MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007608	GCT	2	6	33845	33850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524709
502	NC_007608	CTT	2	6	33940	33945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524709
503	NC_007608	GCT	2	6	34050	34055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524709
504	NC_007608	T	6	6	34164	34169	0 %	100 %	0 %	0 %	82524710
505	NC_007608	TCA	2	6	34275	34280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524710
506	NC_007608	GTT	2	6	34285	34290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524710
507	NC_007608	GGC	2	6	34334	34339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524710
508	NC_007608	CAA	2	6	34363	34368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524710
509	NC_007608	T	7	7	34411	34417	0 %	100 %	0 %	0 %	82524710
510	NC_007608	TGC	3	9	35170	35178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524711
511	NC_007608	TTC	2	6	35184	35189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524711
512	NC_007608	GCT	2	6	35231	35236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524711
513	NC_007608	CGG	2	6	35255	35260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524711
514	NC_007608	TTTAAT	2	12	35264	35275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524711
515	NC_007608	GAT	2	6	35324	35329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524711
516	NC_007608	TCA	2	6	35403	35408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524712
517	NC_007608	TGA	2	6	35442	35447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524712
518	NC_007608	A	6	6	35469	35474	100 %	0 %	0 %	0 %	82524712
519	NC_007608	TGT	2	6	35502	35507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524712
520	NC_007608	CAA	2	6	35524	35529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524712
521	NC_007608	ATG	2	6	35690	35695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524712
522	NC_007608	TCG	2	6	35700	35705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524712
523	NC_007608	GTGC	2	8	35734	35741	0 %	25 %	50 %	25 %	82524712
524	NC_007608	TCA	2	6	35787	35792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524712
525	NC_007608	CCA	2	6	36007	36012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524713
526	NC_007608	GAA	2	6	36115	36120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524713
527	NC_007608	GTG	2	6	36354	36359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524713
528	NC_007608	GTT	2	6	36409	36414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524713
529	NC_007608	TGGGC	2	10	36440	36449	0 %	20 %	60 %	20 %	82524713
530	NC_007608	CAG	2	6	36468	36473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524713
531	NC_007608	CGG	2	6	36522	36527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524713
532	NC_007608	GCAG	2	8	36566	36573	25 %	0 %	50 %	25 %	82524713
533	NC_007608	CAGA	2	8	36603	36610	50 %	0 %	25 %	25 %	82524713
534	NC_007608	CTG	2	6	36630	36635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524713
535	NC_007608	CTT	2	6	36657	36662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524713
536	NC_007608	GAA	2	6	36672	36677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524713
537	NC_007608	GGT	2	6	36690	36695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524713
538	NC_007608	TTG	2	6	36849	36854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524713
539	NC_007608	T	6	6	36909	36914	0 %	100 %	0 %	0 %	82524714
540	NC_007608	GTT	2	6	36930	36935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524714
541	NC_007608	GACA	2	8	36940	36947	50 %	0 %	25 %	25 %	82524714
542	NC_007608	GCAACA	2	12	36992	37003	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82524714
543	NC_007608	CGGGG	2	10	37092	37101	0 %	0 %	80 %	20 %	82524714
544	NC_007608	T	6	6	37116	37121	0 %	100 %	0 %	0 %	82524714
545	NC_007608	TGC	2	6	37212	37217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524714
546	NC_007608	TAA	2	6	37338	37343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524714
547	NC_007608	CTA	2	6	37374	37379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524714
548	NC_007608	CCT	2	6	37407	37412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524714
549	NC_007608	TGCC	2	8	37441	37448	0 %	25 %	25 %	50 %	82524714
550	NC_007608	TCT	2	6	37451	37456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524714
551	NC_007608	ACG	2	6	37462	37467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524714
552	NC_007608	AGA	2	6	37580	37585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524714
553	NC_007608	ATC	2	6	37618	37623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524714
554	NC_007608	ATGCCC	2	12	37632	37643	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82524714
555	NC_007608	CAG	2	6	37689	37694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524714
556	NC_007608	T	6	6	37768	37773	0 %	100 %	0 %	0 %	82524714
557	NC_007608	CGA	2	6	37826	37831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524714
558	NC_007608	TTG	2	6	38030	38035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524714
559	NC_007608	ATG	2	6	38539	38544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524715
560	NC_007608	TAT	2	6	38595	38600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524715
561	NC_007608	A	7	7	38712	38718	100 %	0 %	0 %	0 %	82524715
562	NC_007608	TAT	2	6	38765	38770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524715
563	NC_007608	ATT	2	6	38776	38781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524715
564	NC_007608	AAT	2	6	38784	38789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524715
