MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 plasmid 1

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007595	TGC	2	6	68	73	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230334
2	NC_007595	CCG	2	6	100	105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230334
3	NC_007595	GA	3	6	108	113	50 %	0 %	50 %	0 %	81230334
4	NC_007595	CTC	2	6	143	148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230334
5	NC_007595	TCAA	2	8	162	169	50 %	25 %	0 %	25 %	81230334
6	NC_007595	GCT	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230334
7	NC_007595	GATCGC	2	12	697	708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81230345
8	NC_007595	CTTGG	2	10	823	832	0 %	40 %	40 %	20 %	81230345
9	NC_007595	CGG	2	6	840	845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230345
10	NC_007595	CAG	2	6	863	868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230345
11	NC_007595	GGC	2	6	944	949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230345
12	NC_007595	GCATCG	2	12	960	971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81230345
13	NC_007595	ACC	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230345
14	NC_007595	AGCA	2	8	1073	1080	50 %	0 %	25 %	25 %	81230345
15	NC_007595	CCA	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230345
16	NC_007595	CG	3	6	1173	1178	0 %	0 %	50 %	50 %	81230345
17	NC_007595	CAC	2	6	1180	1185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230345
18	NC_007595	CGG	2	6	1240	1245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230345
19	NC_007595	CTGC	2	8	1263	1270	0 %	25 %	25 %	50 %	81230345
20	NC_007595	TGC	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
21	NC_007595	TTG	2	6	1363	1368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230356
22	NC_007595	GCT	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
23	NC_007595	CTCG	2	8	1442	1449	0 %	25 %	25 %	50 %	81230356
24	NC_007595	CAC	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230356
25	NC_007595	GACA	2	8	1467	1474	50 %	0 %	25 %	25 %	81230356
26	NC_007595	GCCT	2	8	1557	1564	0 %	25 %	25 %	50 %	81230356
27	NC_007595	GCT	2	6	1646	1651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
28	NC_007595	ACCA	2	8	1672	1679	50 %	0 %	0 %	50 %	81230356
29	NC_007595	GCG	2	6	1780	1785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230356
30	NC_007595	GCT	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
31	NC_007595	CA	3	6	2098	2103	50 %	0 %	0 %	50 %	81230367
32	NC_007595	CGC	2	6	2138	2143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230367
33	NC_007595	CTTG	2	8	2158	2165	0 %	50 %	25 %	25 %	81230367
34	NC_007595	CTG	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230367
35	NC_007595	CGT	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230367
36	NC_007595	TGA	2	6	2206	2211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230367
37	NC_007595	TCGC	2	8	2220	2227	0 %	25 %	25 %	50 %	81230367
38	NC_007595	ACC	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230378
39	NC_007595	GCA	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230378
40	NC_007595	CAA	3	9	2583	2591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81230378
41	NC_007595	TCC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230373
42	NC_007595	AAC	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81230373
43	NC_007595	CAG	2	6	2797	2802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230373
44	NC_007595	CAC	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230373
45	NC_007595	TTC	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230373
46	NC_007595	CT	3	6	2945	2950	0 %	50 %	0 %	50 %	81230373
47	NC_007595	AGC	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230373
48	NC_007595	TTG	2	6	3008	3013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230373
49	NC_007595	CTC	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230373
50	NC_007595	CGC	2	6	3196	3201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230380
51	NC_007595	CTC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230380
52	NC_007595	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230380
53	NC_007595	CCCG	2	8	3305	3312	0 %	0 %	25 %	75 %	81230380
54	NC_007595	CTG	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
55	NC_007595	AGC	2	6	3440	3445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230380
56	NC_007595	GCT	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
57	NC_007595	CCA	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230380
58	NC_007595	AGC	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230380
59	NC_007595	GA	3	6	3768	3773	50 %	0 %	50 %	0 %	81230380
60	NC_007595	TGGC	2	8	3837	3844	0 %	25 %	50 %	25 %	81230380
61	NC_007595	ATC	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230380
62	NC_007595	GAC	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230380
63	NC_007595	CTT	2	6	4050	4055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230380
64	NC_007595	GGT	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230380
65	NC_007595	CGAT	2	8	4262	4269	25 %	25 %	25 %	25 %	81230380
66	NC_007595	GTC	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
67	NC_007595	CAAAC	2	10	4305	4314	60 %	0 %	0 %	40 %	81230380
68	NC_007595	CCG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230380
69	NC_007595	TGA	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230380
70	NC_007595	TCA	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230380
71	NC_007595	CTG	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
72	NC_007595	GCTG	2	8	4560	4567	0 %	25 %	50 %	25 %	81230380
73	NC_007595	TGA	2	6	4580	4585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230380
74	NC_007595	CGG	2	6	4651	4656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230380
75	NC_007595	GGA	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230380
76	NC_007595	CTG	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
77	NC_007595	GTT	2	6	4953	4958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230380
78	NC_007595	ACGG	2	8	5018	5025	25 %	0 %	50 %	25 %	81230380
79	NC_007595	CGTC	2	8	5337	5344	0 %	25 %	25 %	50 %	81230381
80	NC_007595	GCAGGA	2	12	5496	5507	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	81230381
81	NC_007595	TGA	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230381
82	NC_007595	GAG	2	6	5579	5584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230381
83	NC_007595	CTC	2	6	5613	5618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230381
84	NC_007595	ATC	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230381
85	NC_007595	ATT	2	6	5767	5772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230381
86	NC_007595	CAG	2	6	5773	5778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230381
87	NC_007595	ACCA	2	8	6086	6093	50 %	0 %	0 %	50 %	81230381
