MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007608	GAT	2	6	102200	102205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524785
1502	NC_007608	TGA	2	6	102209	102214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524785
1503	NC_007608	GCC	2	6	102244	102249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524786
1504	NC_007608	TTA	2	6	102272	102277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524786
1505	NC_007608	AAT	2	6	102283	102288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524786
1506	NC_007608	GT	4	8	102380	102387	0 %	50 %	50 %	0 %	82524786
1507	NC_007608	GCA	2	6	102392	102397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524786
1508	NC_007608	CGT	2	6	102399	102404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524786
1509	NC_007608	T	6	6	102471	102476	0 %	100 %	0 %	0 %	82524786
1510	NC_007608	AT	3	6	102484	102489	50 %	50 %	0 %	0 %	82524786
1511	NC_007608	TC	3	6	102710	102715	0 %	50 %	0 %	50 %	82524786
1512	NC_007608	GGT	2	6	102834	102839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524786
1513	NC_007608	ATT	2	6	102844	102849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524786
1514	NC_007608	CCT	2	6	102852	102857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524786
1515	NC_007608	ATG	2	6	102927	102932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524786
1516	NC_007608	ATT	2	6	102970	102975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524788
1517	NC_007608	CAA	2	6	102980	102985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524788
1518	NC_007608	GCA	2	6	103006	103011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524788
1519	NC_007608	GGCC	2	8	103025	103032	0 %	0 %	50 %	50 %	82524788
1520	NC_007608	AAC	2	6	103042	103047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524788
1521	NC_007608	GACCT	2	10	103167	103176	20 %	20 %	20 %	40 %	82524788
1522	NC_007608	ATG	2	6	103200	103205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524788
1523	NC_007608	G	7	7	103215	103221	0 %	0 %	100 %	0 %	82524788
1524	NC_007608	TCA	2	6	103271	103276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524788
1525	NC_007608	GAT	2	6	103305	103310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524788
1526	NC_007608	GACG	2	8	103311	103318	25 %	0 %	50 %	25 %	82524788
1527	NC_007608	AC	3	6	103401	103406	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
1528	NC_007608	GGT	2	6	103413	103418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1529	NC_007608	GCA	2	6	103431	103436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1530	NC_007608	GGC	2	6	103701	103706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524789
1531	NC_007608	AAC	2	6	103820	103825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524789
1532	NC_007608	CGCA	2	8	103837	103844	25 %	0 %	25 %	50 %	82524789
1533	NC_007608	GCA	2	6	103881	103886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1534	NC_007608	CTG	2	6	103948	103953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1535	NC_007608	GCC	2	6	103974	103979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524789
1536	NC_007608	AGC	2	6	104036	104041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1537	NC_007608	CAT	2	6	104127	104132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524789
1538	NC_007608	CCGT	2	8	104220	104227	0 %	25 %	25 %	50 %	82524789
1539	NC_007608	ATG	2	6	104293	104298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524789
1540	NC_007608	GCT	2	6	104332	104337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1541	NC_007608	TCGC	2	8	104343	104350	0 %	25 %	25 %	50 %	82524789
1542	NC_007608	CGT	2	6	104401	104406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1543	NC_007608	TCG	2	6	104450	104455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1544	NC_007608	CTG	2	6	104494	104499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1545	NC_007608	G	6	6	104616	104621	0 %	0 %	100 %	0 %	82524789
1546	NC_007608	CCA	2	6	104636	104641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524789
1547	NC_007608	TCA	2	6	104642	104647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524789
1548	NC_007608	AG	3	6	104718	104723	50 %	0 %	50 %	0 %	82524789
1549	NC_007608	CTGG	2	8	104844	104851	0 %	25 %	50 %	25 %	82524789
1550	NC_007608	GGT	2	6	105006	105011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1551	NC_007608	TTC	2	6	105018	105023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524789
1552	NC_007608	CAG	2	6	105030	105035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1553	NC_007608	CCGG	2	8	105048	105055	0 %	0 %	50 %	50 %	82524789
1554	NC_007608	A	6	6	105056	105061	100 %	0 %	0 %	0 %	82524789
1555	NC_007608	CGG	2	6	105123	105128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524789
1556	NC_007608	GTT	2	6	105172	105177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524789
1557	NC_007608	CCTG	2	8	105204	105211	0 %	25 %	25 %	50 %	82524789
1558	NC_007608	CA	3	6	105309	105314	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
1559	NC_007608	TCCT	2	8	105423	105430	0 %	50 %	0 %	50 %	82524789
1560	NC_007608	GGT	2	6	105435	105440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1561	NC_007608	CAG	2	6	105526	105531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1562	NC_007608	TGG	2	6	105584	105589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1563	NC_007608	CTG	2	6	105592	105597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1564	NC_007608	TGC	2	6	105615	105620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1565	NC_007608	ATGTGG	2	12	105689	105700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	82524789
