MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	82524666
2	NC_007608	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524666
3	NC_007608	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524666
4	NC_007608	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524666
5	NC_007608	CAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524666
6	NC_007608	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	82524665
7	NC_007608	AAT	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524665
8	NC_007608	GCGA	2	8	869	876	25 %	0 %	50 %	25 %	161984778
9	NC_007608	TGC	2	6	939	944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984778
10	NC_007608	CT	3	6	1006	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
11	NC_007608	CCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
12	NC_007608	TTC	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984778
13	NC_007608	CCACT	2	10	1125	1134	20 %	20 %	0 %	60 %	161984778
14	NC_007608	GAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
15	NC_007608	GCG	2	6	1161	1166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
16	NC_007608	GCC	2	6	1212	1217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
17	NC_007608	CAGTG	2	10	1231	1240	20 %	20 %	40 %	20 %	161984778
18	NC_007608	CAG	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
19	NC_007608	TC	4	8	1281	1288	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
20	NC_007608	CAG	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
21	NC_007608	CTTT	2	8	1336	1343	0 %	75 %	0 %	25 %	161984778
22	NC_007608	ACA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984778
23	NC_007608	AGC	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
24	NC_007608	CGA	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
25	NC_007608	ATC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984778
26	NC_007608	GAC	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
27	NC_007608	GCG	2	6	1581	1586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
28	NC_007608	CCAT	2	8	1588	1595	25 %	25 %	0 %	50 %	161984778
29	NC_007608	T	6	6	1710	1715	0 %	100 %	0 %	0 %	82524668
30	NC_007608	CTT	2	6	1735	1740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524668
31	NC_007608	GAG	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524668
32	NC_007608	GGC	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
33	NC_007608	AAC	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524668
34	NC_007608	CGG	2	6	1843	1848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
35	NC_007608	CAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524668
36	NC_007608	CTTC	2	8	1863	1870	0 %	50 %	0 %	50 %	82524668
37	NC_007608	CTGG	2	8	1898	1905	0 %	25 %	50 %	25 %	82524668
38	NC_007608	CTG	2	6	1961	1966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524668
39	NC_007608	TG	3	6	1986	1991	0 %	50 %	50 %	0 %	82524668
40	NC_007608	ATCA	2	8	2024	2031	50 %	25 %	0 %	25 %	82524668
41	NC_007608	ATA	2	6	2592	2597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
42	NC_007608	A	6	6	2606	2611	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
43	NC_007608	TCA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
44	NC_007608	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524669
45	NC_007608	T	7	7	2644	2650	0 %	100 %	0 %	0 %	82524669
46	NC_007608	GA	3	6	2653	2658	50 %	0 %	50 %	0 %	82524669
47	NC_007608	ATG	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
48	NC_007608	TCTA	2	8	2684	2691	25 %	50 %	0 %	25 %	82524669
49	NC_007608	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524669
50	NC_007608	A	6	6	2758	2763	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
51	NC_007608	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
52	NC_007608	ATG	3	9	2830	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
53	NC_007608	TGC	3	9	2849	2857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
54	NC_007608	A	7	7	2870	2876	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
55	NC_007608	TAA	2	6	2918	2923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
56	NC_007608	TCA	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
57	NC_007608	ACAA	2	8	2993	3000	75 %	0 %	0 %	25 %	82524669
58	NC_007608	CTG	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
59	NC_007608	TCTT	2	8	3116	3123	0 %	75 %	0 %	25 %	82524669
60	NC_007608	CT	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	82524669
61	NC_007608	T	7	7	3143	3149	0 %	100 %	0 %	0 %	82524669
62	NC_007608	A	7	7	3179	3185	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
63	NC_007608	CTG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
64	NC_007608	AAG	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524669
65	NC_007608	TAT	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524669
66	NC_007608	TAA	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
67	NC_007608	TCT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524670
68	NC_007608	T	6	6	3729	3734	0 %	100 %	0 %	0 %	82524670
69	NC_007608	CAA	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524670
