MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 2885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007607	AAT	2	6	155683	155688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157042764
2502	NC_007607	TTAA	2	8	155693	155700	50 %	50 %	0 %	0 %	157042764
2503	NC_007607	T	8	8	155771	155778	0 %	100 %	0 %	0 %	82524598
2504	NC_007607	ATT	2	6	155790	155795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524598
2505	NC_007607	TTTC	2	8	155796	155803	0 %	75 %	0 %	25 %	82524598
2506	NC_007607	TTG	2	6	155861	155866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524598
2507	NC_007607	ATTA	2	8	155874	155881	50 %	50 %	0 %	0 %	82524598
2508	NC_007607	TTC	2	6	155904	155909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524598
2509	NC_007607	TTG	2	6	155951	155956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524598
2510	NC_007607	CCT	2	6	155958	155963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524598
2511	NC_007607	TC	3	6	155964	155969	0 %	50 %	0 %	50 %	82524598
2512	NC_007607	ATT	2	6	156016	156021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524598
2513	NC_007607	TAG	2	6	156045	156050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524598
2514	NC_007607	T	6	6	156107	156112	0 %	100 %	0 %	0 %	82524598
2515	NC_007607	GTG	2	6	156134	156139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524598
2516	NC_007607	TAT	2	6	156317	156322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524598
2517	NC_007607	TAT	2	6	156390	156395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524598
2518	NC_007607	CTA	2	6	156410	156415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524598
2519	NC_007607	A	6	6	156520	156525	100 %	0 %	0 %	0 %	82524599
2520	NC_007607	A	7	7	156540	156546	100 %	0 %	0 %	0 %	82524599
2521	NC_007607	ATTTAA	2	12	156555	156566	50 %	50 %	0 %	0 %	82524599
2522	NC_007607	ACG	2	6	156574	156579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524599
2523	NC_007607	GTT	2	6	156580	156585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524599
2524	NC_007607	ATT	2	6	156586	156591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524599
2525	NC_007607	TAA	2	6	156659	156664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524599
2526	NC_007607	T	6	6	156697	156702	0 %	100 %	0 %	0 %	82524599
2527	NC_007607	T	6	6	156718	156723	0 %	100 %	0 %	0 %	82524599
2528	NC_007607	T	7	7	156743	156749	0 %	100 %	0 %	0 %	82524599
2529	NC_007607	CAAA	2	8	156784	156791	75 %	0 %	0 %	25 %	82524599
2530	NC_007607	GATT	2	8	156819	156826	25 %	50 %	25 %	0 %	82524599
2531	NC_007607	A	8	8	156855	156862	100 %	0 %	0 %	0 %	82524599
2532	NC_007607	CTT	2	6	156907	156912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524599
2533	NC_007607	AAC	2	6	156927	156932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524599
2534	NC_007607	T	6	6	156965	156970	0 %	100 %	0 %	0 %	82524599
2535	NC_007607	G	8	8	157010	157017	0 %	0 %	100 %	0 %	82524599
2536	NC_007607	ATA	2	6	157030	157035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524599
2537	NC_007607	TTA	2	6	157064	157069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524599
2538	NC_007607	ATG	3	9	157111	157119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524599
2539	NC_007607	AT	3	6	157143	157148	50 %	50 %	0 %	0 %	82524599
2540	NC_007607	TATT	2	8	157281	157288	25 %	75 %	0 %	0 %	82524599
2541	NC_007607	TC	3	6	157321	157326	0 %	50 %	0 %	50 %	82524599
2542	NC_007607	TA	3	6	157418	157423	50 %	50 %	0 %	0 %	82524599
2543	NC_007607	TTG	2	6	157445	157450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524599
2544	NC_007607	TAA	2	6	157516	157521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524599
2545	NC_007607	TAA	2	6	157557	157562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524600
2546	NC_007607	CAT	2	6	157602	157607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524600
2547	NC_007607	CAA	2	6	157653	157658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524600
2548	NC_007607	ATA	2	6	157663	157668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524600
2549	NC_007607	A	6	6	157751	157756	100 %	0 %	0 %	0 %	82524600
2550	NC_007607	TGA	2	6	157761	157766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524600
2551	NC_007607	AGA	2	6	158433	158438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524601
2552	NC_007607	CAGAC	2	10	158491	158500	40 %	0 %	20 %	40 %	82524601
2553	NC_007607	GTG	2	6	158554	158559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524601
2554	NC_007607	GGTG	2	8	158573	158580	0 %	25 %	75 %	0 %	82524601
2555	NC_007607	CAG	2	6	158776	158781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524601
2556	NC_007607	CGAC	2	8	158888	158895	25 %	0 %	25 %	50 %	82524601
2557	NC_007607	GCC	2	6	158928	158933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524601
2558	NC_007607	GCC	2	6	159240	159245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524602
2559	NC_007607	GTG	2	6	159298	159303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524602
2560	NC_007607	GCC	2	6	159333	159338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524602
2561	NC_007607	CTG	2	6	159371	159376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524602
2562	NC_007607	CCG	2	6	159395	159400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524602
2563	NC_007607	GGA	2	6	159537	159542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524602
