MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 45253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007604	GGC	2	6	60286	60291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298868
1002	NC_007604	GA	3	6	60311	60316	50 %	0 %	50 %	0 %	81298869
1003	NC_007604	GCGATC	2	12	60328	60339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81298869
1004	NC_007604	AGT	2	6	60500	60505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298869
1005	NC_007604	AACG	2	8	60609	60616	50 %	0 %	25 %	25 %	81298869
1006	NC_007604	TGC	2	6	60637	60642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298869
1007	NC_007604	GAT	2	6	60774	60779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298869
1008	NC_007604	ATCC	2	8	60980	60987	25 %	25 %	0 %	50 %	81298870
1009	NC_007604	CT	3	6	61048	61053	0 %	50 %	0 %	50 %	81298870
1010	NC_007604	ATCA	2	8	61056	61063	50 %	25 %	0 %	25 %	81298870
1011	NC_007604	TCTGT	2	10	61082	61091	0 %	60 %	20 %	20 %	81298870
1012	NC_007604	ACC	2	6	61115	61120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298871
1013	NC_007604	ACG	2	6	61124	61129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298871
1014	NC_007604	GC	3	6	61140	61145	0 %	0 %	50 %	50 %	81298871
1015	NC_007604	CAC	2	6	61240	61245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298871
1016	NC_007604	CCT	2	6	61415	61420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298872
1017	NC_007604	TCA	2	6	61422	61427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298872
1018	NC_007604	CTG	2	6	61454	61459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298872
1019	NC_007604	GTT	2	6	61463	61468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298872
1020	NC_007604	CTG	2	6	61693	61698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298872
1021	NC_007604	TCC	2	6	61732	61737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298872
1022	NC_007604	TGC	2	6	61754	61759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298872
1023	NC_007604	AGC	2	6	61795	61800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298872
1024	NC_007604	TGCC	2	8	61872	61879	0 %	25 %	25 %	50 %	81298872
1025	NC_007604	TGA	2	6	61910	61915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298872
1026	NC_007604	GCT	2	6	61967	61972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298872
1027	NC_007604	CCT	2	6	61997	62002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298872
1028	NC_007604	TGT	2	6	62059	62064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298872
1029	NC_007604	CACCAT	2	12	62065	62076	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	81298872
1030	NC_007604	TGC	2	6	62087	62092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298872
1031	NC_007604	ACC	2	6	62204	62209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298872
1032	NC_007604	CAT	2	6	62250	62255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298872
1033	NC_007604	TC	3	6	62259	62264	0 %	50 %	0 %	50 %	81298872
1034	NC_007604	ATT	2	6	62496	62501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81298873
1035	NC_007604	CTC	2	6	62511	62516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298873
1036	NC_007604	TC	3	6	62530	62535	0 %	50 %	0 %	50 %	81298873
1037	NC_007604	AG	3	6	62577	62582	50 %	0 %	50 %	0 %	81298873
1038	NC_007604	CAG	3	9	62588	62596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298873
1039	NC_007604	TCCC	2	8	62616	62623	0 %	25 %	0 %	75 %	81298873
1040	NC_007604	GAA	2	6	62673	62678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298873
1041	NC_007604	CCA	2	6	62680	62685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298873
1042	NC_007604	AGG	2	6	62769	62774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298873
1043	NC_007604	CAG	2	6	62780	62785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298873
1044	NC_007604	CCT	2	6	62917	62922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298873
1045	NC_007604	TGA	2	6	62980	62985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298873
1046	NC_007604	A	6	6	63037	63042	100 %	0 %	0 %	0 %	81298873
1047	NC_007604	AAT	2	6	63053	63058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81298873
1048	NC_007604	TTAA	2	8	63061	63068	50 %	50 %	0 %	0 %	81298873
1049	NC_007604	ATA	2	6	63091	63096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81298873
1050	NC_007604	CCA	2	6	63154	63159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298873
1051	NC_007604	ACC	2	6	63216	63221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298873
1052	NC_007604	GATCC	2	10	64274	64283	20 %	20 %	20 %	40 %	81298874
1053	NC_007604	CTG	2	6	64296	64301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298874
1054	NC_007604	GCT	2	6	64487	64492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298874
1055	NC_007604	AGT	2	6	64500	64505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298874
1056	NC_007604	TTG	2	6	64528	64533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298874
1057	NC_007604	CTT	2	6	64598	64603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298874
1058	NC_007604	GCT	3	9	64658	64666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298874
1059	NC_007604	GTC	2	6	64691	64696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298874
1060	NC_007604	GAG	2	6	64729	64734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298875
1061	NC_007604	CGA	2	6	64747	64752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298875
1062	NC_007604	AGCGA	2	10	64769	64778	40 %	0 %	40 %	20 %	81298875
1063	NC_007604	TTC	2	6	65000	65005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298876
1064	NC_007604	CAT	4	12	65014	65025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298876
1065	NC_007604	CTT	2	6	65034	65039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298876
1066	NC_007604	TGCT	2	8	65047	65054	0 %	50 %	25 %	25 %	81298876
1067	NC_007604	CAA	2	6	65095	65100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298876
1068	NC_007604	CTG	2	6	65101	65106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298876
1069	NC_007604	TCG	2	6	65219	65224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298876
1070	NC_007604	CTT	2	6	65244	65249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298876
1071	NC_007604	TGC	2	6	65264	65269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298876
1072	NC_007604	GC	3	6	65275	65280	0 %	0 %	50 %	50 %	81298876
1073	NC_007604	TTCT	2	8	65380	65387	0 %	75 %	0 %	25 %	81298876
1074	NC_007604	CGA	2	6	65448	65453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298876
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1083	NC_007604	CAG	2	6	66057	66062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298877
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1091	NC_007604	GCA	2	6	66496	66501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298877
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1093	NC_007604	GAA	2	6	66804	66809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298877
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1107	NC_007604	TGC	2	6	67301	67306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298878
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1109	NC_007604	GCC	2	6	67354	67359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298878
1110	NC_007604	CCAGCA	2	12	67383	67394	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	81298878
1111	NC_007604	GCC	2	6	67466	67471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298878
1112	NC_007604	GAG	2	6	67474	67479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298878
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