70	NC_007608	CCG	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524670
71	NC_007608	AGT	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524670
72	NC_007608	CGCT	2	8	3896	3903	0 %	25 %	25 %	50 %	82524670
73	NC_007608	TAC	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
74	NC_007608	GTT	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
75	NC_007608	TAC	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
76	NC_007608	TTAT	2	8	4107	4114	25 %	75 %	0 %	0 %	82524670
77	NC_007608	TTGG	2	8	4191	4198	0 %	50 %	50 %	0 %	82524670
78	NC_007608	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
79	NC_007608	ATA	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524670
80	NC_007608	A	6	6	4397	4402	100 %	0 %	0 %	0 %	82524670
81	NC_007608	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524670
82	NC_007608	AT	3	6	4788	4793	50 %	50 %	0 %	0 %	82524671
83	NC_007608	T	6	6	4834	4839	0 %	100 %	0 %	0 %	82524671
84	NC_007608	A	7	7	4843	4849	100 %	0 %	0 %	0 %	82524671
85	NC_007608	TGT	2	6	5086	5091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524672
86	NC_007608	TCAGAT	2	12	5093	5104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524672
87	NC_007608	GCCA	2	8	5180	5187	25 %	0 %	25 %	50 %	82524672
88	NC_007608	CAG	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524672
89	NC_007608	AGA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524672
90	NC_007608	TCC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524672
91	NC_007608	CAGC	2	8	5313	5320	25 %	0 %	25 %	50 %	82524672
92	NC_007608	ATCAC	2	10	5377	5386	40 %	20 %	0 %	40 %	82524672
93	NC_007608	T	6	6	5427	5432	0 %	100 %	0 %	0 %	82524672
94	NC_007608	GCGA	2	8	6199	6206	25 %	0 %	50 %	25 %	161984779
95	NC_007608	TGC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984779
96	NC_007608	CT	3	6	6336	6341	0 %	50 %	0 %	50 %	161984779
97	NC_007608	CCG	2	6	6370	6375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984779
98	NC_007608	TTC	2	6	6378	6383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984779
99	NC_007608	CCACT	2	10	6455	6464	20 %	20 %	0 %	60 %	161984779
100	NC_007608	GAC	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
101	NC_007608	GCG	2	6	6491	6496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984779
102	NC_007608	GCC	2	6	6542	6547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984779
103	NC_007608	CAGTG	2	10	6561	6570	20 %	20 %	40 %	20 %	161984779
104	NC_007608	CAG	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
105	NC_007608	TC	4	8	6611	6618	0 %	50 %	0 %	50 %	161984779
106	NC_007608	CAG	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
107	NC_007608	CTTT	2	8	6666	6673	0 %	75 %	0 %	25 %	161984779
108	NC_007608	CAG	2	6	6715	6720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
109	NC_007608	AGC	2	6	6816	6821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
110	NC_007608	CGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
111	NC_007608	ATC	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984779
112	NC_007608	GAC	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
113	NC_007608	GCG	2	6	6911	6916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984779
114	NC_007608	CCAT	2	8	6918	6925	25 %	25 %	0 %	50 %	161984779
115	NC_007608	T	6	6	7040	7045	0 %	100 %	0 %	0 %	82524674
116	NC_007608	CTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524674
117	NC_007608	GAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524674
118	NC_007608	GGC	2	6	7135	7140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524674
119	NC_007608	AAC	2	6	7159	7164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524674
120	NC_007608	CGG	2	6	7173	7178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524674
121	NC_007608	CAG	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524674
122	NC_007608	CTTC	2	8	7193	7200	0 %	50 %	0 %	50 %	82524674
123	NC_007608	CTGG	2	8	7228	7235	0 %	25 %	50 %	25 %	82524674
124	NC_007608	CTG	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524674
125	NC_007608	TG	3	6	7316	7321	0 %	50 %	50 %	0 %	82524674
126	NC_007608	ATCA	2	8	7354	7361	50 %	25 %	0 %	25 %	82524674
127	NC_007608	TG	3	6	7864	7869	0 %	50 %	50 %	0 %	82524675
128	NC_007608	TAG	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524675
129	NC_007608	AAC	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524675
130	NC_007608	GTT	2	6	8031	8036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524675
131	NC_007608	GCT	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524675
132	NC_007608	GCT	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524675
133	NC_007608	ACATC	2	10	8084	8093	40 %	20 %	0 %	40 %	82524675
134	NC_007608	CAC	3	9	8109	8117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524675
135	NC_007608	CCGG	2	8	8139	8146	0 %	0 %	50 %	50 %	82524675
136	NC_007608	G	6	6	8154	8159	0 %	0 %	100 %	0 %	82524675
137	NC_007608	CAG	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524676
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