565	NC_007608	GAG	2	6	38824	38829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524715
566	NC_007608	A	7	7	38845	38851	100 %	0 %	0 %	0 %	82524715
567	NC_007608	TCC	2	6	38855	38860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524715
568	NC_007608	GAG	3	9	38866	38874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524715
569	NC_007608	AAAG	2	8	38921	38928	75 %	0 %	25 %	0 %	82524715
570	NC_007608	TGA	2	6	38964	38969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524715
571	NC_007608	TA	3	6	38978	38983	50 %	50 %	0 %	0 %	82524715
572	NC_007608	TCGATA	2	12	38986	38997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524715
573	NC_007608	CTT	2	6	38999	39004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524715
574	NC_007608	TTG	2	6	39035	39040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524715
575	NC_007608	A	7	7	39041	39047	100 %	0 %	0 %	0 %	82524715
576	NC_007608	CAA	2	6	39145	39150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524715
577	NC_007608	CTT	2	6	39154	39159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524715
578	NC_007608	GCAT	2	8	39167	39174	25 %	25 %	25 %	25 %	82524715
579	NC_007608	GCA	2	6	39178	39183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524715
580	NC_007608	ATG	2	6	39215	39220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524715
581	NC_007608	A	6	6	39316	39321	100 %	0 %	0 %	0 %	82524715
582	NC_007608	AGC	2	6	39918	39923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524716
583	NC_007608	GCT	3	9	39941	39949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524716
584	NC_007608	TGCT	2	8	39957	39964	0 %	50 %	25 %	25 %	82524716
585	NC_007608	CG	3	6	40025	40030	0 %	0 %	50 %	50 %	82524716
586	NC_007608	ATC	2	6	40111	40116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524717
587	NC_007608	ATA	2	6	40132	40137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524717
588	NC_007608	TTCTGC	2	12	40144	40155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	82524717
589	NC_007608	TCG	2	6	40186	40191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524717
590	NC_007608	ATT	2	6	40192	40197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524717
591	NC_007608	CCAC	2	8	40206	40213	25 %	0 %	0 %	75 %	82524717
592	NC_007608	TG	3	6	40370	40375	0 %	50 %	50 %	0 %	82524717
593	NC_007608	ATAC	2	8	40386	40393	50 %	25 %	0 %	25 %	82524717
594	NC_007608	AAT	2	6	40531	40536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524717
595	NC_007608	GTAA	2	8	40573	40580	50 %	25 %	25 %	0 %	82524717
596	NC_007608	CCAC	2	8	40587	40594	25 %	0 %	0 %	75 %	82524717
597	NC_007608	AAC	2	6	40763	40768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524717
598	NC_007608	TGA	2	6	40799	40804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524717
599	NC_007608	TCTT	2	8	40829	40836	0 %	75 %	0 %	25 %	82524717
600	NC_007608	GAT	2	6	40878	40883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524717
601	NC_007608	CAG	2	6	40975	40980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524717
602	NC_007608	GCG	2	6	41058	41063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524718
603	NC_007608	GGT	2	6	41112	41117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524718
604	NC_007608	GCC	2	6	41218	41223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524718
605	NC_007608	AAC	2	6	41477	41482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524719
606	NC_007608	A	7	7	41498	41504	100 %	0 %	0 %	0 %	82524719
607	NC_007608	GTT	2	6	41546	41551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524719
608	NC_007608	GCC	2	6	41576	41581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524719
609	NC_007608	AAC	2	6	41625	41630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524719
610	NC_007608	TGA	2	6	41635	41640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524719
611	NC_007608	A	6	6	41746	41751	100 %	0 %	0 %	0 %	82524719
612	NC_007608	GCA	2	6	41858	41863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524720
613	NC_007608	AAG	2	6	41970	41975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524720
614	NC_007608	CAG	2	6	42064	42069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524720
615	NC_007608	GTG	2	6	42089	42094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524720
616	NC_007608	GTG	2	6	42162	42167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524720
617	NC_007608	GTT	2	6	42217	42222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524720
618	NC_007608	TGGGC	2	10	42248	42257	0 %	20 %	60 %	20 %	82524720
619	NC_007608	CAG	2	6	42276	42281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524720
620	NC_007608	CGG	2	6	42330	42335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524720
621	NC_007608	GCAG	2	8	42374	42381	25 %	0 %	50 %	25 %	82524720
622	NC_007608	CAGA	2	8	42411	42418	50 %	0 %	25 %	25 %	82524720
623	NC_007608	CTG	2	6	42438	42443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524720
624	NC_007608	CTT	2	6	42465	42470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524720
625	NC_007608	GAA	2	6	42480	42485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524720
626	NC_007608	GGT	2	6	42498	42503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524720
627	NC_007608	TTG	2	6	42657	42662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524720
628	NC_007608	AAG	2	6	42868	42873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524721
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630	NC_007608	A	6	6	43007	43012	100 %	0 %	0 %	0 %	82524721
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