 %	0 %	82542625
138	NC_007613	GCTG	2	8	7131	7138	0 %	25 %	50 %	25 %	82542625
139	NC_007613	GGA	2	6	7161	7166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542625
140	NC_007613	TCT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542625
141	NC_007613	CTG	2	6	7226	7231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542625
142	NC_007613	TGGC	2	8	7264	7271	0 %	25 %	50 %	25 %	82542625
143	NC_007613	AATCTG	2	12	7346	7357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82542625
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145	NC_007613	ACC	2	6	9046	9051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542626
146	NC_007613	CAAC	2	8	9110	9117	50 %	0 %	0 %	50 %	82542626
147	NC_007613	TC	3	6	9121	9126	0 %	50 %	0 %	50 %	82542626
148	NC_007613	CGCAG	2	10	9135	9144	20 %	0 %	40 %	40 %	82542626
149	NC_007613	TTGA	2	8	9163	9170	25 %	50 %	25 %	0 %	82542626
150	NC_007613	CAG	2	6	9193	9198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542626
151	NC_007613	CG	3	6	9208	9213	0 %	0 %	50 %	50 %	82542626
152	NC_007613	CAG	2	6	9214	9219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542626
153	NC_007613	CGAC	2	8	9230	9237	25 %	0 %	25 %	50 %	82542626
154	NC_007613	TGC	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542626
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157	NC_007613	TTG	2	6	9545	9550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542626
158	NC_007613	AAGA	2	8	9586	9593	75 %	0 %	25 %	0 %	82542626
159	NC_007613	AGA	2	6	9606	9611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542626
160	NC_007613	TAC	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542626
161	NC_007613	CTG	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542626
162	NC_007613	GCTG	2	8	9765	9772	0 %	25 %	50 %	25 %	82542626
163	NC_007613	GCA	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542626
164	NC_007613	A	6	6	9941	9946	100 %	0 %	0 %	0 %	82542626
165	NC_007613	CTG	2	6	9958	9963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542626
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168	NC_007613	GAA	2	6	10165	10170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542627
169	NC_007613	ATC	2	6	10237	10242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542627
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223	NC_007613	TAT	2	6	13414	13419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542632
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237	NC_007613	TAT	2	6	13909	13914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542632
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242	NC_007613	AAGA	2	8	14033	14040	75 %	0 %	25 %	0 %	82542632
243	NC_007613	AAG	2	6	14088	14093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542632
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249	NC_007613	GTG	2	6	14436	14441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542632
250	NC_007613	CTG	3	9	14468	14476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542632
251	NC_007613	TGA	2	6	14520	14525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542632
252	NC_007613	CCAT	2	8	14610	14617	25 %	25 %	0 %	50 %	82542632
253	NC_007613	TGC	2	6	14619	14624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542632
254	NC_007613	CG	3	6	14697	14702	0 %	0 %	50 %	50 %	82542632
255	NC_007613	AGA	2	6	14790	14795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542632
256	NC_007613	CTT	2	6	14808	14813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542632
257	NC_007613	CTG	2	6	14924	14929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542632
258	NC_007613	GAA	2	6	14951	14956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542632
259	NC_007613	GAC	2	6	14978	14983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542632
260	NC_007613	ACTG	2	8	15004	15011	25 %	25 %	25 %	25 %	82542632
261	NC_007613	CAG	2	6	15107	15112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542632
262	NC_007613	CAG	3	9	15122	15130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542632
263	NC_007613	AAC	2	6	15155	15160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542632
264	NC_007613	TGT	2	6	15175	15180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542632
265	NC_007613	GAA	2	6	15194	15199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542632
266	NC_007613	A	6	6	15209	15214	100 %	0 %	0 %	0 %	82542632
267	NC_007613	ATT	2	6	15319	15324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542633
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269	NC_007613	TGC	2	6	15518	15523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542633
270	NC_007613	GGC	2	6	15534	15539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542633
271	NC_007613	GCG	3	9	15544	15552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542633
272	NC_007613	GGC	3	9	15558	15566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542633
273	NC_007613	GGC	2	6	15612	15617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542633
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277	NC_007613	GAA	2	6	15681	15686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542633
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393	NC_007613	ATC	2	6	22996	23001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542642
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