2564	NC_007607	CTGC	2	8	159555	159562	0 %	25 %	25 %	50 %	82524602
2565	NC_007607	GGC	2	6	159582	159587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524602
2566	NC_007607	TGC	2	6	159634	159639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524603
2567	NC_007607	TGC	2	6	159644	159649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524603
2568	NC_007607	GCA	2	6	159697	159702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524603
2569	NC_007607	T	7	7	159767	159773	0 %	100 %	0 %	0 %	82524603
2570	NC_007607	ATT	2	6	160811	160816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524604
2571	NC_007607	CAT	2	6	160832	160837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524604
2572	NC_007607	TGAA	2	8	160898	160905	50 %	25 %	25 %	0 %	82524604
2573	NC_007607	ATA	2	6	160944	160949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524604
2574	NC_007607	TAT	3	9	160955	160963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524604
2575	NC_007607	T	7	7	160983	160989	0 %	100 %	0 %	0 %	82524604
2576	NC_007607	CAA	2	6	161009	161014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524604
2577	NC_007607	A	6	6	161021	161026	100 %	0 %	0 %	0 %	82524604
2578	NC_007607	A	6	6	161041	161046	100 %	0 %	0 %	0 %	82524604
2579	NC_007607	TCCG	2	8	161117	161124	0 %	25 %	25 %	50 %	82524604
2580	NC_007607	TA	3	6	161125	161130	50 %	50 %	0 %	0 %	82524604
2581	NC_007607	ATT	3	9	161134	161142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524604
2582	NC_007607	TAA	2	6	161159	161164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524604
2583	NC_007607	A	6	6	161250	161255	100 %	0 %	0 %	0 %	82524604
2584	NC_007607	A	7	7	161262	161268	100 %	0 %	0 %	0 %	82524604
2585	NC_007607	CTT	2	6	161287	161292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524604
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2587	NC_007607	A	6	6	161307	161312	100 %	0 %	0 %	0 %	82524604
2588	NC_007607	CAT	2	6	161384	161389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524604
2589	NC_007607	CAA	2	6	161402	161407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524604
2590	NC_007607	CCA	2	6	161409	161414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524604
2591	NC_007607	ACCC	2	8	161464	161471	25 %	0 %	0 %	75 %	82524604
2592	NC_007607	AAT	2	6	161494	161499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524604
2593	NC_007607	GAA	2	6	161500	161505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524604
2594	NC_007607	TCAT	2	8	161524	161531	25 %	50 %	0 %	25 %	82524604
2595	NC_007607	A	6	6	161552	161557	100 %	0 %	0 %	0 %	82524604
2596	NC_007607	ATTC	2	8	162126	162133	25 %	50 %	0 %	25 %	82524605
2597	NC_007607	T	6	6	162143	162148	0 %	100 %	0 %	0 %	82524605
2598	NC_007607	T	6	6	162205	162210	0 %	100 %	0 %	0 %	82524605
2599	NC_007607	GCC	2	6	162281	162286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524605
2600	NC_007607	TTC	2	6	162300	162305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524605
2601	NC_007607	TCG	2	6	162330	162335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524606
2602	NC_007607	GCT	2	6	162408	162413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524606
2603	NC_007607	TGC	2	6	162438	162443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524606
2604	NC_007607	CAG	2	6	162633	162638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524607
2605	NC_007607	TTC	2	6	162739	162744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524607
2606	NC_007607	GCC	2	6	162766	162771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524607
2607	NC_007607	CCTG	2	8	162905	162912	0 %	25 %	25 %	50 %	82524607
2608	NC_007607	CAC	2	6	163254	163259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524608
2609	NC_007607	A	6	6	163378	163383	100 %	0 %	0 %	0 %	82524608
2610	NC_007607	CTG	2	6	163392	163397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524608
2611	NC_007607	TTAC	2	8	163788	163795	25 %	50 %	0 %	25 %	82524609
2612	NC_007607	TCA	2	6	163830	163835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524609
2613	NC_007607	GTAT	2	8	163975	163982	25 %	50 %	25 %	0 %	82524609
2614	NC_007607	AC	3	6	163992	163997	50 %	0 %	0 %	50 %	82524609
2615	NC_007607	GTGG	2	8	164155	164162	0 %	25 %	75 %	0 %	82524609
2616	NC_007607	CGA	2	6	164177	164182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524609
2617	NC_007607	CTC	2	6	164205	164210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524609
2618	NC_007607	GCAGAA	2	12	164213	164224	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82524609
2619	NC_007607	TTA	2	6	164230	164235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524609
2620	NC_007607	GAT	2	6	164252	164257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524609
2621	NC_007607	CTG	2	6	164761	164766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524610
2622	NC_007607	CGC	2	6	164846	164851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524610
2623	NC_007607	TCG	2	6	164928	164933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524610
2624	NC_007607	TCA	2	6	164938	164943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524610
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2626	NC_007607	TGT	2	6	164974	164979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524610
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