MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_007516	TGA	2	6	2447950	2447955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214137
46502	NC_007516	GCCGT	2	10	2447983	2447992	0 %	20 %	40 %	40 %	78214137
46503	NC_007516	CGA	2	6	2448002	2448007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46504	NC_007516	TCCC	2	8	2448011	2448018	0 %	25 %	0 %	75 %	78214137
46505	NC_007516	CTG	2	6	2448021	2448026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46506	NC_007516	C	6	6	2448061	2448066	0 %	0 %	0 %	100 %	78214137
46507	NC_007516	GGC	2	6	2448177	2448182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214137
46508	NC_007516	GCA	2	6	2448196	2448201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46509	NC_007516	CCG	2	6	2448233	2448238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214137
46510	NC_007516	CGA	2	6	2448242	2448247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46511	NC_007516	TGC	2	6	2448313	2448318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46512	NC_007516	TCGCCA	2	12	2448331	2448342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78214137
46513	NC_007516	CGA	2	6	2448365	2448370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46514	NC_007516	GAT	2	6	2448398	2448403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214137
46515	NC_007516	CTA	2	6	2448407	2448412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214137
46516	NC_007516	GAG	2	6	2448420	2448425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214137
46517	NC_007516	ATC	2	6	2448429	2448434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214137
46518	NC_007516	ACCT	2	8	2448447	2448454	25 %	25 %	0 %	50 %	78214137
46519	NC_007516	TGG	2	6	2448505	2448510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214137
46520	NC_007516	CGG	2	6	2448530	2448535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214137
46521	NC_007516	TGC	2	6	2448709	2448714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46522	NC_007516	GCG	2	6	2448715	2448720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214137
46523	NC_007516	TGG	2	6	2448778	2448783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214137
46524	NC_007516	GCG	2	6	2448799	2448804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214137
46525	NC_007516	TCG	2	6	2448823	2448828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214137
46526	NC_007516	GCA	2	6	2448843	2448848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214137
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46528	NC_007516	GTGA	2	8	2448953	2448960	25 %	25 %	50 %	0 %	78214138
46529	NC_007516	TCC	2	6	2448979	2448984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214138
46530	NC_007516	TGG	2	6	2449011	2449016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214138
46531	NC_007516	GGT	2	6	2449075	2449080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214138
46532	NC_007516	CTG	2	6	2449088	2449093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214138
46533	NC_007516	GCA	2	6	2449101	2449106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214138
46534	NC_007516	CAC	2	6	2449174	2449179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214138
46535	NC_007516	GAC	2	6	2449223	2449228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214138
46536	NC_007516	ATC	2	6	2449268	2449273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214138
46537	NC_007516	CGC	2	6	2449274	2449279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214138
46538	NC_007516	ACC	2	6	2449310	2449315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214138
46539	NC_007516	TCAG	2	8	2449341	2449348	25 %	25 %	25 %	25 %	78214138
46540	NC_007516	CTG	3	9	2449409	2449417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214138
46541	NC_007516	GCG	2	6	2449437	2449442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214138
46542	NC_007516	GCA	2	6	2449513	2449518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214138
46543	NC_007516	TGC	2	6	2449551	2449556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214138
46544	NC_007516	CTCG	2	8	2449572	2449579	0 %	25 %	25 %	50 %	78214138
46545	NC_007516	AC	3	6	2449644	2449649	50 %	0 %	0 %	50 %	78214138
46546	NC_007516	CAG	2	6	2449754	2449759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214138
46547	NC_007516	CAAC	2	8	2449765	2449772	50 %	0 %	0 %	50 %	78214138
46548	NC_007516	TGG	2	6	2449946	2449951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214139
46549	NC_007516	TCAGC	2	10	2449956	2449965	20 %	20 %	20 %	40 %	78214139
46550	NC_007516	TGC	2	6	2449967	2449972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214139
46551	NC_007516	TGG	2	6	2449997	2450002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214139
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46553	NC_007516	GCA	2	6	2450042	2450047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214139
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46555	NC_007516	CAC	2	6	2450096	2450101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214139
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46558	NC_007516	GCA	2	6	2450252	2450257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214139
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46561	NC_007516	CCCG	2	8	2450434	2450441	0 %	0 %	25 %	75 %	78214139
46562	NC_007516	GCA	2	6	2450463	2450468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214139
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46566	NC_007516	AACA	2	8	2450649	2450656	75 %	0 %	0 %	25 %	78214139
46567	NC_007516	CA	3	6	2450714	2450719	50 %	0 %	0 %	50 %	78214139
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46582	NC_007516	A	6	6	2451163	2451168	100 %	0 %	0 %	0 %	78214140
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46585	NC_007516	GCG	2	6	2451338	2451343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214141