1566	NC_007608	CTG	2	6	105721	105726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1567	NC_007608	CGT	2	6	105737	105742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1568	NC_007608	TTC	2	6	105761	105766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524789
1569	NC_007608	AGG	2	6	105785	105790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524789
1570	NC_007608	CGC	2	6	105797	105802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524789
1571	NC_007608	GA	3	6	105808	105813	50 %	0 %	50 %	0 %	82524789
1572	NC_007608	GC	3	6	105852	105857	0 %	0 %	50 %	50 %	82524789
1573	NC_007608	CGC	3	9	105855	105863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524789
1574	NC_007608	GGT	2	6	105897	105902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1575	NC_007608	CA	3	6	105930	105935	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
1576	NC_007608	TGC	2	6	105965	105970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1577	NC_007608	TGGGGC	2	12	105995	106006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82524789
1578	NC_007608	CA	3	6	106008	106013	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
1579	NC_007608	GCA	2	6	106089	106094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1580	NC_007608	TGG	2	6	106154	106159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1581	NC_007608	CAG	2	6	106276	106281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1582	NC_007608	TGC	2	6	106290	106295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1583	NC_007608	TCA	2	6	106304	106309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524789
1584	NC_007608	GCA	2	6	106503	106508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1585	NC_007608	ATG	2	6	106667	106672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524789
1586	NC_007608	GCAGGT	2	12	106698	106709	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82524789
1587	NC_007608	CGT	2	6	106756	106761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1588	NC_007608	TGCCCT	2	12	106788	106799	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	82524789
1589	NC_007608	CAG	2	6	107065	107070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1590	NC_007608	AGC	2	6	107252	107257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1591	NC_007608	CAA	2	6	107304	107309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524789
1592	NC_007608	ACCGG	2	10	107352	107361	20 %	0 %	40 %	40 %	82524789
1593	NC_007608	GGC	2	6	107415	107420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524789
1594	NC_007608	GCCGT	2	10	107423	107432	0 %	20 %	40 %	40 %	82524789
1595	NC_007608	CCG	2	6	107546	107551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524789
1596	NC_007608	CTG	2	6	107680	107685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1597	NC_007608	ATA	2	6	107690	107695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524789
1598	NC_007608	GTG	2	6	107735	107740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1599	NC_007608	TGG	2	6	107741	107746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
1600	NC_007608	CCGT	2	8	107766	107773	0 %	25 %	25 %	50 %	82524789
1601	NC_007608	G	6	6	107807	107812	0 %	0 %	100 %	0 %	82524789
1602	NC_007608	ACA	2	6	107822	107827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524789
1603	NC_007608	CCG	2	6	107904	107909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524789
1604	NC_007608	ACCTG	2	10	107961	107970	20 %	20 %	20 %	40 %	82524789
1605	NC_007608	TGC	2	6	108125	108130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1606	NC_007608	GCA	2	6	108141	108146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
1607	NC_007608	TGA	2	6	108222	108227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524790
1608	NC_007608	AACACG	2	12	108236	108247	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82524790
1609	NC_007608	TCTGG	2	10	108298	108307	0 %	40 %	40 %	20 %	82524790
1610	NC_007608	ATC	2	6	108326	108331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524790
1611	NC_007608	GAG	2	6	108417	108422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524790
1612	NC_007608	TGGGGA	2	12	108503	108514	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	82524790
1613	NC_007608	ATT	2	6	108515	108520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524790
1614	NC_007608	GGC	2	6	108589	108594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524790
1615	NC_007608	GTG	2	6	108607	108612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524790
1616	NC_007608	GTGG	2	8	108624	108631	0 %	25 %	75 %	0 %	82524790
1617	NC_007608	CAG	2	6	108636	108641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524790
1618	NC_007608	GCCT	2	8	108773	108780	0 %	25 %	25 %	50 %	82524790
1619	NC_007608	GCTG	2	8	108781	108788	0 %	25 %	50 %	25 %	82524790
1620	NC_007608	CCA	2	6	108810	108815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524790
1621	NC_007608	GCG	2	6	108824	108829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524790
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1623	NC_007608	TG	3	6	108873	108878	0 %	50 %	50 %	0 %	82524790
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