88	NC_007595	G	6	6	6096	6101	0 %	0 %	100 %	0 %	81230381
89	NC_007595	GCA	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230381
90	NC_007595	CGAA	2	8	6320	6327	50 %	0 %	25 %	25 %	81230382
91	NC_007595	GCC	2	6	6383	6388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230382
92	NC_007595	CAC	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230382
93	NC_007595	TCA	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230382
94	NC_007595	CA	3	6	6569	6574	50 %	0 %	0 %	50 %	81230382
95	NC_007595	CAC	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230382
96	NC_007595	CCGTG	2	10	6595	6604	0 %	20 %	40 %	40 %	81230382
97	NC_007595	CCG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230382
98	NC_007595	AGC	2	6	6693	6698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230382
99	NC_007595	TGC	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230382
100	NC_007595	CTGA	2	8	6893	6900	25 %	25 %	25 %	25 %	81230382
101	NC_007595	CGAC	2	8	7027	7034	25 %	0 %	25 %	50 %	81230382
102	NC_007595	CAG	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230382
103	NC_007595	TGG	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230382
104	NC_007595	GCA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230383
105	NC_007595	TCCT	2	8	7420	7427	0 %	50 %	0 %	50 %	81230383
106	NC_007595	CTT	2	6	7458	7463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230383
107	NC_007595	ACAG	2	8	7619	7626	50 %	0 %	25 %	25 %	81230383
108	NC_007595	ATCG	2	8	7708	7715	25 %	25 %	25 %	25 %	81230383
109	NC_007595	CGC	2	6	7716	7721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230383
110	NC_007595	TCC	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230383
111	NC_007595	GTC	2	6	7748	7753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230383
112	NC_007595	CTG	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230383
113	NC_007595	CGC	2	6	7841	7846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230383
114	NC_007595	GCC	2	6	7901	7906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230383
115	NC_007595	TCAA	2	8	8018	8025	50 %	25 %	0 %	25 %	81230383
116	NC_007595	GCT	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230383
117	NC_007595	TAT	2	6	8202	8207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230383
118	NC_007595	A	6	6	8212	8217	100 %	0 %	0 %	0 %	81230383
119	NC_007595	ATG	3	9	8691	8699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
120	NC_007595	GAT	2	6	8702	8707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
121	NC_007595	GACG	2	8	8720	8727	25 %	0 %	50 %	25 %	81230335
122	NC_007595	GCG	2	6	8806	8811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230335
123	NC_007595	ATG	3	9	8826	8834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
124	NC_007595	ATG	2	6	8838	8843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
125	NC_007595	ATG	3	9	8880	8888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
126	NC_007595	TG	3	6	8887	8892	0 %	50 %	50 %	0 %	81230335
127	NC_007595	TGC	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230335
128	NC_007595	GAT	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
129	NC_007595	ATG	3	9	8982	8990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
130	NC_007595	TGA	2	6	9331	9336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230336
131	NC_007595	GA	3	6	9335	9340	50 %	0 %	50 %	0 %	81230336
132	NC_007595	TTGC	2	8	9371	9378	0 %	50 %	25 %	25 %	81230336
133	NC_007595	GCTGA	2	10	9399	9408	20 %	20 %	40 %	20 %	81230336
134	NC_007595	GAT	2	6	9519	9524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230336
135	NC_007595	AGTGGT	2	12	9542	9553	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	81230336
136	NC_007595	GCT	3	9	9554	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230336
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265	NC_007595	TCC	2	6	17970	17975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230346
266	NC_007595	TC	3	6	18034	18039	0 %	50 %	0 %	50 %	81230346
267	NC_007595	GCA	2	6	18081	18086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230346
268	NC_007595	T	6	6	18137	18142	0 %	100 %	0 %	0 %	81230346
269	NC_007595	TTCC	2	8	18192	18199	0 %	50 %	0 %	50 %	81230346
270	NC_007595	TGG	2	6	18246	18251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230346
271	NC_007595	ATT	2	6	18305	18310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230346
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273	NC_007595	CTT	2	6	18328	18333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230346
274	NC_007595	GCG	2	6	18395	18400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230346
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277	NC_007595	CTCGC	2	10	18573	18582	0 %	20 %	20 %	60 %	81230346
278	NC_007595	TTGG	2	8	18595	18602	0 %	50 %	50 %	0 %	81230346
279	NC_007595	GTA	2	6	18639	18644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230346
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281	NC_007595	ACC	2	6	18748	18753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230346
282	NC_007595	CGT	2	6	18768	18773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230347
283	NC_007595	CTG	2	6	18904	18909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230347
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288	NC_007595	CTG	2	6	19264	19269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230347
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294	NC_007595	CT	3	6	19534	19539	0 %	50 %	0 %	50 %	81230347
295	NC_007595	TCC	2	6	19591	19596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230348
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298	NC_007595	TAG	2	6	19714	19719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230348
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381	NC_007595	GCG	2	6	25653	25658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230352
382	NC_007595	GAT	2	6	25791	25796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230352
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385	NC_007595	CTG	2	6	25995	26000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230352
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389	NC_007595	CTGAC	2	10	26192	26201	20 %	20 %	20 %	40 %	81230352
390	NC_007595	AGC	2	6	26240	26245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230352
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392	NC_007595	CTG	2	6	26283	26288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230352
393	NC_007595	GCT	2	6	26513	26518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230352
394	NC_007595	CGCT	2	8	26532	26539	0 %	25 %	25 %	50 %	81230352
395	NC_007595	AAAC	2	8	26550	26557	75 %	0 %	0 %	25 %	81230352
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