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46587	NC_007516	CGC	2	6	2451377	2451382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214141
46588	NC_007516	CAGG	2	8	2451463	2451470	25 %	0 %	50 %	25 %	78214141
46589	NC_007516	CCA	2	6	2451645	2451650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214141
46590	NC_007516	GCC	2	6	2451656	2451661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214141
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46593	NC_007516	TTGAGC	2	12	2451803	2451814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78214141
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46598	NC_007516	CGCC	2	8	2451991	2451998	0 %	0 %	25 %	75 %	78214141
46599	NC_007516	ACA	2	6	2452011	2452016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214141
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46607	NC_007516	CCAA	2	8	2452427	2452434	50 %	0 %	0 %	50 %	78214142
46608	NC_007516	TCCA	2	8	2452435	2452442	25 %	25 %	0 %	50 %	78214142
46609	NC_007516	CTGC	2	8	2452550	2452557	0 %	25 %	25 %	50 %	78214142
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46615	NC_007516	GAC	2	6	2452763	2452768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214142
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46617	NC_007516	ACC	2	6	2452830	2452835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214142
46618	NC_007516	GCT	2	6	2452878	2452883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214142
46619	NC_007516	CAAA	2	8	2452896	2452903	75 %	0 %	0 %	25 %	78214142
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46721	NC_007516	ATGG	2	8	2457627	2457634	25 %	25 %	50 %	0 %	78214146
46722	NC_007516	T	6	6	2457740	2457745	0 %	100 %	0 %	0 %	78214146
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46730	NC_007516	GGCCT	2	10	2458182	2458191	0 %	20 %	40 %	40 %	78214148
46731	NC_007516	GC	3	6	2458209	2458214	0 %	0 %	50 %	50 %	78214148
46732	NC_007516	GCA	2	6	2458224	2458229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214148
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46838	NC_007516	GCAGC	2	10	2463017	2463026	20 %	0 %	40 %	40 %	78214154
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46842	NC_007516	GCT	2	6	2463197	2463202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214154
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46845	NC_007516	TGA	2	6	2463517	2463522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214155
46846	NC_007516	TCACC	2	10	2463527	2463536	20 %	20 %	0 %	60 %	78214155
46847	NC_007516	CAC	2	6	2463537	2463542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214155
46848	NC_007516	CTCGG	2	10	2463567	2463576	0 %	20 %	40 %	40 %	78214155
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46968	NC_007516	GCA	2	6	2471333	2471338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46969	NC_007516	GCT	2	6	2471386	2471391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46970	NC_007516	GCC	3	9	2471550	2471558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214163
46971	NC_007516	CGT	2	6	2471587	2471592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46972	NC_007516	CTG	2	6	2471645	2471650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46973	NC_007516	CTG	2	6	2471654	2471659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46974	NC_007516	GCA	2	6	2471705	2471710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46975	NC_007516	CAGC	2	8	2471712	2471719	25 %	0 %	25 %	50 %	78214163
46976	NC_007516	CTC	2	6	2471739	2471744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214163
46977	NC_007516	TGG	2	6	2471892	2471897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214163
46978	NC_007516	CTG	2	6	2471906	2471911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46979	NC_007516	TGA	2	6	2471994	2471999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214163
46980	NC_007516	T	6	6	2472028	2472033	0 %	100 %	0 %	0 %	78214163
46981	NC_007516	CTT	2	6	2472037	2472042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214163
46982	NC_007516	CCA	2	6	2472117	2472122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214163
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46984	NC_007516	GTC	2	6	2472143	2472148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46985	NC_007516	GTG	2	6	2472155	2472160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214163
46986	NC_007516	AGG	2	6	2472163	2472168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214163
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46988	NC_007516	CTG	2	6	2472248	2472253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46989	NC_007516	CCG	2	6	2472297	2472302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214163
46990	NC_007516	CTG	2	6	2472467	2472472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46991	NC_007516	TGCGGC	2	12	2472490	2472501	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78214163
46992	NC_007516	TGC	2	6	2472507	2472512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214163
46993	NC_007516	AC	3	6	2472561	2472566	50 %	0 %	0 %	50 %	78214163
46994	NC_007516	CCAG	2	8	2472570	2472577	25 %	0 %	25 %	50 %	78214163
46995	NC_007516	GCA	2	6	2472635	2472640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214164
46996	NC_007516	GAGCT	2	10	2472671	2472680	20 %	20 %	40 %	20 %	78214164
46997	NC_007516	CAA	2	6	2472769	2472774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214164
46998	NC_007516	CGA	2	6	2472778	2472783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214164
46999	NC_007516	TTC	2	6	2472785	2472790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214164
47000	NC_007516	GGCG	2	8	2472826	2472833	0 %	0 %	75 %	25 %	78214164

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